ג'וש עובר תאונה מביכה, ולאחריה מוטל עליו לנהל דיונים במקורות אנרגיה חלופיים; אנבת מנסה לשפר את ביצועיו של טובי כדובר; צ'רלי מקבל הצעה שעשויה לפתור את הדילמה שלו.

צ'אק מגייס את בני משפחתו, חבריו ובעלי ברית בלתי צפויים כדי למנוע מניקולס קווין(אנגוס מק'פיידן) להרוס את כל מה שצ'אק בנה בחמש השנים האחרונות.

לאחר משימה מלחיצה, שרה חוזרת לצ'אק עם סוד גדול. אלי ומדהים עומדים בפני הזדמנות שיכולה לשנות את חייהם. אנגוס מק'פיידן בתפקיד אורח.

צ'אק ושרה מגלים מי עומד מאחורי המזימה להרוס את תעשיות קרמייקל. בינתיים, התוכניות של אלי לחג המולד המושלם מתחילות להתפרק. סטן לי בתפקיד אורח.

צ'אק ושרה מתמודדים מול רובין קנינגס (רבקה רומיין), מרגלת חסרת רחמים שדבר לא יעצור אותה. ערב הדייטים של אלי וקפטן מדהים מקבל תפנית מסוכנת.

צ'אק ושרה חייבים למצוא מתנקש בין העובדים בכנס המכירות של "באי מור". ג'ף חושף צד אחר של עצמו. דייוויד קוצ'נר וקתרין דנט בתפקידי אורח.

העובדה שמורגן הוא "המחשב המשולב" מובילה לניפוח האגו של מורגן וצ'אק נבחן כמפעיל שלו וכחבר שלו. קפטן מדהים מגלה תגלית מפתיעה בנוגע לג'ף ולסטר. קארי אן מוס בתפקיד אורח.

ארגון "הטבעת" סוגר על צ'אק ומבצע ברטאוסקי , אבל אביו של צ'אק, סטיבן (סקוט באקולה), פועל להציל אותו. ביג מייק מקבל חדשות בנוגע לבאי מור.

ארגון "הטבעת" סוגר על צ'אק ומבצע ברטאוסקי , אבל אביו של צ'אק, סטיבן (סקוט באקולה), פועל להציל אותו. ביג מייק מקבל חדשות בנוגע לבאי מור.

כשצ'אק חולם חלומות מטרידים, קובעת לו הגנרלית בקמן (בוניטה פרידריסי)פגישה עם הפסיכיאטר של הסי-איי-איי, ד"ר ליאו דרייפוס (כריסטופר לויד – בחזרה לעתיד).

צ'אק ושרה מתאמנים עם צוות סי-איי-איי, בני זוג נשואים ששונאים זה את זו. פרד ווילארד וסווזי קורץ בתפקידי אורח כקרייג ולורה טרנר. קייסי חייבת לאמן את מורגן.

שרה וצ'אק נמצאים באירופה, מבינים שהם נוסעים ברכבת עם מרגלים ספרדים ומחליטים להתמודד עם הסוכנים הסוררים האלה. קייסי ומורגן מקבלים את המשימה למצוא את צ'אק ושרה.

צ'אק, שרה ושו (ברנדון ראות') מתאחדים למשימה, אבל צ'אק מודאג מהיציבות הרגשית של שו. מורגן שוקל לעזוב את באי מור.

צ'אק בחר את הסוכנים הטובים ביותר למבצע סמוי, אבל הוא חושב רק על בחורה אחת לתפקיד: שרה. קייסי, מורגן ו"מדהים" מנסים לעזור לצ'אק לזכות בה בחזרה.

גורלו של צ'אק כמרגל תלוי במשימה אחת אחרונה, שבמהלכה שרה ושו (ברנדון ראות' חוזר בתפקיד אורח) צופים בכל צעד שלו.

קייסי מבצע מעשה בגידה במשימה צדדית עבור המפקד לשעבר שלו, קולונל ג'יימס קלר (רוברט פטריק). צ'אק מנסה להציל אותו.

צ'אק חייב להפוך מדען של ארגון הטבעת למרגל עבור הסי-איי-איי ובמקביל לכך הוא מכשיר את האנה (בתפקיד אורח: קריסטין קרוק – סמולוויל) כחנונית עדר חדשה.

מדהים מזוהה בטעות כמרגל על, וצ'אק חייב ללמד אותו איך להיות מרגל אמיתי. אנג'י הארמון (חוק וסדר) וברנדון ראות'(סופרמן חוזר) בתפקידי אורח.

צ'אק חייב להשתמש במערכת היחסים שלו עם מדהים כדי להגן על דיקטטור אורח, פרמייר גויה (ארמנד אסנטה בתפקיד אורח), שהוא יעד להתנקשות.

צ'אק חייב ללמוד לשלוט ברגשותיו כדי שיוכל להיות מרגל… גם אם הוא עדיין מאוהב בשרה. בתפקיד אורח: ויני ג'ונס (סנאץ').

היכולות החדשות של צ'אק עם המחשב המשולב המשודרג מתגלות כבעייתיות באימוני הריגול ומובילות לעימות עם שרה.

צ'אק חייב להציל את החתונה של אלי – ואת חייה. בתפקידי אורח חוזרים מורגן פיירצ'יילד, ברוס בוקסלייטנר, טוני הייל, סקוט באקולה וצ'בי צ'ייס.

צ'אק ושרה מסכנים הכול כדי למצוא את אביו של צ'אק (סקוט באקולה). מורגן מקדם בטעות את אמט (טוני הייל). צ'בי צ'ייס מופיע שוב בסדרה בתפקיד אורח.

צ'אק פונה לאדם מפתיע שיעזור לו לאחר שאביו (סקוט באקולה) נחטף על ידי פולקרום. ג'ורדנה ברוסטר וטוני הייל בתפקידי אורח.

סטיב (סקוט באקולה), אביו של צ'אק שנעדר תקופה ארוכה, חוזר וצ'אק מקבל את עבודת החלומות שלו אצל הגיבור שלו, טד רוארק (צ'בי צ'ייס) לרוע המזל, צ'אק מתאכזב בשני המקרים.

צ'אק מביע רגשות לגבי מערכת היחסים שלו עם שרה. סוכנת חסרת לב, אלכס (טרישה הלפר – " בטלסטאר גלקטיקה") נשלחת להעריך את ביצועיה של שרה.

הגאון שמאחורי המחשב המשולב יוצר קשר עם צ'אק, והוא חייב להחליט על מי הוא יכול לסמוך – שרה וקייסי או המדען המסתורי.

שרה וקייסי מחפשים את האדם שעומד מאחורי התוכנית של ארגון פולקרום ליצור "מחשב משולב" משלו. צ'אק והסוכן קול בארקר (ג'ונתן קייק) נאלצים להישאר בבונקר המאובטח.

צ'אק מקנא כששרה מתקרבת לסוכן מושך, קול בארקר (ג'ונתן קייק). ג'ף ולסטר מנסים לשכור את בייב ה"באי מור". הדוגמנית ברוקלין דקר בתפקיד אורח.

צ'אק עוזר למורגן לרגל אחרי אנה, אבל חווה הבזקי זיכרון בנוגע לכך שהחבר החדש שלה קשור לכנופייה מסוכנת. ג'ף ולסטר רוצים שאלי ו"מדהים" ישכרו את הלהקה שלהם לחתונה.

צ'אק ושרה חייבים להתחזות לזוג נשוי המתגורר בפרוורים. הם פוגשים את השכן העליז בראד (אנדי ריכטר) ואת סילביה (ג'ני מקארתי), אישה פתיינית ששמה עין על צ'אק.

בפרק מיוחד בתלת ממד, צ'אק מסכל תוכנית להרוג כוכב רוק (בתפקיד אורח דומיניק מונאהן שכיכב ב"אבודים" ובסרטי "שר הטבעות"). כוכב האן-אף-אל ג'רום בטיס מופיע גם הוא בתפקיד אורח.

חנות הבאי מור מוחזקת כבת ערובה. כשמתברר שהאירוע אינו מעשה אקראי שנגרם בשל טירוף החגים וצ'אק והמחשב המשולב בסכנה, שרה יוצאת לפעולה.

צ'אק מרגל אחר שרה בדייט עם גבר מבוגר (גארי קול- " עקרות בית נואשות", " הבית הלבן") ויש לו הבזק זיכרון. שרה חושפת את זהותו של איש המסתורין.

קייסי המום לגלות שהמנטור שלו, סנסאי טיי בנט (קארל למבלי – "זהות בדויה") הוא סוכן סורר. מורגן פיירצ'יילד וברוס בוקסלייטנר בתפקידי אורח כהוריו של מדהים.

צ'אק, שרה וקייסי מגלים למרבה הזעזוע שחברתו של צ'אק, ג'יל (ג'ורדנה ברוסטר), היא סוכנת של פולקרום והיא מחפשת את המחשב המשולב. ההורים של קפטן מדהים מגיעים לחג ההודיה.

צ'אק וג'יל (ג'ורדנה ברוסטר) נהנים ממערכת היחסים המחודשת שלהם, אבל ג'יל מקנאה כשהיא פוגשת את שרה. מומחה היעילות אמט (טוני הייל) חוקר את מורגן.

צ'אק רואה את חברתו לשעבר, ג'יל (בתפקיד אורח: ג'ורדנה ברוסטר – "מהיר ועצבני"), ומשקר לה בנוגע להצלחתו. הוא חווה הבזק זיכרון בנוגע לבוס של ג'יל – האם היא מעורבת?

חיי הריגול מתחילים לגבות מחיר וצ'אק מנסה להסביר את התנהגותו המוזרה למומחה היעילות של באי מור. (בתפקיד אורח: טוני הייל – " משפחה בהפרעה").

צ'אק לומד עוד על עברה של שרה כשהם נתקלים באויבת הוותיקה שלה מהתיכון, הת'ר צ'נדלר (ניקול ריצ'י בתפקיד אורח), ובבעלה, מארק (בן סבאג' בתפקיד אורח).