במהלך בילוי של אחר-הצהריים על החוף, אישה לוקה בהתקף זעם, דוקרת אדם זר למוות וגורמת לזעזוע ברחבי העיירה הקטנה שבה היא חיה.

נתניאל וסיביל מתקרבים עוד יותר למחיקת ש.י.ל.ד. מדפי ההיסטוריה, ועל הסוכנים להסתמך על יתרונותיהם כדי להערים על הכרוניקומים ולהישאר בחיים.

בפרק 13 והאחרון לסדרה, אנשי הצוות יוצאים למשימתם האחרונה ביחד בתקווה לעתיד טוב יותר.

נתניאל וסיביל ממשיכים במלחמה כדי להרוס את ש.י.ל.ד, וסוכני ש.י.ל.ד מנסים לברר למה קורה הגיעה אליהם.

הצוות מגיע ל-1983. נתניאל וקורה עובדים במרץ על הקמת צבא. על דייזי הוטל להגן על ג'יאיינג, והאחרים מגלים שעליהם להתמודד עם אויב נוסף בעל כוחות-על כדי לעצור את מאליק.

סערת זמן מחוללת שמות בזפיר ומעיפה אותה לנתיב הרס, ובו זמנית דייזי וקולסון נאלצים לחוות שוב ושוב ניסיונות כושלים להצלת הצוות.

הילוך הזמן של הזפיר תקול, והתקווה היחידה להיחלץ מאסון מונחת על כתפי יו-יו, לשם כך עליה להיעזר ביריבה מן העבר שתעזור לה להשיב לעצמה את היכולת.

מאק, שהועבר ל-1982, פורש לבית ילדותו כדי להתמודד עם מות הוריו. דיק מחפש קבוצה של סוכנים חדשים.

לאחר שנאלצו לחשוף את מיקום הזפיר בפעולה הקודמת, על הצוות לנסות לחלץ את ההורים של מאק ולהציל את ש.י.ל.ד מהסתננות הכרוניקומים.

הסוכן קולסון מבין את החשיבות של 22 ביולי 1955 בדפי ההיסטוריה של ש.י.ל.ד ועושה הכל על מנת לשמור על המצב הקיים.

נחשפת זהותו של האיום שעלול להרוס את ציר הזמן, וכעת הצורך להגן עליו בכל מחיר גורם לכל סוכן לפקפק בערכים שלו.

העונה השביעית והאחרונה תתמודד עם מסעות בזמן, תחזיר למסך כמה דמויות אהובות ותסגור קצוות עלילה שנותרו מהסרטים, מעונות קודמות וגם מסדרת הבת.

הזמן אוזל והצוות נאלץ לעשות את הבלתי אפשרי כדי לעצור בעד איזל.

בפרק האחרון לעונה, נראה שהמצב מחמיר מרגע לרגע ועל כמה מאנשי הצוות לנקוט אמצעים קיצוניים בתקווה להציל משהו.

מיי ודייזי מנסות לדובב את סארג' כדי לגלות מיהו באמת. פיץ, סימונס ודיק מנסים למצוא דרך להרוג את אייזל, ואייזל מספרת למאק ויו-יו על התוכניות שלה.

בניסיון להתמודד עם החיה שמדלגת בין גלקסיות וטורפת כוכבים הצוות שבכדור הארץ מבקש את עזרת האנשים הלא נכונים. בחללית קורה משהו מוזר לצוות של אייזל.

הצוות נאלץ לפעול במהירות להצלת כדור הארץ וכמה מהם זוכים לעזרה ממקור מפתיע.

הסוכנים תופסים שני חייזרים מכונפים אך מגלים שקשה מאוד לכלוא אותם. צמד המדענים וחברם חוזרים בטעות לכוכב קיטסון וכעת עליהם לצאת משם בלי להיתפס.

צמד המדענים שהצליחו למצוא זה את זה נגד כל הסיכויים נאלצים לפתור עכשיו אחת מחידות היקום, אך לשם כך עליהם להתגבר על הבעיות האישיות.

סוכני ש.י.ל.ד שבחלל מתמודדים עם איום בלתי צפוי. בכדור הארץ הסוכנת הוותיקה מנסה לגלות מיהו האיש שעוטה את דמותו של המנהל לשעבר ומהו היצור המעופף שהורג אנשים.

שני סוכנים שהתקרבו לאחרונה מחליטים לפרסם את הזוגיות. חייזרים טפיליים מאיימים על המין האנושי ומישהו ממש חייב לשתות תה בועות טאיוואני.

פיץ וחנוך מתמודדים עם בעיות משלהם בחלל, סארג' וצוותו ממשיכים במשימתם המסתורית בכדור הארץ.

פיץ וחנוך מנסים את מזלם בקזינו, דייזי וסימונס מוצאות את עצמן במצב הרבה יותר ססגוני ומעניין.

עונה שישית לסדרת המד"ב רווית האקשן מבית היוצר של "הנוקמים". העונה, הצוות ינסה להתאושש מהמשבר ויחפש אחר פיץ שנשאר מאחור בזמן שהם שוגרו לעתיד, כשהמנהיג החדש הוא מאק.

בפרק האחרון לעונה, על הצוות להחליט אם להציל את חייו של קולסון או שלא, כי ההחלטה הלא נכונה תגרום להרס כדור הארץ.

טלבוט הנחוש והחזק לוקח את קולסון לפגישה עם האויב, בניסיון למנוע את הרס כדור הארץ. במקביל, דייזי יצאה לחפש אחר החומר שיעזור לקולסון להאריך ימים.

עתידה של דייזי כמשמידת העולמות עלול להשתנות משמעותית. בינתיים, טלבוט חוזר הביתה, פיץ-סימונס מנסים לרקוח תרופה מהחומרים שדייזי הביאה.

הצוות מוצא עצמו לכוד במגדלור בטעות וגם תחת מצור מגורם חיצוני. עכשיו עליו לנסות ולהיחלץ משם, תוך הדיפה של אויב בעל יכולות על אנושיות.

על הצוות למצוא דרך לעצור בעד רובי לפני שתיווצר תגובת השרשרת שתוביל להרס כדור הארץ, כפי שרובין חזתה.

פיץ-סימונס ויו-יו מנסים לנטרל נשק שעלול לגרום להרס כדוה"א. בינתיים, קולסון ודייזי מבקשים את עזרת טלבוט באיתור המיקום של גנרל הייל.

קולסון נאלץ לחבור לבעלי ברית מפתיעים כדי להציל את העולם. בינתיים, הצוות שלו מנסה לאתר אותו כדי לחלצו, ג'מה וסימונס מנסות לשכנע את מאק, שישחרר את פיץ.

קולסון מגלה את המניע האמיתי של גנרל הייל, ואם ש.י.ל.ד. לא יצליחו לעצור בעדה, ייתכן שזה מה שיחריב את העולם.

פיץ וסימונס מתמודדים עם אחד הפחדים הכי נוראים שלהם בעודם מחפשים דרך לאטום את הקרע. בינתיים, קולסון ושאר הצוות תופסים את גנרל הייל.

הצוות יוצא לחפש גרביטוניום על מנת להציל את העולם ובינתיים, גנרל הייל מנסה להוציא מידע מבנו של בכיר לשעבר בהידרה.

קולסון וצוותו יוצאים לשכתב את גורל האנושות, אך הם לא מודעים לכך שהשינויים שיבצעו עלולים לגרום נזק קשה למישהו מהם.

הפרק המאה של הסדרה. קולסון מגלה את ההסכם שעשה בסתר עם גוסט ריידר, שכעת משפיע על כל אנשי הצוות.

לצוות נותר סיכוי אחרון לשוב אל ציר הזמן הטבעי שלהם, אך למעשים שלהם עלולות להיות תוצאות הרסניות.