דאקי מותקף ע"י אדם הטוען שבידו מידע בנוגע לאחיו החורג של דאקי, שמת לפני שנים. צוות אן-סי-איי-אס מחפש אחר הפושע בעוד דאקי מעלה זיכרונות מימיו האחרונים עם אחיו.
נגד צעיר מואשם ברצח חברתו לשעבר, אך מזוכה בשל טעות טכנית. למרות זיכויו הוא דורש לעמוד לדין צבאי כדי להוכיח את חפותו מעל לכל ספק ולחזור לשגרת חייו. גיבס נעתר…
דינוזו פוגש את האקסית שלו, בדיוק כשמורדים בסודן תוקפים חבורה של רופאים מתנדבים, ובהם בעלה. דינוזו ומק'גי מגיעים לזירת הפשע לחקור מקרה כפול של רצח וחטיפה.
קצין צי במילואים נורה למוות ביער. חקירת מותו מובילה לפתיחת תיק ישן שבו הואשם בנו, על לא עוול בכפו. חברי צוותו של גיבס נעזרים בחבורת קרימינולוגים המחקים את שרלוק הולמס.
גיבס שולח צוות לסייע לסוכן ה-די-אי-איי לואיס מיצ'ל בחקירה שסופה אינו נראה באופק. בנוסף, חברי הצוות מרכלים על המראה החדש של גיבס, שהמיר את תספורתו הצבאית וחולצת הפולו בחליפה מחוייטת.
בפרק סיום העונה, הצוות ממשיך בחקירה קדחתנית בניסיון לחשוף את ארגון הטרור "התכלית", שמגייס ילדים דרך האינטרנט וכעת אחראי לפיגוע במלון בקהיר ולאובדן מפתיע וכואב עבור חברי הצוות.
הסוכן דורנגט ממבצעי סייבר עוזר לצוות לאחר שקצינה צעירה שעבדה ביחידת הסייבר של המשרד למודיעין ימי נמצאה מתה. בנוסף, חברי הצוות מגלים שג'ייק וגיבס הפכו לחברים טובים.
גיבס ובישופ מגיעים לאפגניסטן לאחר שחקירת רצח מובילה אל ארגון טרור המחזיק נחת בשבי. טוני כועס כשהוא מגלה שמקגי זכה בתפקיד "הפנים של אן-סי-איי-אס" ויופיע על עלוני הגיוס של הסוכנות.
דינוזו מצוות לחברתו, הסוכנת זואי קיטס מ-איי-טי-אף לאחר שמתגלה שכלי הרצח בחקירה של אן-סי-איי-אס נרכש במסגרת מבצע שנוי במחלוקת של האיי-טי-אף. בינתיים, טוני האב חוזר לעיר כדי לפגוש את חברתו…
לאחר שמתגלה גופה של לוטננט בלשכה של אדמירל מהצי, החקירה מובילה את הצוות למצוד אחר ציור גנוב שבתוכו מכשיר האזנה שהושתל ע"י טרוריסטים. אביו של טוני מצטרף לחקירה.
לאחר שגופתה של גנבת מתגלה בביתו של נחת, הצוות מגלה כרטיס ביקור של ארגון טרור שדלילה ומשרד ההגנה עוקבים אחריו. הדבר גורם למתח ביחסים בין מקגי ודלילה כשהם נאלצים לשתף…
דינוזו חוזר לפנימייה הצבאית שבה היה חניך אחרי שחייל מחיל הנחתים ובוגר הפנימייה נמצא מת כשצילום של אחת החניכות בידו, בינתיים, בישופ ובעלה מחליטים להזמין את הצוות לארוחת ערב.
גיבס והצוות ממשיכים במצוד אחר הטרוריסט הרוסי סרגיי מישנב לאחר ששני חיילים בצי נהרגים בפיצוץ, בינתיים הסוכן פורנל מתקשה להתמודד עם מותה של גרושתו וגיבס נרתם לעזרתו.