הדיקן פוג ופרופסור ליפסון במרוץ נגד הזמן למציאת מרפא למחלה בה לקה פני במסעו ל"חדר הרעל", בעוד שקוונטין וג'וליה, שמסתגלת לצל שזה עתה הושב אליה, יוצאים במסע חיפוש אחר המבר…

לאחר שג'וליה מקריבה הקרבה מפתיעה למען קוונטין, הוא מנצל את ההזדמנות לטובתה של אליס, לפחות כך נדמה לו. אליוט מנסה למצוא את דרכו חזרה אל פילורי כדי להציל את ממלכתו,…

קוונטין ממשיך במסע החיפוש בניסיון לשחרר את נשמתה של אליס. בינתיים, בזמן שג'וליה וקיידי מחפשות דרך לגרש את עובר השד של ריינארד מג'וליה, הן הוגות תוכנית נועזת וחריגה בכדי לממן…

קוונטין, אליס, פני ומרגו מחפשים נשק חדש. אליוט נאבק עם תפקידו כמלך. ג'וליה והיצור מוצאים בעלת ברית לא צפויה.

על רקע החורבן שהותיר העימות שלהם עם היצור, קוונטין וחבריו מגששים אחר תוכנית חדשה, בעוד שג'וליה והיצור סוגרים ביניהם עסקה מסוכנת.

החבורה מתחילה לראות חזיונות של אנשים מן העבר שלהם, בעוד נדמה שהעיר מתמוטטת סביבם. בינתיים, ד"ר גרנט מתערב עם סיעה מסתורית.

בלבול אופף את תהליך שחזור החומרים ששימשו ליצירת מחולל הפלזמה. בינתיים, שיבוט של קים עשוי להיות הגורם לבעיות גדולות יותר.

צ'אק עדיין מלקק את פצעיו לאחר שהוא מבין שלשרה יש רגשות כלפי ברייס. צ'אק חייב להסתוות כבעלה של שרה במשימה לעצור זייפן ובעל יאכטה המקושר פוליטית. צ'אק, שרה וקייסי יוצאים…

בפרק האחרון לסדרה, פינץ', ריס, פוסקו ושו יוצאים למשימה אחת אחרונה כדי למנוע מ-"השומרוני" להשמיד את המכונה ולבסס את שליטתה במין האנושי.

שרון בורחת, אבל הצוות לא בטוח במצבה הנפשי כשהיא מתחילה להתנהג בפרנואידיות ובפזיזות. עם זאת, הם ממשיכים לחפש אחר מתג הכיבוי של ה-"שומרוני".

לאחר החזרת המכונה לפעולה, מתגלים כל מיני באגים, ביניהם שגיאה בזיהוי פנים, והמכונה מזהה את הרולד, רוט וג'ון כאיומים בגלל חלק ממעשיהם בעבר, מה שמוביל לסכנות בלתי צפויות.

עונה חמישית ואחרונה לסדרת המתח מבית היוצר של ג'יי ג'יי אברהמס. בעקבות האירועים האחרונים, הצוות חייב למצוא דרך להמשיך להציל חיים בזמן שהם מנסים לתקן את התקלה ולהשיב מלחמה כנגד…

פרק 22 ואחרון לעונה. פינץ' ורוט ממהרים להציל את המכונה שאותרה על ידי השומרוני, ואילו ריס נקלע לקרב אחרון בין הפושעים היריבים אליאס ודומיניק.

ריס ופינץ' מנסים להגן על פסיכולוג לא שגרתי. פלאשבקים לעבר חושפים את מצבו השברירי של פינץ' בימים שלאחר מותו של אינגרם.

השומרוני משיקה מתקפת סייבר בבורסה, שמאלצת את הצוות לסכן את חייהם במשימה נואשת לעצור אסון גלובלי.

משטרת ניו-יורק חוקרת ירי בין כנופיות, ובאירוע מעורבים אח ואחות צעירים הנמצאים תחת הגנתו של ריס. משימת הכיסוי שלו כבלש מוטלת בסכנה.

למרות שאינו רוצה לעזור עם המספרים החדשים, העניין של פינץ' מתעורר כאשר המספר החדש מתברר להיות סטודנט מבריק המעורב בציד נבלות מסתורי.

פרק סיום העונה. בזמן ש-"דסימה" מתכוננים להפעיל את ה-"שומרוני", הצוות מוצא את עצמו בין הפטיש לסדן כשהארגון מנסה לחסל אותם ובמקביל "ויג'ילנס" מנסים לשים קץ לריגול הממשלתי.

כוח מסתורי מפריע למכונה לחזות אירוע קטלני במלואו, והמכונה שולחת לצוות חמישה מספרים שונים לחקור. בינתיים, צוות ההאקרים של רוט מגיע לניו-יורק.

ריס וליונל ממלאים את צוואתה של קרטר ומסגירים את ראשי ארגון אייץ'-אר, במקום לקחת את החוק לידיים.

הסוכנים פינץ וריס ממשיכים לפעול למעצרם של מבוקשים. בפתח העונה, פרשה של מלח שמזכיר לריס את עצמו, לוחם מצוין שעושה הכל למען חבר. יש גם חברה חדשה בצוות: שו, שיורה…

אדם המוכר בתחום הרפואי מורעל, ופינץ' וריס חייבים לעבוד מהר כדי להגיע אל מקור הרעל ולמצוא את התוקף. בינתיים, מידע חדש מתקבל לגבי הבלש פוסקו.

הפעם המספר שעולה בגורל הוא גאון מחשבים מיליארדר שמראה לפינץ' שיש לו מתחרים בעלי אינטלקט חריף לא פחות משלו.

האם עברו של ג'ון ריס חוזר לרדוף אותו? דונלי, השוטר העקשן, עולה על עקבותיהם של קרטר ושל ריס וחושף את שיתוף הפעולה ביניהם. המשך הפעילות של הקבוצה נתון בסכנה.

בזמן שריס ופינץ' מחפשים אחר המבוקש הבא שלהם, נער שאחיו נרצח, פינץ' חושש כי בנו של שותפו המת מתקרב יתר על המידה לחשיפת האמת על המכונה.

אלכס וקארה מגלות איך האנק הגיע לדי-אי-או ולומדות על הקשר בינו לבין אביהן. קארה מתקשה להתמודד עם סופרגירל המרושעת ומתחילה לזלול בלי שליטה.

לאחר מרדף במהירות גבוהה, הצוות מגלה גילוי מחריד. צ'ין הו וארוסתו לשעבר מתאחדים בצורה מביכה.