שרדר יוצר קשר עם הצבים ומציג נשק שיוכל להשיב את ספלינטר לצורתו האנושית. במקביל קרנג מקבל משרדר את גופו החדש ומתחיל בהכנת צבאו להשתלטות על כדוה"א.

דונטלו עובד על הרכב של הצבים ומוסיף לו ציוד מעקב ונשקים. שרדר מחליט להביא נשק ממימד איקס ופותח את השער הרב-מימדי.

שרדר מוצא את בקסטר סטוקמן ולוקח אותו תחת חסותו כדי שזה יבנה לו חסלנים שיצאו בעקבותיו של ספלינטר. הצבים מונעים זאת ויוצאים לחפש את האחראי.

הצבים ואפריל ממשיכים בחיפושיהם אחרי הטכנודרום, שרדר בינתיים הופך 2 מאנשיו; ביבופ ורוקסטדי, לחיות. שרדר חוטף את ספלינטר והצבים יוצאים להציל אותו.

ממקום מושבם בתעלות הביוב של מנהטן, ניו-יורק, ארבעה צבים נלחמים בפושעים, מגלומנים מרושעים ופולשים חוצנים, ובכל אותה עת נותרים חבויים ומבודדים מפני העולם החיצון.