חלק מעברה של הטי נחשף כאשר סוכן סי-איי-איי לשעבר שעבד איתה בשנות ה-80 נקלע לפיצוץ מסתורי.

כל הסוכנים הרוסים הרדומים עונו ונרצחו והצוות יוצא לחיפוש נואש אחרי הפצצות הגרעיניות. בינתיים, נחשפת האמת בנוגע למישל, אשתו של סאם.

מדען אזרחי שעובד עם חיל הים נרצח בנסיבות מסתוריות וצוות אן-סי-איי-אס נחשף לרשת ריגול מורכבת.

סאם מקבל הודעה מטרידה מעמית ותיק ומוצא אותו תלוי. הצוות מתחיל לחקור את האירוע. עם הופעתו של סוחר נשק חסר רחמים סאם מתעמת עם עברו.

אירוע שנראה כתאונת פגע וברח מתברר כקנוניה לרצח מועמדים שמשתתפים במירוץ לסנאט.

בתקיפת מזל"ט נגד מתקן לייצור פצצות באפגניסטן נמצאים שרידיו של חייל אמריקני. לצוות האן-סי-איי-אס אין ברירה אלא לחקור אם מדובר בנחת שבגד בארצו.

ארבעה אנשים נהרגים בפיצוץ במזנון. ארבעתם היו חלק מקבוצה שהשתתפה במיזם מיוחד של מודיעין חיל הים. בקבוצה המקורית היו חמישה וכעת צוות אן-סי-איי-אס מנסה לאתר את האיש החמישי.

קאלן מושעה אחרי שירה בז'נבייה לעיני המצלמות והטי פרשה ומנסה להסתגל לחייה החדשים. האיראנים מנסים להשיג את הקובץ המפליל של קלווין אטלי וללכוד את המרגל שפועל למען ארה"ב בטהרן.

מונעת על ידי נקמה, "הזיקית" מאתגרת שוב את צוות אן-סי-איי-אס כשמשימה סודית נתקלת במשחק מוחות קטלני שנוצר במחשבתו של פושע העל.

מונעת על ידי נקמה, "הזיקית" מאתגרת שוב את צוות אן-סי-איי-אס כשמשימה סודית נתקלת במשחק מוחות קטלני שנוצר במחשבתו של פושע העל.

קנזי ודיקס עוברים לגור יחד תחת מסווה בפרברים כדי לאתר סוכן רוסי רדום.

נייט גטס מבקש עזרה מצוות אן-סי-איי-אס כאשר האף-בי-איי מאשים חייל מארינס לשעבר בהכנת פצצה כימית.

בפרק קרוסאובר מיוחד, כח משותף של אן-סי-איי לוס אנג'לס והוואי חמש-אפס יוצאים חזרה אל היבשת ועוקבים אחרי חשוד המאיים להפיץ וירוס קטלני.

רגע לפני שקבוצה של הקומנדו הימי יוצאת למשימת חילוץ בני ערובה, נאלץ סם לחקור אותם כדי לגלות מי רצח את קצין מודיעין חיל הים.

ירי בקרבת הקונסוליה הויאטנמית עלול לאיים על כנס בינלאומי המתקיים בקונסוליה. צוות אן-סי-איי-אס מתמנה להעריך אם הירי היה או לא היה פיגוע טירור, לפני הגעתם של בכירי חיל הים.

הצוות ממשיך להיאבק על חפותה של קנזי.

קנזי נעצרת בחשד לרצח של חבריו ליחידה של אביה, והצוות נלחם על חפותה.

הבטחון הלאומי נמצא תחת איום בעקבות דבר מה שנעלם בעת חטיפת רכב שירות דיפלומטי. לאחר חמש שנים כשותפים, קאלן וסאם עומדים בפני אתגר גדול במיוחד.

רוצח בינלאומי, המסוגל להחליף זהויות בהתאם לצרכיו, הצליח להתחמק מהחוק ברחבי העולם – ואפילו מקאלן. הפעם חייב צוות אן-סי-איי-אס לתפוס אותו אחת ולתמיד.

סאם נאלץ להתמודד עם ג'דה לראשונה מאז סודן.

נל הולכת לעבוד במסווה בכדי לעזור לצוות למצוא רוצח. עוזר המנהל החדש מפקפק ביכולות המנהיגות של הטי.

החגים מסיחים את דעת הצוות, עד שהם לומדים על מכשיר שיכול להרוס את העיר כולה.

מבצע משולב עם הסי-איי-איי מוביל לכך שסם נעדר בסודן וקאלן ושאר הצוות יוצאים לחפש אחריו.

דיקס מפוטר ונשלח חזרה למשטרת לוס אנג'לס וקנזי נותרת להתמודד עם הרגשות שלה.

הצוות מגיע למקסיקו על מנת לחקור מקרה הקשור בהברחה.

חייל מכה תייר למוות והצוות חוקר.

מפקדת לשעבר נהרגת מירייה. קאלן והצוות מוצאים רמזים מבלבלים וסותרים בנוגע למקרה.

בעת פשיטה שוטרים הורגים שני חברים בכנופיית סמים מקסיקנית וטרוריסט מוסלמי, והמשטרה פונה לקאלן לעזרה למצוא את הקשר בין הקבוצות.

שדרנית טלוויזיה נרצחת ומתברר שהיא קיבלה איומים על חייה מפעילים לוביים.

סמל נהרג בפיצוץ והצוות חוקר את מה שהופך לסדרת פיצוצים.

שני בריונים במסכות חוטפים מתכנת עשיר בבברלי הילס וקאלן והצוות מסייעים לסוכנות לביטחון לאומי.

בפרק הפותח את העונה, ג'י, סם, קנזי ודיקס חוקרים את השכונה בעיירת חוף ברומניה בעוד שהאטי מדברת עם ראש משפחת פשע מקומית.

בסיום העונה השנייה, הצוות מחפש את הטי ומנסה לגלות מה גרם להתפטרותה ולהיעלמותה הפתאומית.

מותו של חייל בחיל הים נותן לצוות רמז לגבי מיכל חסר ששימש לייצור פצצות קטלניות.

לאחר שמומחה טילים נהרג, אריק יוצא לשטח כסמוי בפעם הראשונה. הטי רוצה להיות בטוחה שטכנולוגיית לווין שנמאת תחת סיווג, מאובטחת מספיק.

דיקס משמש כסמוי כדי להגן על ידיד שהוא המודיע העיקרי במקרה של סחר בנשק.

גניבה שהתרחשה בבסיס של חיל הים הובילה את קנסי למשימה סמויה כגנב במטרה לגלות מה הפושעים מנסים להשיג.

קצין מודיעין ימי מקבל את האחריות במעקב אחר פוליטיקאי מונצואלה שנעלם, והסוכנים מאמינים כי חייו של הפוליטיקאי עלולים להיות בסכנה.

סם וקלן מגיעים לתימן כדי לצוד מנהיג טרור ולהציל את בנו החטוף של נסיך סעודי.

דיקס נורה במהלך שוד של חנות מכולת, והחקירה מתמקדת בשאלה אם הוא היה היעד או עובר אורח תמים.