לאחר שפורצת שריפה בחדר הניתוח של ד"ר בל, קלייר מתחילה לחשוד באיכות העבודה שלו. עם הגעת תוצאות הנתיחה של לילי, ניק מגלה לתדהמתה שעליה להילחם כדי להגן על הקריירה שלה.

אנאליס המיוסרת ואכולת האשמה פונה לבקש תמיכה מאמא שלה. בוני מייצגת אחות בבית חולים הנאשמת באונס של מטופל. אוליבר מבקש מקונור שיציג אותו בפני חבריו.

אנאליס מייצגת מאפיונר הנאשם בהברחת סמים, אבל עומד לפטר אותה בגלל הפרשייה שבה היא מעורבת. גיסתה של אנאליס מתחילה לחשוד בה כרוצחת של סם, מה שמוביל לחיפוש משטרתי בביתה של…

בעוד החיפוש אחר סם מתחיל, לא ברור עד כמה יודעת אנאליס על מה שאירע באמת. קונור המבוהל מנסה לשכנע את מקיילה לחבור אליו ולהסגיר את עצמם למשטרה.

שודדים חמושים משתלטים על בית המכירות הפומביות שבו עובדת ויני, אחותו של הונדו, ולוקחים אותה ואת שאר העובדים כבני ערובה. הונדו מתקשה לפקד על הצוות כשהוא חושש לחיי אחותו.

פושע שטאן עצר כשהיה במחלק המוסר נמלט מהכלא ומנסה לחסל אותו. כריס עוצרת בחור על נהיגה בגילופין ומגלה שהמעצר בוטל משום מה.

בפרק האחרון לעונה, לקס מזמין את לינה ואת ליליאן לבית הלבן, ונערך לקרב גורלי עם סופרגירל.

קארה מתייצבת מול בת אדומה, ובינתיים ברייני מוביל מבצע לשחרור החייזרים, ולוקווד מגלה את האמת על לקס.

לינה וסופרגירל מחפשות רמזים בסטרייקרס איילנד בתקווה למצוא את לקס. ג'יימס הולך לטיפול וברייני מתמודד עם שאלה של מצפון.

לקס לותור עדיין מסתובב חופשי, וסופרגירל, אלכס ולינה רודפים אחרי החסידה הכי נאמנה שלו. ג'ון המוטרד מזמן את רוחו של אביו.

המתח בין בני האדם לחייזרים מגיע לשיא חדש, וסופרגירל נאלצת לנקוט עמדה כדי לשמור על השקט. משימה קשה מעמידה למבחן את האמונות של אלכס.

מנצ'סטר בלאק חוזר לפעול לצד צוות חדש של שותפים – ה"אליטה". ניה מתמסרת לאימונים.

ג'ון וקארה חוקרים אירוע קשה המעיב על חגיגות יום האהבה ומגלים קשר לחקירה זוועתית של המחלקה לעניינים על-טבעיים – ולחייזר חדש ומפחיד.

קולונל היילי שמה לה למטרה לחשוף את זהותה הסודית של סופרגירל, אבל אלכס נחושה למנוע זאת. ברייני מאיץ בניה להתחיל להשתמש ביכולותיה המיוחדות.

ניה משתפת את קארה וברייני בחלום נבואי, והם מעודדים אותה לאמץ את הגורל שלה. מנצ'סטר בלאק מחפש נקמה ומבקר את בן לוקווד.

לקראת חג ההודיה, הסוכן ליברטי מפרסם מנשר של שטנה והסתה, ואילו ג'יימס, אלכס וקארה מנסים למנוע גל של אלימות נגד חייזרים.

סוכן החירות משיג נשק חדש ומסוכן במלחמתו "להציל" את האנושות. ז'ון וקארה פועלים יחד כדי לאתר קמע רב-עוצמה.

למרות חלקיקי הקריפטונייט המסוכנים שעדיין נישאים באוויר, גיבורים רבים יוצאים ומסכנים את חייהם. ג'ון מחפש את פיונה ומוצא בן ברית.

הצוות חוקר סדרה של מקרי רצח שנראים מקושרים לפשע המאורגן, אך הראיות מובילות אותם לסרט סטודנטים שהתסריט שלו מכיל את כל הפרטים במקרי הרצח.