אחרי שרורי מתנצלת בפני לורליי, היא שולחת מכתב מאירופה שיש לו השלכות בלתי צפויות. בינתיים, לוק חוזר הביתה.

רורי ולורליי מתווכחות על הבחירה של רורי. לורליי מאושרת ממערכת היחסים החדשה שלה. אמילי ורורי מתכננות לנסוע לאירופה.

לורליי מזמינה חברים ובני משפחה לשהות בפונדק דרגונפליי לקראת פתיחתו. שני מחזרים מנסים להשיג את לורליי.

ג'ס מלווה את אמו לחופה בחתונה בסגנון הרנסנס. לוק מציע למושא אהבתו לצאת אתו. דין מתוודה בפני רורי.

קלטת לעזרה עצמית עוזרת ללוק הדכאוני להבין מיהי הנשמה התאומה שלו. לורליי לחוצה כשיום הפתיחה של פונדק דרגונפליי מתקרב.

לורליי מתעמתת עם אביה כשהיא מגלה שהוא ניתק קשרים עסקיים. לוק מעדכן את לורליי לגבי חיי האהבה שלו.

תביעה מוגשת נגד ג'ייסון וריצ'רד. רורי כועסת על החלטה שדין קיבל. לדין נאמר להפסיק לבלות את זמנו עם רורי.

רורי ופריס נוסעות דרומה לפלורידה לרגל חופשת האביב, ושם הן פוגשות בצמד חברות ותיקות מצ'ילטון.

ריצ'רד שבור עקב אובדן פתאומי. אמילי המומה כשהיא מגלה מכתב ישן שנשלח לריצ'רד.

רורי כורעת תחת עומס הלימודים ומתוודה על כך בפני דין, שעובד בצוות הבניין בפונדק דרגונפליי.

רורי לומדת על חייו החדשים של דין. כשלורליי ורורי מבלות יום בקניון, הן נתקלות באמילי שנמצאת במסע קניות חסר מעצורים.

רורי נתקלת בג'ס בסטארס הולו. אחותו של לוק מבקרת בסטארס הולו ומציגה את החבר החדש שלה בפני אחיה.

לוק חושש כשאחותו מגיעה לביקור. לורליי מהססת לספר להוריה על בן הזוג החדש שלה. הרומן של פריס נעשה רציני.

לורליי מוטרדת מכך שלוק שכר דירה בעיירה אחרת. רורי מגלה שבחור שהיא מחבבת מפיץ מידע שקרי עליה.

לורליי וסוקי משפצות את הפונדק. לורליי נהנית מערב רומנטי. רורי מוטרדת ממערכת היחסים החדשה של פריס.

לאחר שמגלים שאית'ן לא היה בין נוסעי המטוס, הניצולים בראשות ג'ק מחפשים אחר קלייר וצ'ארלי הנעדרים, מחשש לגורלם. לוק ובון מחפשים בג'ונגל ונתקלים בברזל מרובע על פני הקרקע.

קלייר חווה סיוטים בשנתה וחושדת שמישהו מנסה לפגוע בתינוקה. הארלי מכין רשימה של הניצולים ומשווה אותה לרשימת נוסעי המטוס המקורית, ומגלה שאחד הניצולים לא מופיע בה.

לאחר העינוי, סעיד יוצא לסיבוב סביב האי ונשבה בידי אישה מסתורית. הארלי בונה מסלול גולף כדי לעזור לשאר הניצולים להתמודד עם החוויה הטראומטית.

צ'ארלי מנסה להיגמל מההתמכרות שלו ונעזר בג'ון לוק. סעיד מנסה להבין את פשר השדר בצרפתית, בתקווה שיסייע להיחלץ מהאי. ג'ק נקלע לסכנה באחת המערות.

שאנון סובלת מהתקף קוצר נשימה קיצוני ונזקקת למשאף. הניצולים מבקשים מסוייר את המשאפים שהוא מסתיר אך הוא מסרב. סעיד וג'ק מחליטים להשתמש בכח פיזי נגדו.

יריבות מתחילה להיווצר בין ג'ן ומייקל, לחוסר שביעות רצון של סאן מהעניין. ג'ק מציע לעבור למערות, אך המתנגדים לכך טוענים שיפחת הסיכוי להנצל. עסקה נרקמת בין צ'ארלי ולוק.

בון נקלע לסכנת טביעה וג'ק מסייע לו ולאישה נוספת הזקוקה לעזרה. המים נגנבים וג'ון לוק מחליט לצאת לחפש מקור מים חדש בג'ונגל. בדרך הוא מגלה שג'ק נופל מצוק ונחלץ לעזרתו….

לאחר שלהקה של חזירי בר חודרת לתוך שרידי המטוס, ג'ק מחליט לשרוף את השרידים יחד עם הגופות. סעיד מכין אנטנות קטנות כדי למצוא מקור כח על האי. לוק, קייט ומייקל…

קבוצה מתוך הניצולים באי יוצאת למשימה: שידור אותות מצוקה מההרים באי, באמצעות מכשיר הקשר שנמצא במטוס. בדרכם מקבלים הניצולים שדר מוזר ונתקלים באורח בלתי צפוי. בינתיים במחנה, מנסה ג'ק לרפא…

קבוצת המשימה שבה ממשימת השדר בהרים ומתחים מתחילים להתעורר בין חבריה. בעקבות שיחה עם המארשל הפצוע, ג'ק מתחיל לחשוד בקייט, האסירה שלוותה בטיסה לארה"ב על ידי המארשל.

דרמת מתח ומסתורין זוכת 11 פרסי אמי. טיסת אושיאניק 815 מאוסטרליה ללוס אנג'לס לא מגיעה ליעדה. הניצולים מוצאים את עצמם על אי מבודד, ומגלים שמדובר במקום בלתי צפוי, הטומן בחובו…

מונק עוזר לדישר לחקור מי האלמוני שירה בקפטן סטוטלמאייר, אולם לאחר שהוא לוקח תרופה שמרגיעה את הסימפטומים הנפשיים שלו, נפגמת יכולתו לפתור פשעים.

מונק נוסע ללוס אנג'לס כדי לסייע לאביה של אישתו המנוחה לפתור תעלומה בשעשועון.

מונק מתחיל לעבוד בכלבו בשביל לפתור רצח של אחד מעובדי הכלבו, אך מגלה שקצין הבטחון הראשי במקום הוא שוטר מושחת לשעבר.

שרונה מתחילה לראות גברים שטופי דם שאף אחד אחר לא רואה, והדבר גורם לה להטיל ספק בשפיותה. עקב כך היא מפסיקה לעבוד והדבר מאלץ את מונק לפתור את התעלומה.

מונק חודר לשורותיה של משפחת פשע מאורגן, במהלך חקירת רצח.

מונק מוחק בטעות קבצי מחשב חשובים של המשטרה, ועקב כך מאבד את עבודתו. למרות זאת, סטוטלמאייר מצרף אותו לחקירה ואף מסכן את הקריירה שלו בניסיון להחזיר אותו לעבודה.

הפסקת חשמל פוגעת בעיר וכשהאורות נדלקים, מתברר שאירעו 3 רציחות. מונק חוקר את הרציחות, אך החשוד העיקרי שלו נחשב כמת בעיני האף-בי-איי.

מפיק מוסיקלי נמצא מת, וכלי הרצח נמצא בידי חיית השעשועים שלו – שימפנזה.

בפרק הפותח את העונה השלישית, מונק ממשיך את חקירת מותה של אישתו, אך מסתבך בדרך בפיענוח פרשה תמוהה של ירי בשגריר לטביה המתגורר בעיר.

כאשר אסיר בתא הנידונים למוות נרצח 45 דקות לפני מועד ביצוע גזר דינו, מונק נקרא לחקור כיצד קרה הדבר.

מונק ושרונה מתחזים לזוג נשוי, כדי לפתור פרשת רצח במוסד לייעוץ נישואין.

אישתו של הקפטן נפצעת קשה כשהיא נקלעת בטעות לסכסוך עובדים, בדרכה להקרנה של סרט תיעודי. מונק יוצא לחפש אחר האשמים.

סטודנטית למשפטים מציעה למונק עסקה מפתה – היא תחזיר אותו לעבוד במשטרת סן פרנסיסקו בתמורה לכך שיעזור לה למצוא את סבתה הנעדרת.

מונק חושד שכוכב טלוויזיה רצח את אשתו לשעבר, כדי שלא יצטרך להתחלק איתה בצ'ק השמן שקיבל על עבודתו.