כאשר הצוות מוצא את מרלין בכבודו ובעצמו, עליהם לסייע לו להשלים את בניית הסנגראל לפני שאדריה וכוחותיהם של האוריי יוכלו לאתר אותם.

ס"ג-1 נמצאים במירוץ נגד בעל בחיפוש אחר הסנגראל, נשקו של מרלין נגד האוריי, ונתקלים בסדרה של ניסויים עתיקים.

כשהיא מבוהלת עם שכחה ובמנוסה, ואלה לוקחת עבודה כמלצרית כשהיא מנסה לחבר את חלקי הפאזל בנסיון להיזכר מי היא ומה קרה לה.

קמרון מיטשל חייב לפעול תחת מסווה בתוך הברית הלוסיאנית הקטלנית כדי למנוע מחבריו לקבוצה מלהפוך לנפגעי מלחמת האזרחים בין הברית.

הג'אפה לוקחים את הקרב אל אוריי, באמצעות נשק רצחני ובעל הרס על גבי ספינות המלחמה החדשות שלהם כשהם מנחיתים את ס"ג-1 לתוך מלחמה בה הם לא יכולים לשלוט.

פרק ה-200, אשר כולל בין היתר מחוות לקלאסיקות קולנועיות ("הקוסם מארץ עוץ") וסדרות הז'אנר ("פארסקייפ", "מסע בין כוכבים"), בהופעת אורח מיוחדת של ריצ'ארד דין אנדרסון.

טיאלק מגלה עולם שבו אנשים מותקפים באכזריות על ידי יצור חמקמק, המוביל את ס"ג-1 לגילוי מדהים על מוצאה הפוטנציאלי של החיה.

דניאל וואלה מגיעים לאטלנטיס בחיפוש אחר נשקו של מרלין נגד האוריי, בעוד סם ומיטשל חוברים לד"ר מקיי כדי לנעול את שער-העל של האוריי.

כאשר בעל מגיע לכדור הארץ ומבקש עזרה, מפקדת הסטארגייט חייבת ללכוד את שיבוטיו ולקבוע איזה מהם הוא המקור האמיתי.

הצוות מסתבך בצרות במהלך חיפושיו אחר נשק שיאפשר להם להתמודד עם האוריי. ואלה עוברת הערכה פסיכיאטרית, שתוצאותיה משעשעות למדי.

בפרק הפותח את העונה העשירית והאחרונה, הצוות מתאחד בדיוק בזמן כדי להילחם בפלישת האוריי לכוכב צ'ולאק. ואלה יולדת בת שמתבגרת בקצב יוצא דופן כדי לשרת את מטרת האוריי.

פרק אחרון לעונה. נמצא שער-העל של האוריי ואנשי הצוות ובעלי בריתם יוצאים לנסות להשמידו. דניאל ומיטשל מנסים לחפש את הנשק שפיתח מרלין. הקרב המכריע על עתיד הגלקסיה מתחיל שוב.

ואלה מאל דוראן, הגנבת הבין גלאקטית וגיבורת המלחמה נגד האוריי, שנחשבה לנעדרת, מצליחה ליצור קשר עם הפיקוד דרך גופו של דניאל. היא מזהירה מפני מתקפה גדולה של האוריי.

קרטר מצליחה להפעיל את אחד מהמתקנים שמצאו ומוצאת את עצמם לכודה עם מיטשל בפאזה אחרת. בינתיים מגיעה קריאה בהולה לעזרה מצד הסודאן, שנפלו קורבן להתקפה של הכוהנים.

הצוות נשלח ללוות משלחת של הוועדה הבינלאומית לסיור באחד הבסיסים. זן חרקים קטלני במיוחד פושט על הבסיס ומאיים להשמיד את כל הנקרה בדרכו. הצוות צריך להתמודד עם התפשטות החרקים.

הצוות יוצא להתחקות אחר מקורו של זן תירס שממכר מאוד. מיטשל נכשל בנסיונו להתחזות לסוחר סמים ולקנות יבול של הצמח המסוכן והצוות נופל בשבי מגדלי הצמח.

נציג של כוכב לכת בא לבקש את עזרת הצוות בבלימת ניסיון השתלטות נוסף של האוריי. דניאל מציע פיתרון דיפלומטי שאינו מתקבל, מפני שהצדדים אינם מסוגלים להגיע להסכמה ביניהם.

אחת מחברות מועצת הג'אפה משנה פתאום את הצבעתה בהכרעה – האם אומת הג'אפה צריכה לקבל על עצמה את דת האוריי, והיא לא היחידה. מי השפיע על חברי המועצה לשנות את…

בגלל תקלה במערכת השערים, צוותי ס"ג-1 מכל היקומים המקבילים נוהרים לפיקוד. גנרל לנדרי ואנשיו צריכים למצוא פתרון לתקלה, להחזיר כל צוות ליקום שלו ולהתמודד עם צוות בעל תוכנית נסתרת.

הפיקוד מקבל הצעה שאי אפשר לסרב לה – מתקן להשתלת זיכרון שמקצר במידה ניכרת את תהליכי הלימוד ומיטשל מוצא את עצמו מואשם ברצח. כדי להוכיח את חפותו עליו להתמודד עם…

קרטר ואורלין מחפשים בקדחתנות תרופה למגיפה, טיאלק וברייטק מנסים למנוע את כניעת הג'אפה לאוריי, שהפכו את ראש המועצה לכוהן. מיטצ'ל וג'קסון נערכים בעזרת הסודאן לניסוי הנשק החדש שאמור לבלום את…

תקלה במערכת השערים גורמת לצוות לצאת ולברר את מקור התקלה ומוצא אדם שקוע בתרדמת. כאשר מעירים אותו מתגלה שהוא צאצא גנטי של אנוביס, שמתקרב לשלב ההתעלות וכוונותיו זדוניות באותה מידה.

כשקצין ס"ג שנדבק בוירוס חוזר לכדור הארץ, ארה"ב נדבקת בוירוס תוך זמן קצר. אורלין, שלא מעוניין ש-"שביל החלב" יפול לידי האוריי, חוזר להיות אדם רגיל על מנת לעזור לקרטר למצוא…

הצוות נתקל בסודאן – קבוצת ג'אפה שעל-פי האגדות מעולם לא היו משועבדים לגאולד ונאלץ להתעמת. מיטצ'ל נדרש להילחם בדו-קרב כדי לכפר על הרג אחד מהג'אפה, ואינו יודע שאותו ג'אפה לא…

גילויו של ג'אפה מת בכדור הארץ חושף מזימה של שרידי הנאמנות, שמסתבר כי עודנה חיה וקיימת ונתונה לשליטתו של בעל, שאף הוא עודנו חי. מכאן ואילך העניינים מסתבכים.

קבוצת ג'אפה שמחליטה לא להיכנע לאוריי נתונה בסכנה. כוחות הג'אפה והפיקוד חלוקים בדעותיהם ביחס לאופן ההתמודדות עם האיום החדש. נרוס מציע לשתף פעולה עם הפיקוד במלחמה נגד האוריי.

כדי להשתחרר מצמיד הג'אפה ואלה ודניאל צריכים לאתר ולהשיב את החפצים שוואלה גנבה מבעליו הקודם של הצמיד.

חברי ה-ס"ג-1 ו-ואלה נוסעים לכוכב שבו עדיין סוגדים לה, וכדי להוכיח לעם שהאורי אינם באמת אלים, הוא מגלה להם את האמת אודותיה. היא נאלצת לעמוד למשפט וייתכן אף שתוצא להורג.

צוות הסטארגייט נתקל בקבוצת מיסיונרים של "אלים" הידועים בכינוי אוריי, שאינם סובלים שום סוג של חסרי אמונה.

ואלה ודניאל ג'קסון מועברים אל גופם של שני אנשים בגלקסיה רחוקה, שנמצאת על כוכב המאוכלס ע"י אנשים הסוגדים ליישות מוזרה.

קמרון מיטשל מגיע למפקדת הסטארגייט כחבר החדש בצוות ס"ג-1 ומגלה שהצוות התפרק. כשוואלה מגיעה לכדה"א עם רמזים לשרידים של הקדמונים, מיטשל מחליט שהדבר יסייע לאחד את הצוות.

לאחר שציר הזמן השתנה בגלל פעולותיהם של ס"ג-1 בעבר הרחוק, גירסה חלופית של ס"ג-1 חייבת להשתמש במכונת הזמן שהתגלתה לאחרונה כדי להסדיר את רצף הזמן.

ס"ג-1 נוסעים אחורה בזמן בנסיון נועז לגנוב מכשיר טכנולוגי עתיק מידיו של רע, הגאולד רב-העוצמה ששלט במצרים העתיקה.

בעוד דניאל מוצא את עצמו במסעדה מסתורית, תלוי בין המוות לעלייתו, גורלו של ג'ייקוב מרחף באופן בלתי צפוי, ג'ק וסאם רואים את חייהם הרומנטיים, ואנוביס משחרר את תוכניתו להרס גלקטי.

קרטר וג'ייקוב נעזרים בבעל במלחמתם במשכפלים ואילו דניאל וקרטר המשוכפלת מנהלים מאבק מוחות עיקש, אוניל מתאם בין כל החזיתות ומרכז את הגנת הפיקוד כשברקע מרחף האיום הגדול מכולם – אנוביס.

ג'ו, ספר עצבני, פורץ לביתו של אוניל ומאשים אותו בהרס חייו. משום מה ג'ו יודע הכל על הרפתקאות ס"ג-1, הרפתקאות שבתחילה הוא העלה על הכתב וניסה לפרסם כשלו, אך כעת…

המשכפלים מתחילים התקפה שיטתית על הגאולד, מה שמאלץ את בעל לבוא לכדור הארץ לעזרה. מחתרת הג'אפה מסכנת את כל תנועתם בניסיון לתבוע בחזרה עיר קדושה מידיו של בעל.

עוד מזימה של הגאולד נחשפת כאשר סגן הנשיא המודח קינסי בא אל אוניל ומזהיר אותו מפני שותפיו לשעבר, אנשי "הנאמנות". הוא מציע לשתף עמו פעולה במאבק נגדם.

לכוכב הלכת שאליו הוגלה הארי מייבורן נשקפת סכנת נפילה בידי הגאולד והצוות נדרש לצאת לחלצו. בהגיעם לשם, הם מגלים שהתושבים הפרימיטיביים יחסית הפכו את מייבורן למלכם.

גנרל האמונד מגיע לפיקוד ומכריז על החלטתו להעביר את דניאל למפקדת משימת אטלנטיס. השניים אמורים לטוס ב-"פרומתיאוס" לאטלנטיס כדי לברר למה אבד הקשר עם המשלחת.