כאשר מעשה חבלה מחריב פסגה של נציגי ג'אפה, טיאלק יוצא בחיפוש אחר נקמה, מתוך אמונה שהפושע הוא אחד מתלמידיו, גם אם זה אומר לעזוב את מפקדת הסטארגייט ולצאת כנגד ס"ג-1.

ניסוי שהשתבש מושך את סמנתה קרטר למציאות מקבילה, שם היא חייבת להציל את כדור הארץ מפני מתקפה של האוריי לפני שהיא תורשה לחזור הביתה למציאות שלה.

כאשר ס"ג-1 מגלים כי דניאל ג'קסון הפך לנזיר של האוריי, הם חייבים לקבוע האם התוכנית שלו להשמיד את האוריי היא אמיתית או שמא הכל חלק ממזימה של אדריה.

כאשר הצוות מוצא את מרלין בכבודו ובעצמו, עליהם לסייע לו להשלים את בניית הסנגראל לפני שאדריה וכוחותיהם של האוריי יוכלו לאתר אותם.

ס"ג-1 נמצאים במירוץ נגד בעל בחיפוש אחר הסנגראל, נשקו של מרלין נגד האוריי, ונתקלים בסדרה של ניסויים עתיקים.

הג'אפה לוקחים את הקרב אל אוריי, באמצעות נשק רצחני ובעל הרס על גבי ספינות המלחמה החדשות שלהם כשהם מנחיתים את ס"ג-1 לתוך מלחמה בה הם לא יכולים לשלוט.

הצוות מסתבך בצרות במהלך חיפושיו אחר נשק שיאפשר להם להתמודד עם האוריי. ואלה עוברת הערכה פסיכיאטרית, שתוצאותיה משעשעות למדי.

קרטר ואורלין מחפשים בקדחתנות תרופה למגיפה, טיאלק וברייטק מנסים למנוע את כניעת הג'אפה לאוריי, שהפכו את ראש המועצה לכוהן. מיטצ'ל וג'קסון נערכים בעזרת הסודאן לניסוי הנשק החדש שאמור לבלום את…

כשקצין ס"ג שנדבק בוירוס חוזר לכדור הארץ, ארה"ב נדבקת בוירוס תוך זמן קצר. אורלין, שלא מעוניין ש-"שביל החלב" יפול לידי האוריי, חוזר להיות אדם רגיל על מנת לעזור לקרטר למצוא…

ואלה ודניאל ג'קסון מועברים אל גופם של שני אנשים בגלקסיה רחוקה, שנמצאת על כוכב המאוכלס ע"י אנשים הסוגדים ליישות מוזרה.

קמרון מיטשל מגיע למפקדת הסטארגייט כחבר החדש בצוות ס"ג-1 ומגלה שהצוות התפרק. כשוואלה מגיעה לכדה"א עם רמזים לשרידים של הקדמונים, מיטשל מחליט שהדבר יסייע לאחד את הצוות.

בעוד דניאל מוצא את עצמו במסעדה מסתורית, תלוי בין המוות לעלייתו, גורלו של ג'ייקוב מרחף באופן בלתי צפוי, ג'ק וסאם רואים את חייהם הרומנטיים, ואנוביס משחרר את תוכניתו להרס גלקטי.

ג'ו, ספר עצבני, פורץ לביתו של אוניל ומאשים אותו בהרס חייו. משום מה ג'ו יודע הכל על הרפתקאות ס"ג-1, הרפתקאות שבתחילה הוא העלה על הכתב וניסה לפרסם כשלו, אך כעת…

עוד מזימה של הגאולד נחשפת כאשר סגן הנשיא המודח קינסי בא אל אוניל ומזהיר אותו מפני שותפיו לשעבר, אנשי "הנאמנות". הוא מציע לשתף עמו פעולה במאבק נגדם.

גנרל האמונד מגיע לפיקוד ומכריז על החלטתו להעביר את דניאל למפקדת משימת אטלנטיס. השניים אמורים לטוס ב-"פרומתיאוס" לאטלנטיס כדי לברר למה אבד הקשר עם המשלחת.

רייאק מאוהב באחת מהאמזונות של אישטה. כעת אוניל מוצא את עצמו מעורב בהכנות לטקס חתונה נוסח ג'אפה, כולל כלה דעתנית ופמיניסטית, מריבות בין המחותנים, טקסים מסורתיים מעצבנים ומה לא…

בעוד הגאולד מאיימים לתקוף את כדור הארץ, ס"ג-1 והאסגרד נערכים למוצא האחרון והנואש נגד המשכפלים, אשר חטפו את מייג'ור קרטר ופלשו למאחז הציוויליזציה האחרון של האסגרד.

קרטר וטיאלק יוצאים לחפש את האסגרד כדי לנסות להציל את קולונל אוניל, אך מגלים שאויבם המושבע של האסגרד חזר בבמלוא העוצמה. אדוני המערכת מחפשים ברית עם כדה"א נגד אויב משותף.

צוות ס"ג-1 נשלח למשימת חילוץ באחד מכוכבי הלכת, והמבצע גובה קורבנות. בעוד חברי הצוות מנסים להתמודד עם תוצאות המבצע, צוות הצילום מנסה לחשוף את האמת על מה שאירע.

הממשל שולח צוות צילום לתעד את הנעשה בתוך מפקדת הסטארגייט למען שימוש עתידי כאשר התכנית תיחשף לציבור. חברי צוות הצילום מגלים כי לא כל אנשי הצוות מוכנים לשתף איתם פעולה.

קרטר מצטרפת למכר וותיק, טייס מכוכב אחר, כדי לעזור לו לנצח במירוץ חלל. לאחר שהמירוץ מתחיל, מגלים שאר חברי צוות ס"ג-1 כי המפסידים עלולים להפסיד יותר ממה שהם חושבים.

הצוות מוצא ספינה שהתרסקה על כוכב אחר, אך המאמצים שלהם לסייע לתיקוני הספינה מופרעים על ידי קבוצה של חייזרים.

הצוות נקרא לקרב באופן בלתי צפוי כאשר עולם הבית של האסגרד מוצף על ידי משכפלים – אשר התפתחו לצורה חדשה ומדהימה.

עולם זר מציע לכדור הארץ תרופה עם הכוח לרפא כל מחלה – אבל המחיר הנסתר עשוי להיות גבוה מדי לשלם.

כדור הארץ מוצא את עצמו מאוים על ידי משהו גדול הרבה יותר מהגאולד כאשר הצוות לומד כי יש אסטרואיד במסלול התנגשות עם הכוכב.

ס"ג-1 מאמנים צוות של צוערים, וקולונל אוניל נאלץ לקחת אותם איתו למצב קרב אמיתי כאשר הוא לומד על פלישה זרה אפשרית במפקדת הסטארגייט.

עשר שנים לתוך העתיד וחבריו לשעבר של צוות ס"ג-1 חייבים לשלוח מסר אל העבר כדי למנוע את הכחדתו של המין האנושי מידיי בעלי בריתם הנדיבים, אנשי האסשן.

כאשר מורו לשעבר מת בעקבות מה שנדמה כמו קללה מצרית עתיקה, חוזר ד"ר ג'קסון לשורשיו ולחברים שהשאיר מאחור – ומגלה חפץ מצרי עתיק המכיל טפיל גאולד.

ס"ג-1 חוזרים ממשימה ומגלים כי חייזרים משני-צורה השתלטו על מפקדת הסטארגייט ומתחזים לאנשיו. קרטר, שמצליחה להימלט, חייבת לשכנע את חיל האוויר שמדובר במצב פלישה אמיתי.

פעילות שלאחר שעות הלימודים מפגישה בין אבי לטרייס. קונור מבקש את עצת המשפחה. לשרה ולקווין יש חדשות מפתיעות.

מחשבותיה של ברי טרודות בחיי האהבה שלה. שרה וקווין מתוודעים לצד המעיק של תכנון חתונה. אבי מתרגלת למציאות החדשה וזוכה להפתעה נעימה.

פרק סיום העונה. טרייס שוקל הצעה שעשויות להיות לה השלכות לגבי הקריירה שלו – ועל חייו המשותפים עם אבי. ג׳ס מגלה סוף סוף מה דיוויד מסתיר.

ג׳ס עושה טעות גדולה בעת שהיא מוכרת בחנות הספרים, קרע מתגלע בין טרייס לבין הלהקה שלו בנוגע לתוכניות לעתיד, והמשפחה חוגגת את יום הולדתה העשירי של קארי.