הצי נתקל בכוכב המלחמה פגסוס, ששרדה את מתקפת הסיילונים. המפקדת שלה, אדמירל קיין, לוקחת פיקוד על הצי למורת רוחם של אנשי הגלקטיקה.

אדאמה מורה על הצי לקפוץ בשעה שגלקטיקה נשארת מאחור כדי למחוק את הווירוס מהמחשבים שלה ולהתמודד עם תקיפה עצומה של למעלה ממאתיים ריידרים סיילונים.

עתה משהצי התאחד, מחלוקות ישנות צצות שוב. ישנה ביקורת רבה על הצבא לאחר הטבח בגדעון. עם הכוכבת האורחת לוסי לאלס.

הנשיאה רוזלין יוצאת למסע עם הקונפדרציה שלה בחיפוש אחר קבר את'נה בשעה שקומנדר אדאמה שולח משימת חילוץ לקובול.

למעלה משליש מהצי הולך בעקבות הנשיאה רוזלין וטום זארק, מתפצל מהגלקטיקה וקופץ למסלול סביב קובול.

אדאמה חוזר לקבלת פנים של גיבורים ומטלה לא נעימה: עליו למצוא את לי ואת הנשיאה רוזלין, שנמלטו ומתחבאים בתוך הצי.

ספינות הצי מורדות במשטר הצבאי של קולונל טיי ובעקבות אירוע אלים מחליטה הנשיאה רוזלין להמלט ממעצר.

הקומנדר הזמני טאי מתחיל להבין שבלהיות מנהיג כרוכים דברים מעבר לנתינת פקודות. הוא מוצף, ומוצא את עצמו מתקרב שוב לאלכוהול.

וירוס סיילוני חדר למחשבים של הגלקטיקה, בשעה שסנטוריונים סיילוניים עלו ועושים את דרכם בקרב לעבר המרכזים הפגיעים של הספינה.