הצוות מנסה לברר מה עלה בגורלה של גופה, שנמצאה במצב ריקבון מתקדם וללא רגליים. החקירה מובילה את השניים לבקתה מבודדת ביער, שהמבקרים בה מבצעים תעלולים קשים.
בפרק האחרון לעונה, בונז מסתבכת בחקירת גופה של אישה צעירה הנמצאת בעגלת קניות, משום שהעצמות מזוהות בטעות כעצמות אישה בת 80. אביה של בונז מופיע ובפיו מידע חדש על עברה.
גופת אדם נמצאת אחרי נפילה מסתורית מהשמיים. בות' ובונז מנסים לגלות מי האיש, ואילו הודג'ינס מפתח תיאוריות על חייזרים. כאשר זהות המת מתגלה, נפתחת פרשת רצח שקשורה לאסטרונאוטים.
שלד נמצא מוסתר בתוך בטון. בות' ובונז פותחים בחקירה ומסתבכים עם ראש משפחת הפשע בעיר. כאשר בות' נחטף, בונז נאלצת לעשות את הבלתי ייאמן על מנת להציל את חייו, וגם…
רב המכר שחיברה בונז מעורר מהומה, כשנמצאות שלוש גופות ומסתבר שהמתים נרצחו בדומה לתיאורי הרצח בספרה. בונז חוששת שהמדובר בשלושה רוצחים שונים, מה שמסבך מאוד את החקירה.
בות' ובונז מגלים שרוצח סדרתי ברח מהכלא. הוא מבקש לנקום באופן שיכול לסכן את בנו הצעיר של בות' וגם את בונז עצמה, הזקוקה להגנת האף-בי-איי. חיי קאם בסכנה אחרי שאיפת…
בות' ובונז נקראים לזירה כשגופת אדם במצב מזעזע נמצאת תלויה על גג בניין. הראיות בשטח קושרות את המקרה לפרשה אחרת לפני יותר מ-30 שנה, שאביה של בונז היה מעורב בה.
בונז חוקרת את מקרה מותו של סטודנט לקולנוע, שצילם סרט דוקו' על מכשפה ללא ראש. במהלך החקירה היא נקשרת לאחי הקורבן. בות' ובונז דנים בעירוב שנוצר בין החיים האישיים והמקצועיים.
הצוות עולה על עקבות רוצח שקובר את קורבנותיו לפני שהוא מבקש כופר. במהלך החקירה, בונז ועמיתה לעבודה הופכים בעצמם לקורבנות שלו ונאלצים לפתור את המקרה מתוך קבר תת-קרקעי.
בונז ובות' בוחנים שרידי ילדה שכנראה נרצחה בידי רוצח סדרתי שכבר נתפס. סימנים על הגופה מצביעים על הקורבן הבא, והצוות יוצא למרוץ נגד הזמן למנוע את הפגיעה הנוספת.
גופת ילד צעיר מתגלה כשמשאית זבל מתהפכת על מקומה. ילדה ממשפחת אומנה הופכת החשודה המרכזית בפרשה, ואז כולם מאשימים את המערכת ומצליחים להרגיז את בונז, שגדלה בעצמה בתוך משפחות אומנה.
בונז ובות' חוקרים את שרידי גופתה של נשואה טרייה שהיתה בהריון בעת מותה, ושהיעלמותה הפתאומית עשתה כותרות ברחבי המדינה. בות' כועס כשחברתו לשעבר נותנת לבנו לבלות עם בן זוגה החדש.
בונז מקבלת מספר עצמות שעליה לזהות ונדהמת לגלות שהן שייכות לאמה, שנעלמה לפני 15 שנה. הממצאים המזעזעים שמתגלים במהלך החקירה, מחייבים את בונז לבחון מחדש את עברה.
בונז ובות' חוקרים התאבדות של חייל ומגלים כי למעשה נרצח לוחם ששירת בעיראק. ככל שהבדיקה מעמיקה, גובר החשד ביחס ליחידתו, ובות' נזכר בימים שבהם שירת כצלף בצבא.
בונז וצוותה עוזרים למפקח סם קולן לברר מה קרה לבתו, שפיתחה זן מוזר של סרטן אחרי השתלת מח עצם. ככל שהחקירה הולכת ומעמיקה מזדעזעים בונז ובות' לגלות שהיא לא הקרבן…
בות' ובונז חוקרים מקרה של אצבע בת 300 שנה ושל אתר המכיל לכאורה אוצרות שנשדדו. הודג'נס נרגש מההזדמנות לקחת חלק בחקירה, אבל כשהוא נקלע לסכנת חיים, בות' ובונז נחלצים לעזרתו.
בזמן חופשה, אנג'לה מוצאת גולגולת במדבר. היא מבקשת מבונז שתעזור בזיהוי הגולגולת, כי היא חוששת שהמדובר בחברה הנעדר. אולם ככל שהחקירה מעמיקה, מתרבים גם סימני השאלה.
ברנן וזאק חוקרים התרסקות מטוס. באתר ההתרסקות נמצאים שברי עצמות שלא שייכים לנוסעים, אלא לאדם שנעדר מזה 5 שנים. ד"ר גודמן מורה לחוקרים לא לסטות מהחקירה, אבל ברנן חייבת לבדוק…
בות' וברנן יוצאים לבדוק גופה שנמצאה במכוניתו של חבר כנופיה. בזמן החקירה, יריות ממכונית חולפת מאפשרות לו לחשוד לחמוק. החקירה של בות וברנן מובילה אותם לקבר ריק ולביתו של סנאטור…
בונז ובות' חוקרים זהות גופה שנרקבה לחלוטין ושהתגלתה בסמטה לבושת בגדים לא שגרתיים. כאשר החקירה מעמיקה, הם מגלים שהיתה זו נערה מתבגרת, אשר ניהלה חיים כפולים.
ברנן והצוות שלה מובאים כדי לזהות את גופתו של אדם שנמצא במקלט אטומי. בעת ניסור בעצמותיו של האיש, זאק משחרר בטעות פטריה קטלנית, שגורמת לקבוצה להיות בהסגר בחג המולד.