פרק ה-200, אשר כולל בין היתר מחוות לקלאסיקות קולנועיות ("הקוסם מארץ עוץ") וסדרות הז'אנר ("פארסקייפ", "מסע בין כוכבים"), בהופעת אורח מיוחדת של ריצ'ארד דין אנדרסון.

פרק אחרון לעונה. נמצא שער-העל של האוריי ואנשי הצוות ובעלי בריתם יוצאים לנסות להשמידו. דניאל ומיטשל מנסים לחפש את הנשק שפיתח מרלין. הקרב המכריע על עתיד הגלקסיה מתחיל שוב.

גילויו של ג'אפה מת בכדור הארץ חושף מזימה של שרידי הנאמנות, שמסתבר כי עודנה חיה וקיימת ונתונה לשליטתו של בעל, שאף הוא עודנו חי. מכאן ואילך העניינים מסתבכים.

תעשיין מיליארדר טוען שבידיו ראיות כי האסון שבו הושמדה נושאת מטוסים לא נגרם ממטר מטאורים אלא מהתקפת חייזרים והוא מאיים לפרסם את הראיות. קרטר נשלחת לשכנע אותו לחזור בו.

ניסוי משתבש ויוצא מכלל שליטה, וטיאלק מוצא את עצמו שבוי בעולם וירטואלי שבו הוא נאלץ להתמודד מול התקפה כוללת של חיילי-על כשכל פגיעה בעולם הווירטואלי מורגשת בגופו ומקרבת אותו אל…

אנוביס מתחיל מתקפה שיטתית על כדור הארץ, וכעת תקוותו היחידה של כדור הארץ לישועה תלויה בס"ג-1 וביכולתם למצוא את העיר האבודה המיתולוגית.

אוניל עושה מאמצים רבים כדי למנוע מהידע של קדמונים ליפול לידיי הגאולד כאשר הצוות מגלה מאגר מידע שני. הנשיא מחליף את הגנרל האמונד בדיפלומט אזרחי.

קולונל ג'ק אוניל מוביל צוות דרך הסטארגייט לגלקסיות אחרות, בניסיון להציל את כדור הארץ מהשמדה, לאחר שמאגר חדש של נאקוודה החל לעבור מוטציה לנאקוודריה.

פלג'ר יוצר וירוס שמטרתו לחבל בשערים של האויבים, אך מפיל את כל מערכת השערים. קרטר והמדענים במפקדת הסטארגייט חייבים לתקן את מערכת השערים לפני שהאויב ינצל את המצב.

על כוכב לכת אפוף באוויר רעיל, הצוות מגיע לבועה אשר יש בה עולם ומלואו – בועה זו מגינה כבר מאות שנים על אנשי הכוכב. חשדות הצוות מתעוררים כאשר אנשים שהם…

ההנהגה מעולמו של ג'ונאס מגיעה לכדה"א בבקשה לסיוע – ספינתו של אנוביס נמצאת מעל כוכב הלכת בגלל את הנאקוודריה המצויה בעולמם. על מנת לנצח את הקרב הזה יש לשתף פעולה…

ס"ג-1 מופתעים למצוא את דניאל ג'קסון חי ושלם, אך ללא הזיכרון שלו. אוניל משכנע אותו לחזור איתם אל מפקדת הסטארגייט, שם הוא מצטרף למשימה נועזת להרוס את הנשק החדש של…

בפרק האחרון לעונה, ס"ג-1 נקראים להגן על אנשי אבידוס מן הגאולד בשנית כאשר הם לומדים כי אנוביס, בחיפוש אחר מכשיר רב עוצמה, עומד לתקוף.

מקרה של כמעט מוות גורם לטיאלק לדמיין את חייו שונים מאוד מזה שהוא מכיר, חיים בהם הוא אדם נורמלי החי על כדור-הארץ – עד שהוא לא מצליח להבחין יותר בין…

כאשר צוות ס"ג-1 נתפסים על ידי הגאולד, זוג מדענים שלומיאלים יוצא למבצע הצלה… בין אם הם רוצים או לא.

אוניל נלכד ומעונה שוב ושוב על ידי הגאולד בעל, בנסיון לדלות מידע משיתופן הטוקרה שלו, אך אוניל אינו מצליח לזכור. כעת עליו להסתמך על ידיד ותיק שיעזור לו להישאר בחיים.

ס"ג-1 חוקרים את גילויה של אישה קפואה בקרח באנטארקטיקה, אשר עשויה להיות קשורה אל בוני השער. אך במקביל, מחלה מסתורית מאיימת להרוג את כולם בבסיס המחקר.

טרגדיה מפגישה את טיאלק יחד עם בנו, שמאשים אותו על מות אימו. אוניל וקרטר מוציאים לפועל תוכנית מסוכנת עם טכנולוגיה שלא נבדקה כאשר כדור-הארץ מותקף על ידי הגאולד.

קרטר חייב למצוא דרך להציל את כדור-הארץ מהרס מוחלט על ידי-הגאולד, שהפכו את הסטארגייט לפצצת יום הדין. בעוד רייאק מצטרף לאביו במשימה להרוס את כלי הנשק שברשותם של הגאולד.

בפרק האחרון לעונה, ס"ג-1 חייבים לבוא להציל את בעלי בריתם פעם נוספת כאשר הגאולד תוקפים מעבדת אסגרד סודית.

ס"ג-1 פוגשים אישה צעירה עם היכולת לשלוט במשכפלים, ומי שיכולה להחזיק את המפתח לישועה של האסגרד.

משימתו החשאית של ד"ר ג'קסון להסתנן לפסגה של הגאולד מסתבכת עם בואו של אורח מפתיע. שאר הצוות עומד בפני הפלישה בהיקף מלא על עולם הבית של טוקרה.

המלחמה בין הטוקרה לגאולד מסלימה, והסיעה המורדת שולחת את דניאל ג'קסון לפגישה סודית בין אדוני המערכת.

ס"ג-1 מגלים חברה המשתמשת באונאסים כעובדי כפייה, ומנסים לשחרר את ידידו של דניאל, צ'אקה.

ס"ג-1 מגלים כי המסע האחרון שלהם דרך הסטארגייט ייתכן וחרץ את גורלה של ציוויליזציה שלמה.

יישות חייזרית מתאהבת בקרטר ועוקבת אחריה לכדור הארץ. שם היא לובשת צורה אנושית ומבקשת לנהל עימה מערכת יחסים רומנטית.

ס"ג-1 מוצאים את עצמם תקועים בספינה הרוסה בגלקסיה מרוחקת – בעוד אפופיס מאיים להשמיד אותם. טיאלק עובר שטיפת מוח והופך נאמן לאפופיס.

ס"ג-1 חייבים להסתגל למפקד החדש כאשר הגנרל האמונד יורד מתפקידו – אבל אוניל מגלה מהלכים רקובים העומדים מאחורי ההתפטרות של הגנרל.

ס"ג-1 חייבים למנוע מאפופיס והרו'אר מלהקים ביניהם ברית עוצמתית, בעוד טיאלק נתפס ומעונה על ידי הגאולד.

ס"ג-1 נקלעים לעימות בין שתי תרבויות המנסות ליישב את אותו כוכב לכת. שתיהן תלויות בתנאים המיוחדים של הכוכב, אך האחת חייבת להשמיש את הכוכב בצורה שתמנע את התיישבות השנייה.

הרוסים מחלצים סטארגייט מקרקעית האוקיינוס ופונים אל מפקדת הסטארגייט לעזרה כאשר הניסויים שלהם משתבשים ונדמה כי הם נתקלו בצורת חיים חדשה.

כאשר חבר צוות של מפקדת הסטארגייט מנסה להרוג טוקרה, הטוקרה מתעקשים לגלות האם קיים מרגל הנתון לשליטה מוחית של הגאולד ומתברר כי אוניל וקרטר עשויים להיות קורבנותיה של אותה טכנולוגיה.

ארכיאולוגית של הטוקרה מגיעה למפקדת הסטארגייט עם טכנולוגיה חדשה שהתגלתה וביכולתה להעניק לחברי צוות ס"ג-1 כוחות על אנושיים.

אוניל וטיאלק מסכנים את חייהם כדי למנוע מהחרקים המשכפלים דריסת רגל ראשונה על ​​כדור-הארץ. במקביל, קרטר עוזרת לאסגרד להדוף פלישת משכפלים לכוכב שלהם.

ס"ג-1 פוגשים יצורים המבשרים השמדה המונית שאפילו האסגרד לא הצליחו לשלוט בהם, כעת עליהם להרוס את החללית נגועת החרקים המשכפלים של תור לפני שתגיע לכדה"א.

חפץ זר גורם לדניאל להיעלם אל מימד אחר והצוות מחפש עזרה מסבו ששוהה במוסד לחולי נפש, רק שמסתבר והוא נמצא שם בעקבות תגלית דומה לזו שעשה דניאל.

אוניל גונב טכנולוגיה מהטולאן ונאלץ לעזוב את תוכנית הסטארגייט. מייבורן, שמעוניין לצרף אותו לשורתיו, מציע הצעה מסקרנת שמתגלה כחלק מדבר גדול הרבה יותר בעל השלכות דיפלומטיות על הכוכב.

ס"ג-1 נלקחים בשבי על ידי צייד ראשים חוצני עם נאמנות לא ברורה.

ס"ג-1 מגלים כוכב לכת שבו ילדים משמשים לרכוש ידע עבור האוכלוסייה כולה. הצוות מתחילים לשאול שאלות כאשר הם מגלים שאותם ילדים מאבדים את כל זכרונותיהם בין לילה.

האסגרד מסיעיים לכדור הארץ במשא ומתן על הסכם הפסקת אש עם אדוני המערכת של הגאולד.