כאשר קרטר נעלמת במזימה הכוללת את הגאולד, אוניל שוב חובר לקולונל מייבורן על מנת לשחרר אותה.

ספינה זרה מתקרבת לכדור הארץ ששולחת את ס"ג-1 לחבר וותיק שבידיו כמה תשובות – שם הם מגלים כי מרטין לויד יצר תוכנית טלוויזיה על תוכנית הסטארגייט.

ס"ג-1 פוגשים בבעלי ברית חדשים, בעלי טכנולוגיה ומתקדמים ששותפים למלחמתם נגד הגאולד – אם כי הם לא מכירים את סודם האפל של אסשן ומניעיהם.

הטולאן מציעים לכדה"א את טכנולוגיית הנשק המתקדמת שלהם, מה שמוביל לחקירה חשאית על טולאנה, שמובילה לגילוי מדהים.

ס"ג-1 חוברים ליחידה רוסית כאשר אחד מצוותי הסטארגייט שלהם נעלם במקדש חוצני מסתורי. כשהם מגיעים לשם הם מגלים את הסיבה להיעלמות הצוות וכמו כן, את המניע של הרוסים למשימה.

קסנדרה נופלת למשכב, מה ששולח את ס"ג-1 בחזרה לכוכב הבית שלה – שם הם חושפים סוד גאולד אפל הנוגע לטקסים שעוברים בני נוער ועדויות לקשר עם הגאולד נירטי.

ס"ג-1 מגלים חברה המשתמשת באונאסים כעובדי כפייה, ומנסים לשחרר את ידידו של דניאל, צ'אקה.

ס"ג-1 מגלים כי המסע האחרון שלהם דרך הסטארגייט ייתכן וחרץ את גורלה של ציוויליזציה שלמה.

אוניל וסגן טיילר מאוימים על ידי כוחות גאולד ונלכדים מאחורי קווי האויב – אלא כשטיאלק, ג'קסון וקרטר חוזרים לכדה"א כדי לבקש סיוע, הם מגלים שבמפקדת הסטארגייט לא יודעים כלל מי…

יישות חייזרית מתאהבת בקרטר ועוקבת אחריה לכדור הארץ. שם היא לובשת צורה אנושית ומבקשת לנהל עימה מערכת יחסים רומנטית.

ס"ג-1 מוצאים את עצמם תקועים בספינה הרוסה בגלקסיה מרוחקת – בעוד אפופיס מאיים להשמיד אותם. טיאלק עובר שטיפת מוח והופך נאמן לאפופיס.

לאחר שמוחו השתנה על ידי אפופיס, טיאלק חייב לעבור טקס שייקח אותו אל קצה המוות עצמו כדי שיוכל לגלות מחדש את מי הוא.

ס"ג-1 מסייעים לפנות את הטוקרה לבסיס חדש – אבל העניינים מסתבכים כאשר מרגל מגלה את מיקומם לאפופיס. הצוות מנסה תוכנית נועזת להפיל את הצי רב העוצמה של הגאולד.

ס"ג-1 צריכים להציל עולם חייזרי מן הגאולד – עם קצת עזרה ממקור בלתי צפוי. טיאלק מבקש לנקום באדון המערכת קרונוס על שרצח את אביו.

לאחר שגשש שנשלח לעולם אלקטרוני גורם לקצר בסטארגייט, מתברר כי מפקדת הסטארגייט נמצאת תחת פלישה של כוח חייזרי שהשתקע במערכות המחשב – וגם במייג'ור קרטר.

קרטר מנסה למנוע מצוערת צעירה ומבטיחה מלזרוק עתיד מבטיח במפקדת הסטארגייט. אוניל וטיאלק נתקלים בצורת חיים זעירה, אך מסוכנת, בבסיס מחקר מחוץ לעולם.

ס"ג-1 מוצאים נער צעיר בארמון גאולד נטוש שמציג להם מכשיר מרהיב. אלא שאותו מכשיר מפיץ אור יפייפה הגורם להתמכרות אליו ולנטיות אובדניות ככל שמתרחקים ממנו.

חברי הצוות של דניאל ג'קסון מבחינים בשינוי מטריד בו כאשר הוא מתאחד מחדש עם הילד של הרססיס וזה מעניק לו את הזיכרון הגנטי של הגאולד.

ס"ג-1 חייבים להסתגל למפקד החדש כאשר הגנרל האמונד יורד מתפקידו – אבל אוניל מגלה מהלכים רקובים העומדים מאחורי ההתפטרות של הגנרל.

עשר שנים לתוך העתיד וחבריו לשעבר של צוות ס"ג-1 חייבים לשלוח מסר אל העבר כדי למנוע את הכחדתו של המין האנושי מידיי בעלי בריתם הנדיבים, אנשי האסשן.

אקסבייר מתחיל לדאוג בקשר לקיום מוטאנטים בידיעת הציבור לאחר ידיעות על אדם עם כנפי מלאך. כשרוב האקס-מן אינם בגלל חג המולד וכשסרברו בתיקונים, סקוט ורוג הם היחידים שנותרו כדי לאתר…

רופא אליל אפריקאי מגיע למכון כדי לגנוב את הכוחות של סופה, בדיוק בזמן שהיא שוקלת לשלוח את אוון חזרה לבית הוריו.

לאנס מגיע למכון כשהוא רוצה להצטרף לאקס-מן. לצערו די קשה לו להתרגל, וזה לא נהיה יותר קל כשמאשימים אותו על נסיעות ליליות בכלי תחבורה של האקס מן של תלמידים אחרים.

סקוט נעלם בים כשהוא מנסה למצוא את אח שלו, שנסחף ע"י גל ענקי בזמן שהוא גלש.

הילדים מתחילים לדאוג כשלפרופסור האנק מק'קוי, הבדרך כלל רגוע, מתחילים להיות התקפי זעם חיתיים.

תקלה בתא של ג'אגרנאט משאירה את האקס-מן בלי פיקוח של מבוגר כשצ'רלס יוצא לבדוק זאת. המוטאנטים הצעירים מחליטים לעשות מסיבה, אבל העניינים מסתבכים כשאחד האורחים מגיע לסרברו.

הכוחות של ג'ין מתחילים לגדול בהתפרצויות. בהתחלה היא מנסה להתעלם מזה, אבל עם כל התפרצות הבעיות שלה בלהשיג שליטה גדלות. בינתיים מגיעה לבית ספר מורה חדש למדעים בעל חזות מעניינת.

כשסקוט וקורט משתמשים בכוחותיהם כדי להציל אנשים מתאונת רכב, השאלה היא מכמה דברים הם צריכים להתעלם כדי לשמור את זה בסוד. הפרופ' אומר שהעולם לא מוכן, אך לאחווה יש רעיונות…

אחרי ש-"קירקעו" אותה בגלל התנהגות מופרעת באמצע משימת אימונים, טבת'ה לא מוכנה לסבול בקשות מצד אביה לגנוב כסף בשביל "אמא" שלה…

האקס-מן והאחווה מופיעים ומותירים את מגנטו ואת מיסטיק לכודים בתוך אסטרואיד אם. סקוט ואלכס מפוצצים את אסטרואיד אם, אך לא לפני ששני כדורים מתכתיים מתעופפים מהאסטרואיד.

ציקלופ מגלה שאחיו, אלכס, שרד את התרסקות המטוס שהרגה את הוריהם ויחד הם נלקחים לאסטרואיד אם של מגנטו, שחוטף כמה מחברי האקס-מן והאחווה בניסיון להגביר את יכולותיהם המוטאנטיות.

מבזק חדשות מההרים הקנדיים מעורר משהו עמוק בוולברין, בעקבותיו הוא מתחיל לחוות הבזקי זכרונות. הוא לוקח את ״הציפור השחורה״ לאתר כדי לחקור את העניין, מבלי לדעת שקייטי וקורט הצטרפו לטיסה.

רוג חווה סיוטים בהם היא חוזה במראות מעברו של קורט. אך הוא קטן מדי בשביל לזכור את המאורעות, אז מאין הזכרונות?

האקס-מן עוברים אימוני הישרדות במחנה קיץ ומיסטיק משחררת את קיין מרקו – אחיו החורג של אקסבייר, הידוע בכינויו "ג׳אגרנט", בתקווה שיעזור לה להשיג את "סרברו" – מערכת לגילוי מוטאנטים.

אוון מקבל מצלמה כדי להגיש עבודה מצולמת על אירועי היומיום בחייו לאחר שנכשל במבחן. למרות שלא כולם נרגשים להיות חלק מהסרט, שן-חרב מעוניין בתוצר הסופי.

קורט מגלה מעבדה נטושה, שם הוא נשאב לכיס בין-מימדי על-ידי מכשיר משונה שהוא מוצא.

סקוט ורוג נקלעים יחד לטיול שדה במועדון הגיאולוגיה. סקוט מנסה להיות ידידותי כלפי רוג, אך נראה שלמיסטיק יש תוכניות אחרות…