מוות באקדמיה לבייסבול מחזיר את ג'יין לעברו כילד פלא קורא מחשבות. תוך כדי פענוח תיק הרצח, הוא מנסה להנחיל לנערים הלומדים באקדמיה לקח חשוב לחיים.

קרב יריות אכזרי במטה הסי.בי.איי מחזיר את ג'יין, ליסבון ושאר הצוות למרדף אחר רד ג'ון.

צוות הסי-בי-איי חוקר את הירצחו של תכשיטן עשיר שנהרג במהלך שוד, אולם החקירה מקבלת תפנית שלילית כשהחשוד העיקרי נמצא מת.

שני מקרי חטיפה שונים נשזרים זה בזה ומינלי דורש מהצוותים של בוסקו וליסבון להתאחד כדי לפתור את התעלומה. הצוותים בעלי הגישות השונות נאלצים למצוא דרך לשתף פעולה.

בוסקו עוצר את ג'יין במהלך חקירת רצח וכולא אותו באשמת ריגול על צוותו. על אף העובדה שהוא כלוא, מצליח ג'יין לעזור לצוות של ליסבון בחקירה המתמשכת.

הסי-בי-איי חוקר את הירצחו של פרקליט מושחת, שלקוחותיו היחידים היו כנופיית אופנוענים ידועה לשמצה מלוס אנג'לס.

הצוות נקרא לאחוזת בקוורת', שם נמצאה גופה. שריף העיירה מאמין כי רוחו של וולטר בקוורת' רודפת את האחוזה והיא זו שביצעה את הרצח.

לאחר שחברי הצוות מקבלים טיפ אנונימי, הם מוצאים את גופתו של אדם שנהג לתקוף ילדים מינית וכבר נעצר בעבר ע"י ליסון. כעת היא הופכת לחשודה העיקרית ברצח.

צוות הסי-בי-איי נקרא לפתור תעלומת רצח בבית המחוקקים. מינלי, ראש היחידה, מבקש מג'יין וליסבון להיזהר במיוחד בכבוד החשודים.

בפתח העונה השנייה, מינלי מחליט להטיל את חקירת מקרה "רד ג'ון" על סאם בוסקו, כאשר הוא חושש כי לליסבון וג'יין מעורבות רגשית עמוקה מדי. אי לכך, מחליט ג'יין לפתור עוד…

פרק סיום העונה. אמה פלסקט נמצאת מבותרת בפארק מקומי, ואחותה התאומה של אמה, מיה, נעדרת. ג'יין מזהה את דפוס הפעולה של רד ג'ון, ויוצא עם הצוות בעקבותיו.

ג'ים גלברנד, מייסד ושותף בחברת תוכנה מצליחה, נמצא מת ביאכטה שלו. לכל אחד מהקרובים אליו יש סיבות טובות לרצוח אותו. ג'יין חושף את זהות הרוצח הבלתי צפוי.

ג'ייסון פרנטיס, תלמיד בבי"ס לנערים בעייתיים, נמצא מת ביער. מתברר שהתלמידים מאמינים באגדת יער אפלה המאיימת על חייהם. ג'יין משתמש בחרדות הילדים כדי לחשוף את האמת.

אדי דידריקסון, עובד במרכז משחקי וידאו נמצא מת בתוך עץ. במהרה מתברר שחייו היו סיפור כיסוי. ג'יין משתמש בכישוריו החברתיים כדי ליצור קשר עם מאפיונר בכיר בדימוס.

פליקס הנסון, עסקן ומפיק סרטים מתחיל, נמצא מת במגרש חנייה יומיים לפני התחלת צילומי סרט בהפקתו. ג'יין נאלץ להתמודד עם הבמאי, הכוכבת והבת המרדנית בדרך לפתרון התעלומה.

גבר בחליפה גורר שק כבד ומסתורי אל משרדי המחלק. התעלומה מובילה אל המרכז לתכנות לשוני נוירולוגי ולד"ר דניאל המניפולטיבי.

במחלק מתקבל דוא"ל מאת "ג'ו קיו פבליק" על רצח שצפוי להתבצע במדבר. הקורבן הוא מנהל בחברת השקעות. האם ג'ו הוא עובד זוטר שפוטר ונוטר טינה או שמא הרצח מוביל לפרשייה…

ג'יין מקבל הודעה על פצצה שהוטמנה במתחם. התפתחויות דרמטיות מובילות לפתרון מזימה מורכבת במיוחד שמעורבים בה כסף, בגידות ועברו של ג'יין כמדיום.

סקרלט מרקזה, יו"ר ועדת הנשים בקאנטרי קלאב המקומי ומעצבת תכשיטים זעירה, מתה מוות אלים במסיבה בביתה. ג'יין והצוות פותרים את התעלומה תוך ניצול רכלניותן של נשות הוועדה.

הארי, חתנו של איל הנפט איי.פי קייד נמצא מת במשרד של חמו. הפריט שנגנב מהמקום הוא ציור עתיק ויקר והחשוד הוא מולטי מיליונר רוסי שמחזיק בדרכון דיפלומטי. ג'יין והצוות ניגשים…

הצוות חוקר מקרה רצח של אישה הנשואה לאיש עסקים מצליח. החשדות מובילים לעוזרת האישית (אלונה טל) שפוטרה לאחרונה, לבעלה הנבגד ולמאהב חסר המעצורים.

קודי אלקינס, שחקן פוטבול מצטיין ותלמיד תיכון נעלם מביתו. ג'יין נעזר בילדים מקומיים כדי לאתר אותו. בעזרת מכשפה מקומית ומשפחתו הגאה של הנער חושף ג'יין צדדים לא מוכרים באישיות הנער.

ג'רד רנפרו, אסיר שהורשע באונס וברצח, מציע לג'יין סיוע במציאת רד ג'ון. מנלי מסרב לשתף פעולה וג'יין עוזב את המחלק. שאר חברי הצוות מתגייסים לעזרת ג'יין.

קאסל ובקט חוקרים סוחר אמנות שנורה בגלריה. אחד הקליעים נעלם באופן בלתי מוסבר מזירת הפשע. הצוות מוצא את העד היחיד – שלרוע המזל סובל מאבדן זיכרון.