בפרק האחרון לעונה, סקאלי ומאלדר ממהרים למצוא את ויליאם שנמצא במנוסה, בעוד איש הסיגריות ממשיך קדימה עם התוכנית האולטימטיבית שלו.

דיוויד דוכובני וג'יליאן אנדרסון חוזרים לתפקידם האייקוני כסוכני האף-בי-איי פוקס מאלדר ודיינה סקאלי ויוצאים לחפש אחר ויליאם, בנם המיוחד שנמסר לאימוץ. אך נדמה כי הם אינם היחידים.

לקס מנסה להפוך חייל, שכביכול, מת באפגניסטן, ל-"חייל-על". סנאטור מאיים לספר לעולם על המעבדות של לקס, מה שגורם ללקס לשלוח את ה-"חייל" כדי להרוג את הסנאטור. לויס רואה את ההתקפה…

ג'ימי מאבד את ההכרה וחולם על איך יכלו להיות החיים בסמולוויל בשנות ה-40 – קלארק הוא עיתונאי ב-"דיילי פלאנט", לאנה היא אישה מפתה שמתכננת את מות בעלה העשיר, לקס, ולויס…

ס"ג-1 מוצאים חברה נוצרית מימי הביניים שסרה למרותו של סוקאר ששולט בהם באמצעות פונדקאי אונאס, כשהצוות מנסה להוכיח להם שלא מדובר בשדים מהגיהנום, הם מואשמים בהיותם אחוזי דיבוק.