לאחר שפינץ' מגיע אל המקום הלא נכון בזמן הלא נכון, "השומרוני" מאתרת אותו ומסרבת לעצור עד שתלכוד אותו. חברי הצוות מתכנסים כדי להגן על החבר שלהם, אבל לא כולם ישרדו.
ריס ופינץ' נלכדים בבית חולים שהופך למוקד ההתפרצות של וירוס קטלני. המגויס החדש של "השומרוני" מהסס בנוגע למשימה שהוטלה עליו. שו ממשיכה להיאבק עם המציאות.
רוט נכנסת כסמויה לתחנת רדיו כדי להגן על מגיש של תוכנית קונספירציות הנתקל במידע שעלול להרוג אותו. סוכנים של "השומרוני" מנסים לשכנע חבר צוות שהמטרות שלהם אציליות.
ריס מגן על אנליסט במשטרת ניו יורק, שהניסיון שלו לחקור תקלת תוכנה מושך את תשומת לבה של "השומרוני". ריס ופוסקו מאוימים על ידי בעל ברית של אליאס, ששואף לנקום את…
לאחר החזרת המכונה לפעולה, מתגלים כל מיני באגים, ביניהם שגיאה בזיהוי פנים, והמכונה מזהה את הרולד, רוט וג'ון כאיומים בגלל חלק ממעשיהם בעבר, מה שמוביל לסכנות בלתי צפויות.
עונה חמישית ואחרונה לסדרת המתח מבית היוצר של ג'יי ג'יי אברהמס. בעקבות האירועים האחרונים, הצוות חייב למצוא דרך להמשיך להציל חיים בזמן שהם מנסים לתקן את התקלה ולהשיב מלחמה כנגד…
ריס ופוסקו נקלעים למלחמה בין שני פושעים, אליאס ודומיניק. רמז בנוגע למקום הימצאותה של שו מוביל את פינץ' ואת רוט למלכודת אפשרית, וקונטרול הופכת לנוכלת על מנת ללמוד את האמת…