גורדון זוכה לטעימה של החיים בכלא, ובולוק מוסר חדשות מצערות. במקום אחר, הפינגווין מתמודד עם משפחה לא מתפקדת.

בזמן שגורדון ובולוק חוקרים שוד במוזיאון, הפינגווין מתאחד עם כמה חברים ותיקים. ברוס בוחן את חוכמת הרחוב שלו.

הפינגווין ממשיך בעבודתו עם הוגו סטריינג', שבטוח שהוא יכול "לרפא" את התוקפנות שלו. ברוס נשבע מחדש למצוא את הרוצח של הוריו.

אלפרד משתף מידע חדש לגבי האדם שרצח את הוריו של ברוס. המשטרה מתכוננת להעביר אסיר חדש למוסד ארקהאם לחולי רוח.

גורדון מתכונן לעדות חשובה. בינתיים, יש פושע חדש ומצמרר בגות'האם והוא מקפיא אנשים למוות.

ד"ר הלסטד וד"ר מנינג מתמודדים עם שני אחים מסוכסכים שנפגשים כשאחד זקוק נואשות להשתלת כליה. ד"ר רודס וד"ר לייתם מטפלים בנערה עם תסמונת גנטית הזקוקה לניתוח, אך אמה מסרבת שתעבור…

אהוב נעוריה של שרון מגיע לבית החולים. הלסטד מנסה להשיג הכנסה נוספת. ד"ר צ'רלס מנסה להגן על מטופלת.

ד"ר מנינג מטפלת בחולת סרטן צעירה ונסחפת למעורבות רגשית עמוקה. נערה חובבת מדעים מגיעה עם חסימה לא ברורה במעי.

תאונה במרתון שיקגו מכניסה את עובדי הרפואה לפעילות נמרצת. ילדה ההולכת ומאבדת את שמיעתה גורמת לצוות לתהות על קנקנה של האם המלווה.

הבת של ד"ר צ'רלס מצטרפת למחלקת האפידמיולוגיה וחוקרת מקרה של הידבקות בזיהום נדיר.

סודות משפחה מתגלים כשאחותה של מגי באה לביקור. ד"ר רודס מנסה להימנע מהיתקלות בד"ר לייתם.

ד"ר צ'וי מדריך איש חיל הים שעומד לצאת למשימה בחו"ל. בינתיים הרופאים מטפלים בשני תינוקות חולים מאוד, וייאלצו לקבל החלטה קשה.

בפרק הראשון לעונה השנייה, רופאי שיקגו מד נתקלים בכמה שינויים. ד"ר צ'רלס משכנע מישהי להתמחות אצלו.

פרק סיום העונה. ד"ר דאוני מאבד הכרה בביתו, מובא למיון ועובר ניתוח, אבל רודס חושד שזה לא כל הסיפור. למיון מגיע תינוק שמצבו מתדרדר במהירות, ונטלי ושרה מנסות לברר ממה…

לחדר המיון מגיעים אלכוהוליסט בקריז שד"ר הולסטד מחליט לגמול אותו בניגוד לרצונו, עד יהווה שחטף התקף לב וזקוק לניתוח אבל מסרב, וקשישה שסובלת מתסמינים מוזרים. נטלי מאבדת את טבעת הנישואין.

למיון מגיעים גבר דמנטי שנפצע בתאונת דרכים, אבל ד"ר צ'רלס לא בטוח באבחנה שלו, ובחורה שהכלב שלה נשך אותה, לכאורה, ללא שום סיבה מיוחדת. ד"ר צ'וי מתלווה לפרמדיקים ומגיע איתם…

לחדר המיון מגיעים ילדה בת 16 שסובלת מכאבים, אבל לא מוכנה לקבל תרופות כי אבא שלה נרקומן. אישה שיש לה רעלת היריון, והיא מסרבת ללדת לפני הזמן כי היא פונדקאית.

למיון מגיעים חייל משוחרר שטוען שהדופק שלו משגע אותו, ונוקט צעד קיצוני כדי לקבל יחס, משפחה שבה האם ואחד הילדים פצועים, והצוות חושד בהתעללות, וצעירה שהתהפכה עם המכונית.

לחדר המיון מגיעים אישה שחדר לראשה גוש קרח ולבעלה יש בקשה חריגה, ילד שבלע מגנטים שמסכנים את חייו ובחור שניסה לכרות לעצמו את היד, וד"ר צ'רלס חושב שהוא לא משוגע….