צוות 7 הצליח להשיג את המגילה החסרה ועובר את הבחינה השניה. ההוקאגה מסביר לכל אלו שעברו את הבחינה מה המטרה האמיתית של בחינות הצ'ונין. האחראי על הבחינה השלישית מגיע, ובשורה…

צוותי הגנינים הפזורים ביער המוות ממשיכים בחיפושם אחר המגילה שחסרה להם. צוות 8 מביטים מרחוק על הצוות מהכפר הנסתר בחול, והם מקבלים הצצה מכוחו המפחיד של גארה.

נארוטו שוקל להציץ במגילה של הצוות שלו. צוות 7 פוגש בצוות של קאבוטו, ויחד הם מנסים למצוא את דרכם למגדל שבמרכז יער המוות.

לאחר שסאקורה כמעט מאבדת את חייה בניסיון להגן על הצוות שלה ועל לי, צוות 10 יוצא מהמחבוא שלו לעזרתה. במקביל, צ'אקרה מרושעת מתפתחת אצל אחד ממחוסרי ההכרה.

סאקורה עומדת בפני סיטואציה שהיא מעולם לא עמדה בה כאשר היא נותרת לבדה להילחם נגד השלישייה מכפר הצלילים. על אף הפחד והחרדה, היא נעזרת בנחישותה הגדולה ונלחמת חזרה.

סאקורה מנסה לשמור על נארוטו וסאסקה מחוסרי ההכרה אך מוצאת את עצמה מותקפת על ידי הגנינים מהכפר הנסתר בצלילים. אחד מהגנינים של כפר העלים מגיע לעזרתה, וקרב של שלושה על…

האם סאסקה יוכל להציל את הקבוצה שלו ממוות בטוח על ידי האדם המסתורי?

האם רוק לי יצליח להציל את סאקורה מהסכנה הממשמשת ובאה?

נארוטו, סאסקה וסאקורה ממשיכים את הקרב שלהם נגד האויב חסר הרחמים שפגשו ביער המוות.

צוותי הגנינים ממשיכים בחיפושם אחר שתי המגילות ביער המוות. בינתיים, צוות 7 סוטה ממסלולו המקורי בגלל אויב עוצמתי כשנארוטו נפרד מהקבוצה והעניינים מתחילים להסתבך.

פרק ספיישל שמסכם את 25 הפרקים הראשונים ומכין את הקרקע לקראת בחינת הצ'ונין השניה.

לאחר שעברו בהצלחה, איכשהו, את המבחן הראשון, נארוטו והחבורה צריכים להתמודד עם סכנה חדשה! הגנינים נדרשים לחפש שתי מגילות שונות כדי שיוכלו להשלים את הבחינה בהצלחה.

הגנינים מעתיקים אחד מהשני את התשובות למבחן, כל אחד בדרכו, בזמן שהדאגות מהשאלה העשירית מתחילות לצוף.

כל הגנינים מתרכזים ומתחילים את הבחינה בכתב, הלוא בחינת הצ'ונין הראשונה. אך הבחינה בעייתית, השאלות לא מותאמות לרמת הידע של הגנינים בכלל.

רוק לי המשונה מאתגר את סאסקה לקרב, ממש לפני תחילת בחינות הצ'ונין.

תשעת הטירונים של כפר העלים נפגשים במרכז הבחינה. הם מושכים את כל תשומת הלב אליהם. אדם אחר בעל ניסיון רב בבחינות הצ'ונין שעומד להיבחן איתם מנסה לעזור להם להוריד פרופיל…

לאחר ששלושת הנינג'ות עוזבים, סאסקה מבין שיש לו יריב עוצמתי. קאקאשי מודיע לצוות 7 שהוא המליץ עליהם לבחינות הצ'ונין. נארוטו וסאסקה מרוצים, אך סאקורה מפחדת לאכזב את כולם.

לאחר שהמשימה יוצאת הדופן שלהם הסתיימה, צוות 7 חוזר לבצע משימות פשוטות. קונוהאמארו וחבריו באים לבקר את נארוטו. בדרכם, הם פוגשים את סאקורה וסאסקה. ההוקאגה השלישי מכריז על תחילת בחינות…

זאבוזה הוא כבר לא האויב של קאקאשי, ובזכות מילותיו המרגשות של נארוטו, הוא פותח חזית מול אנשיו של גאטו. השד של הכפר הנסתר בערפל סוף סוף זוכה לנקום את נקמתו.

האקו אומר לנארוטו המהוסס לגמור אותו. נארוטו מטיל ספק בדרך החיים של האקו. במקביל, הקרב בין קאקאשי לזאבוזה מגיע לשיאו.

נארוטו מתפוצץ. כעסו כלפי האקו, שהביס את סאסקה, משחרר את הכוח של תשע הזנבות. הצ'אקרה של נארוטו נעשית כל כך עזה שאפילו קאקאשי וזאבוזה מבחינים בה.

האקו ממשיך לפגוע בנארוטו ובסאסקה בתוך מערך המראות, עד שנארוטו כבר לא מסוגל לעמוד על רגליו. לפתע, סאסקה מעורר כוח חדש ופועל בצורה חסרת תקדים.

סאסקה מצליח לעלות על דרך לפגוע בהאקו. קאקאשי מבין שזמנם קצר. מתוך דאגה לנארוטו, לסאסקה, לסאקורה ולטזונה הוא מחליט להשתמש בשארינגאן פעם נוספת כדי להביס את זאבוזה אחת ולתמיד.

סאסקה מתקשה מאוד בקרב נגד האקו בתוך מערך המראות שלו, אבל נארוטו מגיע לעזור לו. סאסקה חושב על תוכנית למתקפת נגד לג'וטסו המראות של האקו, אבל נארוטו הורס לו אותה.