בפררק האחרון לסדרה, העימות מגיע לשיאו. הסיילונים ובני האדם עומדים בפני החלטה קשה.

בשעה שהגלקטיקה מפורקת למען חלקיה, נשמעת קריאה בחיפוש אחר מתנדבים לשם ביצוע משימה אחרונה.

חבורת מורדים סיילונים מחזיקה את הנשיאה רוזלין בשבי בניסיון לפתות את החמישה האחרונים למצאת ממחבואם על ה"גלקטיקה".

חיפוש כדור הארץ יוצר מתח על סיפון ה"דמטריוס" עבור קארה ואנשי הצוות שלה.

הקו הדק שמפריד בין האנושות לבין הסיילונים המתפתחים במהירות משורטט מחדש כאשר סטארבק שבה לחיים וטוענת שהיא מצאה את כדור הארץ.

זהו יום הנישואים של אדאמה והוא נזכר באשתו. צ'יף טירול וקאלי נקלעים לסכנה במהלך משימת תחזוקה.

לגלקטיקה עולים אנשים מסג'יטריון. הם חולים במחלה מסתורית שיש לה תרופה, אבל הם מתנגדים לתרופות ולרופאים. הילו עוזר להם ונאבק בכל אנשי הגלקטיקה.

גזענות, מחלות ורצח משתוללים ברחי הגלקטיקה בשעה שהצוות הרפואי מתקשה להשתלט על מגפה שהגיעה מפליטים סג'יטרונים.

בשעה שסופרנובה מאיימת להרוס את כוכב האצות, צוות הגלקטיקה מתמודד נגד הסיילונים במרוץ למצוא רמזים בנוגע למיקום כדור הארץ.

הגילוי האפשרי של עינו של צדק בכוכב האצות מוביל למוי סתום וקטלני, בשעה שהסיילונים ובני האדם מסכנים את הכול עבור הזדמנות למצוא את הדרך אל כדור הארץ.

על אדאמה להתמודד עם הרגע האפל ביותר בקריירה הצבאית שלו כאשר לוטננט דניאל נובצ'ק, טייס שחשבו שנהרג במשימה סודית לפני שנים רבות, בורח מחזקת הסיילונים ומגיע לגלקטיקה.

בעקבות העזיבה מקאפריקה החדשה, תוצאות מסתדרות בשעה שאלו שנלחמו בסיילונים מחפשים נקמה – או צדק – נגד אלה ששיתפו איתם פעולה.

בפרק האחרון לעונה, על לורה לבחור בין גניבת הבחירות לבין לתת לבלטאר לנצח.

הגילוי המקרי של כוכב הראוי למגורים מטה את הבחירות לטובתו של בלטאר, בשעה שמשימת החילוץ של סטארבק לקאפריקה נתקלת בבעיה לא צפויה.

הגלקטיקה והפגסוס משלבות כוחות כדי לתקוף אל ספינת התחיה הסיילונית, אבל אדאמה וקיין ממשיכים לנסות ולהיפטר זה מזו. אפולו עובר חוויה קשה וד"ר בלטר מתקרב לג'ינה הסיילונית.

מאבק כוחות צבאי מאיים להפוך למלחמה בשעה שהבטלסטאר גלקטיקה והפגסוס מנסות לאחד כוחות כדי להרוס מטרה סיילונית קריטית: ספינת "התחדשות".

הצי נתקל בכוכב המלחמה פגסוס, ששרדה את מתקפת הסיילונים. המפקדת שלה, אדמירל קיין, לוקחת פיקוד על הצי למורת רוחם של אנשי הגלקטיקה.

וירוס סיילוני חדר למחשבים של הגלקטיקה, בשעה שסנטוריונים סיילוניים עלו ועושים את דרכם בקרב לעבר המרכזים הפגיעים של הספינה.

לאחר שקומנדר אדאמה נורה וכמעט מת, על טאי להוביל את הגלקטיקה ולשמור על המשאבים הנחוצים כדי להציל את חייו של הקומנדר.

בפרק האחרון לעונה, הגלקטיקה צריכה להשמיד ספינת בסיס סיילונית כדי לחלץ את אנשיה מקובול. קארה נתקלת בהיילו ובשרון בקפריקה הכבושה.

הגלקטיקה מגלה במקרה את הפלנטה קובול, מקורה המיתולוגי של האנושות, והמפקד אדמה והנשיאה רוזלין נקלעים למחלוקת לגביה.

הדלק של צי המושבות אוזל לאיטו והגלקטיקה נאלצת לשגר מתקפה נואשת נגד מזקקה סילונית.

הסיילונים תוקפים את הגלקטיקה בכל חצי שעה ועל הצוות לגלות כיצד הם מאתרים אותה. אבדן של ספינה מעלה פתרון אפשרי.

זואי ומדיסון סובלות מטרגדיה ופיונה מנסה לעזור להן. בינתיים, קורדיליה חייבת לקבל החלטה בנוגע למשפחתה, ואילו דלפין מתחילה להתמודד עם המאה ה-21.

בעוד קית' מנסה להתאחד עם גרייס, האחות מארי מגלה שכח אפל פלש למוסד.