ברנן יוצאת לניו אורלינס כדי לזהות קורבנות של ההוריקן קתרינה. היא מתעוררת בבוקר שלמחרת בבית המלון, כשהיא מוכה וחבולה ואינה זוכרת דבר. בות' נחלץ לעזרתה.

בונז ובות' חוקרים זהות גופה שנרקבה לחלוטין ושהתגלתה בסמטה לבושת בגדים לא שגרתיים. כאשר החקירה מעמיקה, הם מגלים שהיתה זו נערה מתבגרת, אשר ניהלה חיים כפולים.

ליאו חוזר לסן פרנסיסקו ומבקש מהאחיות להגן על בחורה שנמצאת על הכוונת של מאיר שחור; אנדי מתפטר מעבודתו כדי שזהותה של פרו לא תיחשף בחקירה שמתנהלת נגדו במשטרה.

גופתה של נערה נמצאה בבית הקברות, מוכנה להיקבר עם צלב בידה. דני חוקר את המקרה ומשוחח עם אביה, הטוען שבתו הייתה קתולית אדוקה, אך ככל הנראה הנערה שמרה סודות מאביה.

ארין מתקשה לסגור מקרה רצח כאשר עד המפתח שלה נהרג. ארין מקבלת הזדמנות לעבוד עם פרנק כשמוצעת לה משרה כסגנית ראש העיר.

גופת מלח שעובד במודיעין של הצי נמצאת בפח האשפה, והצוות יוצא למרוץ נגד הזמן כדי לאתר את הרוצח שלו, שמחזיק במחשב מסווג.

מאמן של ספורטאים בכירים בצי נמצא ללא רוח חיים, והצוות מנסה להבין מי ירצה להרוג אותו. פרקר מביא גישה חדשה כמנהיג הצוות, והחוקרים מתייחסים אליה בחשדנות.

בעקבות ראיות שמתגלות בזירת רצח של סמל בחיל הנחתים, הסוכן טורס פוגש את אביו מיגל, שעזב את המשפחה כשהיה ילד. גיבס מתקשה להסתגל לחוסר המעש בבית.

היחידה חוקרת רצח של מלח שנורה כשהסיע אסיר משוחרר טרי מהכלא. גיבס עוזר לפאלמר להתמודד עם האבל שלו.

פרק סיום העונה. במהלך חקירה של פריצה לבית של אלוף בחיל הים, הצוות נתקל בקשיש שגנב מדליה יקרה לאלוף כדי להבטיח את קבורתו על ה-"אריזונה", ספינה שנפגעה בהתקפה הגדולה על…

גיבס והצוות עוזרים לזיווה ב"דבר היחיד" שהיא אמרה שעליה לעשות לפני שתוכל לשוב למשפחתה.

קייסי מפענחת תיק רצח בן 30 שנה, אבל פרט טכני משבש הכול. מקגי מבקר בחברת הייטק גדולה שמציעה לו משרה בשכר גבוה מאוד.

החופשה של גיבס ביער נקטעת אחרי שפורנל וברוקס מחליטים לבוא לבקר והצוות מיידע אותו על חשוד שמסתובב בקרבת מקום.

חיילת ותיקה דורשת מחוקרי אן-סי-איי-אס להחליף את המשטרה המדינית בחקירת רצח אמה, חיילת ותיקה אף היא, שנרצחה בביתה כשנה קודם לכן, אך רוצחה לא נמצא מעולם.

קברנים מגלים גופת גבר בלתי מזוהה שנקברה עם גופתה של קשישה באותו ארון הקבורה. כשמתברר שהגופה היא של סגן בחיל הים, חוקרי אן-סי-איי-אס פותחים בחקירת רצח.

חתונתם של מגי ודלילה הולכת וקרבה והם חשים בלחץ. בעקבות כך, מחישים את דלילה לבית החולים. חברי הצוות מפליגים כדי לחקור את מקרה מותו של מש"ק בריא על סיפון משחתת.

לאחר שחייל בחיל הנחתים נמצא מת שעות ספורות לאחר שהתקשר לגיבס בנוגע למקרה חדש, בישופ ומק'גי מתחזים לזוג נשוי ועוקבים אחר קצין בנחתים ואישתו.

גיבס והצוות יחד עם הסוכן פורנל יוצאים למצוד אחר אמריקני שהצטרף לארגון טרור בסוריה ושב כעת לאדמת ארה"ב.

המנהל ואנס שולח את דינוזו למשימה מיוחדת להחזיר הביתה בת של אדמירל מצרפת, אבל עליו להיעזר בחבריו לצוות לאחר שהוא מואשם ברצח.

לאחר שגופתו של חבר הקונגרס דן מקליין, סוכן אן-איי-אס לשעבר, נמצאת לחוף הנהר בניו אורלינס, גיבס חובר לעמיתו לשעבר, הסוכן המיוחד דווין קסיוס פרייד, לחקירה משולבת.

כשמתגלה שמל"ט שנגנב קשור למחבל החמקמק פרסה, צוות אן-סי-איי-אס חובר למשרד ההגנה בתיאום עם חברתו לשעבר של גיבס, הוליס מאן, כדי לאתר את המל"ט לפני שיעשה בו שימוש בקנה מידה…

טוני מגיע לישראל, נחוש לגלות מה עלה בגורלה של זיווה. בינתיים, גיבס והצוות ממשיכים במרדף אחר פרסה ורשת הטרור המתרחבת שלו.

טוני וזיוה סובלים מחבלות קלות בעקבות תאונת הדרכים בה היו מעורבים. הצוות ממשיך לחפש את רוצח אביה של זיווה ואשתו של ואנס, הם מאתרים אותו, וזיוה זוכה לנקמה לה חיכתה.

הספר של גיבס מבקש ממנו לחקור את בנו בקשר לאישה צעירה שנהרגה לאחרונה. הוא חושש כי בנו עלול להיות הרוצח הסדרתי שרצח שלוש נשים בשבועות האחרונים.

הצוות חוקר את חטיפתה של נערה מתבגרת, בזמן שזיוה ואבי חוברות כדי להגן על חבר שהיה עד לחטיפה. גיבס מחפש עוד מידע באמצעות קשרים מן העבר.

כאשר מכשיר ציטוט נמצא בשן של נד דורנגט, הצוות עושה הכל כדי לעצור את הארפר דירינג.

מטוס תובלה ב-130 המוביל גופות של חיילים שנהרגו באפגניסטן מתרסק, והצוות חייב לזהות במהירות את הגופות.

חייל מארינס בשם תומאס היל מתמוטט במסיבת חזרתו הביתה, לאחר שסומם ונדקר טרם הגעתו. הצוות חוקר מי אחראי לעניין.

קצין נמצא מת על סירתו, כשהסימנים מראים שככל הנראה נרצח. חברי הצוות פותחים בחקירת המקרה.

הצוות חוקר את היעלמותו של קצין בצי, שהוא העד היחיד במשפט רצח העומד להיפתח.

גיבס משתמש בהולי סנואו בכדי לחקור מקרה רצח בעולם נערות הליווי.

הצוות מוצא עצמו במירוץ נגד הזמן כשארגון טרור מאיים להפיל פצצות בכל אזור וושינגטון.

כאשר רופא נרצח, המפקח ואנס מופיע בזירת הפשע וטוען כי ראה כבר מקרה רצח דומה בעבר.

עם הגעתו של סוכן המוסד מיכאל ריבקין, טוני נאלץ לחקור את נאמנותה של זיוה ל-אן-סי-איי-אס. בינתיים בלוס אנג'לס, הסוכן המיוחד קיילן עובד במסווה בנסיון ללכוד את חברי תא הטרור הרדום.

במהלך חקירת מותו של מלח, דאקי מותקף בידי צופה מהצד, באותו כלי נשק ששימש לביצוע הפשע המקורי.

גיבס שולח את דינוזו ואת זיוה לנסות ולפרוץ למתקן צבאי סודי, בטענה כי זהו מבחן לבדיקת המיגון והאבטחה של המתקן.

זיווה יוצאת למשימה תחת זהות בדויה, אך חייה נתונים בסכנה כאשר הרוצח שהצוות עוקב אחריו מתחיל לחשוד בה.

שיחה אנונימית שהייתה אמורה להוביל לתפיסתם של טרוריסטים מתבררת כמלכודת, וגורמת למותם של שני סוכנים. הצוות מנסה לאתר את האחראים, בעזרתה של סוכנת המאשימה את עצמה בטרגדיה.

קבר בבית קברות צבאי מתפוצץ, ובתוכו חלקי גופות. הצוות יוצא לחפש אחר רוצח סדרתי שאוהב לבתר את קורבנותיו. בינתיים, אבי מתמודדת עם אכזבה אישית, ונפתחת רק בפני גיבס.