ג'יין מתגושש שוב עם מנהיג הכת ברט סטילס, שמציע לו מידע על רד ג'ון, וגם על קריסטינה פריי הנעדרת.

ג'יין והצוות חוקרים רצח של עבריין ששוחרר מהכלא על סמך בדיקת דנ"א.

גיסו של ג'יין חוזר לעיר ומסתבך בחקירת רצח. למרות שהוא מסתייג, ג'יין נאלץ לבוא לעזרתו.

בפרק הפותח את העונה השלישית; פטריק ג'יין שוקל מחדש את המשכו בסי-בי-איי, לאחר מפגשו המטלטל עם רד ג'ון בסיום העונה הקודמת. באותו הזמן, הצוות חוקר שתי חטיפות שמושכות הרבה תשומת…

פרק 23 ואחרון לעונה. הצוות חוקר רצח שנעשה על ידי חקיין של רד ג'ון, וג'יין משכנע את הייטאואר לא לצרף את קריסטינה פריי לחקירה. קריסטינה, מצידה, מסתכנת ומנסה ליצור קשר…

בכיר בארגון צדקה נרצח רגע לפני שהוא עומד להרצות בנושא סחר בבני אדם. פטריק שב לשלב כוחות עם המדיום קריסטינה פריי.

גאון מתמטיקה נורה ונהרג על ידי ליצן ואחת מאצבעותיו חסרה. הצוות חוקר את המקרה ומגלה שהקורבן עבד על מכשיר חדשני לפני מותו.

ג'יין מזהה את רוצחה של קלי פלאוור וחושד כי הוא רוצח סדרתי. עם זאת, אין לו דרך להוכיח זאת. הצוות לבסוף מגלה כי האיש הוא רוצח שכיר ויוצא לתפוס אותו…

צוות הסי-בי-איי נקרא לטפל ברצח של זנדר הארינגטון, איל הון שעומד בראש חברת מדיה מצליחה. החקירה מובילה לקבוצה דתית דמויית כת.

הצוות מגלה זירת רצח חדשה, ואישה מכוסה בדם שסובלת מאבדן זיכרון. ג'יין מנסה לסייע לה. במקביל, הייטאוור מעלה על סדר היום את מערכת היחסים הרומנטית שבין ריגסבי וואן-פלט.

ג'יין והצוות חוקרים רצח של מורה פרטי, ומוצאים ליד גופתו קופסה אדומה קטנה ומסתורית. ליסבון דואגת לאחר שמדליין הייטאואר מתמנה לבוסית החדשה של הסי-בי-איי.

מדענית ממשלתית מורעלת בעת עבודתה, ונותרו לה מספר שעות לחיות בלבד. היא פונה לג'יין ולצוות הסי-בי-איי על מנת למצוא את מי שתקף אותה.

ג'יין והצוות חוקרים רצח של שף שהורעל למוות במהלך תחרות בישול.

גופתה של ליסל דאגלס, סוכנת מכירות רכב יפהפייה, נמצאת בתוך מטענו של רכב בסוכנות רכבים אליטיסטית. ג'יין וצוות הסי-בי-איי מתבקשים לחקור את המקרה.

צ'ו מקבל קריאה לזהות קורבן רצח שהכיר. המקרה פותח פתח לעברו המפוקפק של צ'ו ולחשבון לא פתור שלו עם עצמו.

גופת אישה מתגלה במקום שבו אמור להתחיל פרוייקט בנייה יוקרתי. ג'יין והצוות נחשפים לסכנות בלתי צפויות, כשכל העת מלווה אותם צוות צילום חטטני במיוחד.

צוות הסי-בי-איי חוקר רצח כפול של בני זוג הנרצחים בדרכם לכנס מחזור של התיכון. ג'יין מוצא קשר למתיחת בית ספר ישנה.

מוות באקדמיה לבייסבול מחזיר את ג'יין לעברו כילד פלא קורא מחשבות. תוך כדי פענוח תיק הרצח, הוא מנסה להנחיל לנערים הלומדים באקדמיה לקח חשוב לחיים.

קרב יריות אכזרי במטה הסי.בי.איי מחזיר את ג'יין, ליסבון ושאר הצוות למרדף אחר רד ג'ון.

צוות הסי-בי-איי חוקר את הירצחו של תכשיטן עשיר שנהרג במהלך שוד, אולם החקירה מקבלת תפנית שלילית כשהחשוד העיקרי נמצא מת.

שני מקרי חטיפה שונים נשזרים זה בזה ומינלי דורש מהצוותים של בוסקו וליסבון להתאחד כדי לפתור את התעלומה. הצוותים בעלי הגישות השונות נאלצים למצוא דרך לשתף פעולה.

בוסקו עוצר את ג'יין במהלך חקירת רצח וכולא אותו באשמת ריגול על צוותו. על אף העובדה שהוא כלוא, מצליח ג'יין לעזור לצוות של ליסבון בחקירה המתמשכת.

הסי-בי-איי חוקר את הירצחו של פרקליט מושחת, שלקוחותיו היחידים היו כנופיית אופנוענים ידועה לשמצה מלוס אנג'לס.

הצוות נקרא לאחוזת בקוורת', שם נמצאה גופה. שריף העיירה מאמין כי רוחו של וולטר בקוורת' רודפת את האחוזה והיא זו שביצעה את הרצח.

לאחר שחברי הצוות מקבלים טיפ אנונימי, הם מוצאים את גופתו של אדם שנהג לתקוף ילדים מינית וכבר נעצר בעבר ע"י ליסון. כעת היא הופכת לחשודה העיקרית ברצח.

צוות הסי-בי-איי נקרא לפתור תעלומת רצח בבית המחוקקים. מינלי, ראש היחידה, מבקש מג'יין וליסבון להיזהר במיוחד בכבוד החשודים.

בפתח העונה השנייה, מינלי מחליט להטיל את חקירת מקרה "רד ג'ון" על סאם בוסקו, כאשר הוא חושש כי לליסבון וג'יין מעורבות רגשית עמוקה מדי. אי לכך, מחליט ג'יין לפתור עוד…

פרק סיום העונה. אמה פלסקט נמצאת מבותרת בפארק מקומי, ואחותה התאומה של אמה, מיה, נעדרת. ג'יין מזהה את דפוס הפעולה של רד ג'ון, ויוצא עם הצוות בעקבותיו.

ג'ים גלברנד, מייסד ושותף בחברת תוכנה מצליחה, נמצא מת ביאכטה שלו. לכל אחד מהקרובים אליו יש סיבות טובות לרצוח אותו. ג'יין חושף את זהות הרוצח הבלתי צפוי.

ג'ייסון פרנטיס, תלמיד בבי"ס לנערים בעייתיים, נמצא מת ביער. מתברר שהתלמידים מאמינים באגדת יער אפלה המאיימת על חייהם. ג'יין משתמש בחרדות הילדים כדי לחשוף את האמת.

אדי דידריקסון, עובד במרכז משחקי וידאו נמצא מת בתוך עץ. במהרה מתברר שחייו היו סיפור כיסוי. ג'יין משתמש בכישוריו החברתיים כדי ליצור קשר עם מאפיונר בכיר בדימוס.

פליקס הנסון, עסקן ומפיק סרטים מתחיל, נמצא מת במגרש חנייה יומיים לפני התחלת צילומי סרט בהפקתו. ג'יין נאלץ להתמודד עם הבמאי, הכוכבת והבת המרדנית בדרך לפתרון התעלומה.

במחלק מתקבל דוא"ל מאת "ג'ו קיו פבליק" על רצח שצפוי להתבצע במדבר. הקורבן הוא מנהל בחברת השקעות. האם ג'ו הוא עובד זוטר שפוטר ונוטר טינה או שמא הרצח מוביל לפרשייה…

גבר בחליפה גורר שק כבד ומסתורי אל משרדי המחלק. התעלומה מובילה אל המרכז לתכנות לשוני נוירולוגי ולד"ר דניאל המניפולטיבי.

ג'יין מקבל הודעה על פצצה שהוטמנה במתחם. התפתחויות דרמטיות מובילות לפתרון מזימה מורכבת במיוחד שמעורבים בה כסף, בגידות ועברו של ג'יין כמדיום.

סקרלט מרקזה, יו"ר ועדת הנשים בקאנטרי קלאב המקומי ומעצבת תכשיטים זעירה, מתה מוות אלים במסיבה בביתה. ג'יין והצוות פותרים את התעלומה תוך ניצול רכלניותן של נשות הוועדה.

הארי, חתנו של איל הנפט איי.פי קייד נמצא מת במשרד של חמו. הפריט שנגנב מהמקום הוא ציור עתיק ויקר והחשוד הוא מולטי מיליונר רוסי שמחזיק בדרכון דיפלומטי. ג'יין והצוות ניגשים…

הצוות חוקר מקרה רצח של אישה הנשואה לאיש עסקים מצליח. החשדות מובילים לעוזרת האישית (אלונה טל) שפוטרה לאחרונה, לבעלה הנבגד ולמאהב חסר המעצורים.

קודי אלקינס, שחקן פוטבול מצטיין ותלמיד תיכון נעלם מביתו. ג'יין נעזר בילדים מקומיים כדי לאתר אותו. בעזרת מכשפה מקומית ומשפחתו הגאה של הנער חושף ג'יין צדדים לא מוכרים באישיות הנער.

ג'רד רנפרו, אסיר שהורשע באונס וברצח, מציע לג'יין סיוע במציאת רד ג'ון. מנלי מסרב לשתף פעולה וג'יין עוזב את המחלק. שאר חברי הצוות מתגייסים לעזרת ג'יין.