הצוות יוצא לחיפוש אחר חלקי גופה חסרים, אחרי שהם מוצאים שיירים של גולגולת וידיים במיכלית אשפה. הקורבן מזוהה כצייד ראשים שהיה עסוק במרדף אחר פושע מבוקש.

בות' וברנן בוחנים את שאריותיו של ריצ'י ג'נארו, שהיה האחרון שנצפה חוגג במועדון לילה בג'רזי שור. האנה מתיידדת עם צוות הג'פרסוניאן ואנג'לה מנסה לשמור על ההריון שלה בסוד.

הצוות עובד בנסיון לפענח את הזהויות של בני זוג שעצמותיהם נמצאו במערה. ברנן מבצעת הערכה מחודשת של מערכת היחסים שלה עם בות'.

הפרק הפותח את העונה מתרחש 7 חודשים מתום אירועי העונה הקודמת. קרוליין ג'וליאן מכנסת את הצוות בוושינגטון בנסיון להציל את הקריירה של קאם עם מקרה הנוגע לעצמותיו של ילד צעיר.

הצוות עובד כדי לחשוף את הרמזים הקבורים בחפציו של אגרן כפייתי על מנת לפתור את תעלומת מותו. לאביה של אנג'לה יש סיבה לבקר, וברנן ובות' מתמודדים עם הזדמנויות ייחודיות.

משפטו של הקברן מגיע לסף דלתם של חברי הקבוצה, וכל אחד במכון ג'פרסון חייב לעבוד שעות נוספות כדי לחשוף את הראיות הפליליות שישיגו את ההרשעה.

בקתה שנשרפת ביער חושפת שתי גופות. האחת, מכשפה מודרנית והאחרת, מימי משפטי המכשפות בסיילם שמובילים את ברנן ובות, אל תוך עולם שכולו כשפים.

גופתו של עשיר תמהוני נמצאת בתוך מכונת כביסה בבית מלון כאשר המקום האחרון בו נצפה היה פסטיבל רוקנ'רול. ראייה שנמצאת יחד עם הגופה מסייעת לצוות לחשוף חשודים פוטנציאלים.

ברנן ובות' חוקרים שרידי אדם שנמצאו בתוך בטנו של כריש. ביולוגית ימית מגלה עניין בבות'.

בעקבות טעות בספרו של סוויט, בות' וברנן מספרים לו את האמת על הפעם הראשונה שעבדו יחד על תיק, שש שנים קודם לכן.

בות' וברנן חוקרים גוגולת לא מזוהה ופלג גוף עליון בבית ספר תיכון בו למדה ברנן בצעירותה, המקרה קושר קשר מוזר עם מקרה רצח נוסף מלפני 15 שנים.

רכבת תחתית נזרקת ממסלולה עקב מי שטפונות. בעוד חברי הצוות חוקרים את השרידים, סוויט שהיה ברכבת סובל מחוויה פוסט טראומטית.

בות' וברנן נקראים לחקור שרידי גופה מעוותת על מזבח בכנסייה, ומתעמתים עם חשודים אשר קשה לאפיין אם הם טובים או רעים.

שלד אדם מתגלה בעת חפירות של מלחמת אזרחים היסטורית אך השלד שייך לרופא שיניים של ימינו. שאריות דבק על העצמות שומר את סיבת המוות מסתורית.

סוכני הממשלה שמים את המעבדה תחת נעילה ודורשים מחברי הצוות לפענח סיבת מוות של גופה סודית. בות' מתפרץ לחקירה.

ברנן ובות' נוסעים לניו מקסיקו לחקור שרידי גופה בעלת מאפיינים מהחלל החיצון. השריף המקומי שמסרב לשחרר את שרידי העצמות, מאלץ את הג'פרסונים לעבוד באמצעות לוויין.

בלייר ודן משתפים פעולה כדי לאתר את ג'ולייט שנעלמה. צ'אק חושד שלילי לא מספרת לו את האמת.

צ'אק מתכנן לערוך נשף רשמי ומהוגן, אך היועצת שלו מבהירה לו שהציבור רוצה את תדמית הילד הרע, ולכן הוא מחליט להפוך אותו לנשף תחפושות מושחת.

צ'אק, סרינה, בלייר, דן, ג'ני ואריק חווים משבר כשאחד מבני המשפחה מתאשפז.

נייט מגלה שג'ולייט מסתירה ממנו יותר ממה שכבר גילה, והוא משכנע את ונסה לעזור לו לגלות את האמת סרינה וקולין עושים צעד חשוב לקראת קידום היחסים ביניהם.

בלייר מתכוננת ליום הולדתה ה-20, בעת שלילי ורופוס לא יכולים לחגוג את יום נישואיהם הראשון עם כל המשפחה, מכיוון שג'ני מנודה. דן מחליט לעשות משהו בנדון.

ג'ני חוזרת לאפר איסט סייד לריאיון עם טים גאן, בתקווה להתקבל ללימודי אופנה ל-"פרסונס". בלייר מגלה זאת ומרשה לה לצאת מהבית לצורך הריאיון בלבד.

בלייר קוראת בתקשורת שצ'אק השתנה ונעשה אדם טוב בזכות אווה, ומחליטה לעשות הכול כדי לגלות עליה מידע שיהרוס אותה ויחבל ביחסיה עמו.

לאחר הכרזת המלחמה של צ'אק, מחליטה בלייר להשקיע את כל מרצה בקמפוס ובלימודים, אך מגלה שצ'אק מגיע גם לשם כדי לנקום בה.

בלייר וסרינה מגיעות ליום הלימודים הראשון באוני' קולומביה, ומבינות עד מהרה שהדרמה בניו-יורק אינה נופלת מזו שבפריז רופוס לוקח את העניינים לידיו בעניין המצב של דן.

סרינה מגיעה לראות את הגופה שנחשדת כצ'אק, בשעה שבלייר פוגשת את צ'אק בכבודו ובעצמו ברחובות פריז רופוס חושד שמיילו איננו הבן של דן, והפעם יש לו סיבה טובה.

בפתיחת העונה הרביעית, נייט מתפרע בקיץ עם הפנקס השחור של צ'אק בלייר מבלה עם סרינה בפריז במאמץ לשכוח את צ'אק הסוד של האמפרי וג'ורג'ינה מתגלה לחברים ובני משפחה.

בלייר מנסה לקבל החלטה אם לפגוש את צ'אק בראש בניין האמפייר סטייט או לא. פצצה של 'אחת שיודעת' הקשורה בדן מתפוצצת. ג'ורג'ינה חוזרת.

כשמצב העניינים בין רופוס לוויל הופך למתוח, סרינה בוחרת בצד של אביה, וגורמת לרופוס להרגיש כמו זר בתוך המשפחה שלו.

חזרתו של ויל לאפר איסט סייד ממשיכה להכביד על סרינה, על לילי ועל יריבו משכבר הימים של ויל, רופוס.

כשבעלה הקודם של לילי מופיע בהפתעה, סרינה זוכה לאיחוד מחדש עם האבא שרצתה נואשות – או שלא?

צ'אק מציע לארגן חתונה לדורוטה שנמצאת בהיריון מתקדם. סרינה לא מספרת לנייט שהיא נפגשת בסתר עם קרטר בייזן.

רופוס מנדב את ג'ני לסייע לתצוגת האופנה של אלינור, אבל העניינים מקבלים תפנית לרעה כשג'ני מגלה שאגנס היא אחת מהדוגמניות.

צ'אק ובלייר ניצבים בפני החלטה קשה כזוג. סרינה מתכננת מסיבת יום הולדת לנייט, אבל ג'ני מנסה לחבל במאמציה.

ג'ני מהרהרת במערכת היחסים שלה עם דמיאן. ונסה ודן מנסים להגדיר את "האזורים" השונים של מערכת היחסים שלהם.

רופוס ולילי חושדים במערכת היחסים של ג'ני עם דמיאן. צ'אק מגלה עוד על האישה המסתורית.

צ'אק מאתר את האישה שראה ליד הקבר של אביו. ג'ני מסכימה לעזור לדמיאן. נייט וסרינה מתחברים.