הנגיף מתחיל להתפשט בעיר ומסכן את מעבדת גותהאם שמפתחת תרופה. גורדון ומריו מתעמתים לפני החתונה.

איום חדש צף על פני השטח בדיוק לפני ארוחת הניסיון של לי ומריו. ברוס מתחיל לחשוף את הסודות שאופפים את מסדר הינשופים.

גורדון מפציר בבולוק לחקור את בארנס. ניגמה מקבל בשורות קשות ופונה לפינגווין. אייבי מתוודה בפני ברוס וסלינה.

בארנס מתחיל לאבד את שפיותו. ניגמה מנסה להתמודד עם הקשיים בקשר שלו עם איזבלה. פאלקון עורך מסיבת אירוסין לכבוד לי ומריו.

בעקבות מפגש עם הכובען המטורף, גורדון מוצא את עצמו בעומקה של "מאורת ארנבים" פסיכדלית. פינגווין מתקשה לקבל את הקשר החדש של ניגמה.

כובען סדיסטי מציב בפני גורדון דילמה בלתי אפשרית. אדוארד "אד" ניגמה חובב החידות מחדש את הקשר עם דמות מעברו.

ברוס מחפש את אייבי. ראש העיר החדש קובלפוט נדרש לקיים את ההבטחות שהבטיח במסגרת הקמפיין שלו – ולהתמודד ועם שיעורי פשיעה חסרי תקדים.

פינגווין מוביל במרוץ לראשות העיר גותהאם. ברוס ואלפרד יוצאים לחפש את הכפיל של ברוס, שאימץ לחלוטין את זהותו של ברוס.

ג'רוויס טץ', הלוא הוא "הכובען המטורף", מגיע לגותהאם, וגורדון מתגייס לעזור לו למצוא את אחותו האבודה אליס. פינגווין נערך למרוץ לראשות העיר.

פרופסור סטריינג' עדיין מסתובב חופשי, ופיש נחושה למצוא אותו. גורדון והעיתונאית ואלרי וייל נחושים למצוא את פיש.

גורדון יוצא לרחובות גותהאם כצייד ראשים במטרה לאתר את הוגו סטריינג', מדען מטורף ונבל-על, ואת פיש מוני, פושעת שסטריינג' החזיר לחיים.

פרק סיום העונה. במעמקי המעבדה של פרופסור סטריינג', גורדון עובר תהליך תרופתי שמשנה אותו. בינתיים, איום חדש מרחף מעל גות'האם.

בעזרת גורדון, לושיוס ואלפרד, ברוס יוצא להציל את סלינה. אבל קודם כל, עליהם למצוא את המעבדה הסודית של פרופסור סטריינג'.

השבועה של אזראל להרוג את גורדון מעודדת את הפינגווין לצאת מהמסתור. אבל תוך זמן קצר, ברוס הופך למטרה החדשה.

בזמן שגורדון מתשאל את פרופסור סטריינג' לגבי עבודתו בחוות פיינווד, פושע חדש ומסוכן מתכוון לפגוע בעיר.

ברברה פונה לגורדון בניסיון לתקן את מערכת היחסים שלהם. ברוס ואלפרד מחפשים אחר אחת מהשותפות הוותיקות של תומס ויין.

כשגורדון הנואש מנסה לטהר את שמו, הפינגווין מגלה את האמת המפתיעה על מותו של אביו.

גורדון זוכה לטעימה של החיים בכלא, ובולוק מוסר חדשות מצערות. במקום אחר, הפינגווין מתמודד עם משפחה לא מתפקדת.

בזמן שגורדון ובולוק חוקרים שוד במוזיאון, הפינגווין מתאחד עם כמה חברים ותיקים. ברוס בוחן את חוכמת הרחוב שלו.

הפינגווין ממשיך בעבודתו עם הוגו סטריינג', שבטוח שהוא יכול "לרפא" את התוקפנות שלו. ברוס נשבע מחדש למצוא את הרוצח של הוריו.

אלפרד משתף מידע חדש לגבי האדם שרצח את הוריו של ברוס. המשטרה מתכוננת להעביר אסיר חדש למוסד ארקהאם לחולי רוח.

גורדון מתכונן לעדות חשובה. בינתיים, יש פושע חדש ומצמרר בגות'האם והוא מקפיא אנשים למוות.