קירק מבקר בכוכב שעליו חי אחיו ומגלה שהוא נהרג על-ידי חייזרים דמויי אמבות. הם מדביקים גם את ספוק, אבל לתרופה של בונז יש תופעות לוואי מפתיעות.

קירק פוגש את לזרוס, שטוען שהוא במרדף חוצה זמן ומרחב אחרי העצמי המקביל שלו. לדבריו, אם קירק לא יעזור לו, כל מערכת העולמות בסכנה.

בונז חוזר בזמן אל אמריקה של שנות ה-30 במאה ה-20 ובטעות משמיד את העתיד. כדי לתקן את הנזק, גם קירק וספוק חוזרים בזמן − וקירק מתאהב.

קירק מנסה להקים מוצב בכוכב שעליו חיים האורגאניים הפרימיטיביים לכאורה. הקלינגונים תוקפים והאורגאניים מראים בדיוק כמה הם מפותחים.

קירק וספוק חוקרים מקרה שבו מפלצת הרגה מספר אנשים במושבת כרייה. ספוק מגלה שהיצור המוזר הוא תבוני, וגם שיש לפעולות שלו מניע מוצדק.

האנטרפרייז נוחתת על כוכב שבו כולם הופכים לפסיביים מאוד ומביעים חיבה רבה זה כלפי זה. עד מהרה קירק מגלה את הסיבה לתופעה.

צוות האנטרפרייז נתקל באנשי-על אלימים בהנהגתו של חאן נוניאן סינג, שנלחם בקירק על השליטה וגורם לאיש צוות נאמן לבגוד בצי הכוכבים.

חברי הצוות מגיעים אל כוכב שבו נגזר עליהם למות וקירק מגלה שהם חלק ממלחמה וירטואלית שבה הלוחמים מתאבדים כדי להימנע מקרבות אמיתיים.

צוות האנטרפרייז מגיע אל כוכב שבו ספינה של צי הכוכבים נעלמה שנים רבות קודם לכן. על הכוכב הם מוצאים מחשב עריץ ששולט ביד רמה בתושבי הכוכב.

קצין נהרג בתאונה חריגה ורשומות המחשב מפנות אצבע מאשימה כלפי קירק. מעדויות המוצגות במשפט צבאי עולה כי מדובר בהפללה.

כוכב שחור מחזיר את האנטרפרייז בזמן אל כדור הארץ בשנות ה-60 של המאה ה-20. כדי שיוכלו לחזור, קירק והצוות חייבים להשמיד כל עדות לביקור שלהם.

האנטרפרייז נלכדת על כוכב שנשלט על-ידי חייזר ילדותי עם סקרנות רבה לגבי נפוליאון, וקירק מציע לו את חייו תמורת החירות של הצוות.

חייזרים חוטפים את קירק יחד עם גורן – הומנואיד אלים בעל מראה של לטאה. כדי להציל את הצוותים שלהם, קירק והגורן חייבים להילחם עד המוות, אבל קירק מסרב.

ספוק, בונז, סקוטי ואחרים נוחתים נחיתת אונס על כוכב, ומותקפים על-ידי ענקים קטלניים. ספוק מסכן את חייהם כדי לנסות לממש סיכוי קטן לחילוץ.