אנשים רבים מגיעים כדי להתאבל על מותו של ליאו ביחד עם צוות הבית הלבן. סנטוס מתמודד עם בחירת סגן הנשיא. ג'וש מזהיר אותו מפני התערבות בבחירת דובר בית הנבחרים.

סי-ג'יי מנסה לקדם הצעת החלטה באו"ם לסנקציות על סודן, כדי לעצור את רצח העם שם. במקביל מתחדשים יחסיה עם בן זוגה לשעבר, דני קונקונן.

סנטוס מתעמת עם ג'וש לגבי דרך הניהול שלו והנושאים שבהם יש להתמקד; ג'וש נתקל בדונה, שעובדת עבור סגן הנשיא, המתחרה בסנטוס במירוץ לנשיאות.

הנשיא מנסה להגיע בזמן לארוחה עם שלוש בנותיו, אך מעוכב ע"י משבר בני ערובה בסודאן ופרשייה של המתת חסד המעוררת סערה בציבור. בנוסף לכך, הנשיא לא מרוצה מאף אחד מבני…

לסלי ובן נוסעים לעיר הולדתו של בן כדי שבן יקבל את מפתח העיר. בן חושב שאחרי כל השנים הללו סלחו לו על הקטסטרופה של אחד הפרויקטים שהוא יזם במהלך כהונתו,…

רוצח אכזר מסתובב חופשי בסטורי-ברוק ורובי היא החשודה העיקרית. בינתיים, גילוי חדש של לירוי יכול לסייע לאמה ומרי מרגרט לשוב לביתן.

בפרק האחרון לעונה, סקאלי ומאלדר ממהרים למצוא את ויליאם שנמצא במנוסה, בעוד איש הסיגריות ממשיך קדימה עם התוכנית האולטימטיבית שלו.

דיוויד דוכובני וג'יליאן אנדרסון חוזרים לתפקידם האייקוני כסוכני האף-בי-איי פוקס מאלדר ודיינה סקאלי ויוצאים לחפש אחר ויליאם, בנם המיוחד שנמסר לאימוץ. אך נדמה כי הם אינם היחידים.

אנשים ברחבי המדינה נופלים למשכב ופאניקה נרחבת מאיצה בסקאלי לנסות למצוא תרופה. בינתיים, מאלדר מתעמת עם האיש שהוא מאמין עומד מאחורי כל זה, אבל עוד דמות מעברם של מאלדר וסקאלי…

פרק סיום העונה והסדרה כולה. רוחות מן העבר רודפות את ג'קס בשעה שהוא נוקט צעדים על מנת להגשים את מורשת אביו.

הנהגת "ילדי האנרכיה" מתכנסת על מנת לדון בהתנהלות של סניף רדווד. ג'קס מגלה את סודה של ג'מה.

האהבה פורחת בקרב חברי המועדון, אך עד מהרה מוות רודף מוות. מורתו של אייבל חוששת לשלומו ומתקשרת לשירותי הרווחה.

המועדון מבצע כמה החלטות קריטיות כדי להחזיר את אחד מחבריהם ומתמודד עם תוצאות שמשפיעות על כולם.

החיפושים אחר בובי נמשכים. במקביל, חברי המועדון מנסים לחשוף את הבוגד בקרבם.

ג'קס מנצל את התערערות הבריתות הקיימות על מנת להגן על המועדון ולסגור חשבון עם אויב ותיק.

ג'קס מנסה לגלות מי הסגיר את מיקום המחסן ללין, ומתעמת עם הסינים בנמל. ג'וס עוזב את העיר עם ג'מה, ומגלה מהן כוונותיה האמתיות.

חברי המועדון מגלים שהכומר שהרגו היה שותפו העסקי של אוגוסט מארקס, ומנסים לטשטש את עקבותיהם. במקביל, הסכסוך בין המועדון לסינים הולך ומחמיר.

ג'קס מגייס את עזרת הסניף בנבדה על מנת לנקום בהנרי לין. אנסר מסכים לשמש כיועץ משטרתי וחוקר את נסיבות מותה של טארה.

ג'קס ממשיך לכרות בריתות כדי לנקום בהנרי לין ולהביא למפלתו של אוגוסט מארקס. ג'וס מנסה לדבר על לבו של צ'יבס, אך עד מהרה מבין שלא יוכל לחזור למועדון.

מטוס קטן מתרסק על החוף והטייס מת לפני שהוא התרסק. הורשיו מוצא חומרי לעשות קוקאין באתר התרסקות ומציע ששותף של הטייס יכול להיות שחיבל במטוס.

ראסל וקתרין במנוסה והם עובדים ביחד על מנת ללכוד את גבריאל לפני שינסה לרצוח אותם שוב, אך במהרה הם מגלים שייתכן שגבריאל עצמו אינו עומד מאחורי היריות. הצוות נפרד מקתרין…

למארק, איל הון ובעלה של לאורה, חברתה של קתרין, יש הרבה מה להסתיר מאחורי תאגיד בינלאומי והוא שכר צוות מעולה של מתנקשים כדי לבצע את הרציחות של כל אחד העלול…

הרצח של מומחה לבליסטיקה מוביל את האף-בי-איי לקחת חלק בתיק, לאכזבתם הראשונית של ראסל וקתרין. בעוד הצוות חוקר ביחד עם האף-בי-איי כדי לפתור את הרצח, הם מגלים שמאות כלי נשק…

סוכן אף-בי-איי ממחלקת הצווארון הלבן של סאן דייגו מבקש סיוע מהינ"ה כאשר הנוכל שהוא עוקב אחריו במשך שנים החל לרצוח את קורבנותיו.

בעקבות שיחת טלפון למשטרה מתגלה גבר מדמם וכרות אשכים. האיש לא זוכר מי עשה לו את זה, אך החקירה מובילה לכמה נשים, ועולה החשד שהגבר עצמו אשם בפשע מין.