תאונה במרתון שיקגו מכניסה את עובדי הרפואה לפעילות נמרצת. ילדה ההולכת ומאבדת את שמיעתה גורמת לצוות לתהות על קנקנה של האם המלווה.

אחותה של שרונה, גייל, מקבלת תפקיד נחשק בהצגה, אולם כאשר אהובה במחזה צונח על הבמה, ללא רוח חיים, הופכת שרונה לחשודה המיידית.

קארה וקלי משתפות פעולה כדי לעזור לחייזר יתום צעיר החושש לחיי אחיו הגדול שנמצא בכלא. ניקסלי חודרת לחלומותיה של ניה.

מר מיקסזפיטליק, שגורש לממד החמישי, נכנס שוב לתמונה ומציע לקארה לחזור אחורה בזמן, לקבל החלטות שונות וליישר את ההדורים עם לינה.

בפרק האחרון לעונה, כדור הארץ שרוי בכאוס והצוות משתף פעולה כדי להילחם בריין. המצב החדש מעורר בסופרגירל מחשבות על הייעוד שלה. סם נחלשת ומחפשת מקור כוח.

ריין סופגת את הכוחות של פסטילנס ושל פיוריטי ומתחזקת. כעת היא מסוכנת מאי-פעם – והיא מחפשת את רובי.

מסע תת-ימי מקים לתחייה תקווה שנקברה מזמן. סמנת׳ה נוסעת בזמן הביתה כדי לחקור את עברה, ומגלה את האמת על סיפורה המקורי.

פריצה לבית וחטיפת נערה מובילות לגילוי מזעזע. מונסי מתאקלמת ביחידה ומבינה שעליה לעשות שינוי, חיצוני ופנימי, אם ברצונה להמשיך לעבוד במדור לקורבנות מיוחדים.

קבוצת בני נוער השייכים לכנופיה מבצעים פשע מזעזע ברכבת התחתית. בלשי היחידה חוברים ליחידת הכנופיות כדי לתפוס את החשודים ולהפיל את הכנופיה.

פרק סיום העונה. בלשי מדור מיוחד מגנים על קורבן של אלימות מתמשכת במשפחה, אבל כשהיא מגיעה כנאשמת לבית המשפט, פרקליט מהעבר מפתיע ומתייצב להגנתה.

גרלנד מבקש מבנסון לפתוח מחדש תיק נעדרים שהוא עבד בו כקצין טירון. קורבן מאחד מהמקרים האחרונים של קאריסי נעצר.

בחורה צעירה מבקשת את עזרתה של בנסון במציאת אביה הביולוגי, שככל הנראה אנס את אמה. קאריסי ורולינס מתלבטים אם לחשוף את מערכת היחסים שלהם.

נערה שולחת הודעת פיתוי לחבר מביה"ס, והמקרה מסתיים ברצח משולש. קאריסי וצוות המדור המיוחד מנסים להוכיח שהנאשמת ברצח היא הקורבן בסיפור.

אסטרונאוט מפורסם נמצא מת בפארק, וחקירת המקרה מובילה לאנס סדרתי. סטייבלר מבקש עזרה מחבר ותיק, כאשר עוד גופות מתחילות להיערם.

סטייבלר וטוטואולה חוקרים את היעלמותם של שני בני נוער במהלך סיור כיתתי במוזיאון המדע. החקירה מקבלת תפנית כאשר מסתבר שיש סיכוי שהנערים נעלמו על דעת עצמם. סטייבלר מתעמת עם בתו…

בנסון וסטייבלר מגלים כי עורכת דין מצליחה שנמצאה מתה למעשה חיה חיים כפולים כחשפנית. החקירה מובילה לבעלה של הבוסית שלה, שניהל עמה רומן.