באטמן ורובין לומדים על מעלליו של ג'ונה הקס, לוחם פשע מהמערב הישן, שהתמודד פעם עם ראס אל גול האלמותי.

ראס אל גול גונב מגילה מצרית קדושה שברוס וויין תרם למוזיאון גותהאם.

באטמן מגלה את תוכניתו של ראס אל-גול להציף את כדור הארץ בכימיקלים ולהחזיר אותו לכוכב שופע וירוק – מה שישמיד את כל החיים שקיימים כעת!

כאשר רובין נחטף בצורה מסתורית, החיפוש של באטמן מוביל אותו לפגוש את רא'ס אל גול, מנהיג חברת הצללים, שגם בתו, טליה, נחטפה.

באטמן חוקר קרטל פשע עולמי ידוע לשמצה בשם "חברת הצללים" שהחל לפעול בעיר ג'ותהאם.

אד מציע נישואין לנורמה. ג'יימס ודונה נפרדים, וארל שולח תעלומה לאודרי, שלי ודונה.

קופר עומד לגלות מי ירה בו, ומגייס את אלוף השחמט המקומי כדי לסייע לו להביס את וינדום ארל.

קופר חושף בפני טרומן את עברו העכור עם וינדום ארל, וליאו מתעורר מהתרדמת.

חמישה מתוך ששת הלוחמים הנשכחים מתאחדים כדי לשתף פעולה עם ספיידרמן על מנת למנוע מקינגפין מלהפעיל את נשק יום-הדין. אך בזמן התהליך, קפטן אמריקה והגולגולת האדומה משתחררים.

במטרה לחשוף את תעלומת ששת הלוחמים הנשכחים, רובי רוברטסון ופיטר מחליטים להיפגש עם פרופסור זקן, חבר וותיק של רובי, שיודע כמה דברים על ששת הלוחמים.

לאחר ביקור מפתיע מ-"ידיד וותיק" של המשפחה, פיטר נוסע לרוסיה במטרה לחקור את תעלומת היעלמות הוריו ולקבל כמה תשובות, שם הוא נתקל בכמה חברים ותיקים!

דברה וויטמן מוצאת את מורביוס, הערפד החי, ומביאה אותו לעבוד על תרופה. יחד עם וויסלר וספיידי, החתולה השחורה צריכה להתמודד מול הרברט לנדון והשוקר כדי להציל את מורביוס מפני עצמו.

פלישיה הארדי, שהפכה כעת לחתולה השחורה, נסחטת לעבוד אצל הקינגפין עד שהוא יכול לשכפל יותר מנסיוב "חייל-העל" שהעניק לקפטן אמריקה את כוחותיו וכעת גם לה.

דוקטור אוקטופוס סוחט את אמה של פלישיה והיא מתחילה להבין שלמשפחתה יש כמה סודות אפלים. הקינגפין מבריח את הארדי מהכלא וחוטף את פלישיה כדי להשיג את נסיוב חייל-העל של קפטן…

ספיידרמן לוכד חבורת גנבים ונראה כי רובי רוברטסון הוא המנהיג שלהם. פארקר וג'יימסון חייבים לשתף פעולה כדי לזכות את שמו של רובי. אבל בזמן שג'יימסון חוקר, פיטר חייב לשמור עליו…

כאשר מאיץ התרחבות הזמן נופל לידיים הלא נכונות, כל הפושעים בעיר מתחרים על הטכנולוגיה. פיטר ומרי ג'יין חוגגים את האירוסין של פלישיה הארדי לג'ייסון מקנדייל כשהם שומעים תוכניות לשוד גדול!

עובד לשעבר של תעשיות סטארק ממציא טכנולוגיה בין-ממדית ניידת שבטעות הופכת אותו ל-"ספוט", התגלמות חיה של השער. אך המצאתו הבלתי-יציבה יצרה מערבולת המאיימת לבלוע את ניו-יורק.

ספיידרמן מגלה שסמיית הפך לקיבורג – חלקו אדם, חלקו מכונה והוא כעת קוטל העכבישים המושלם! אך כאשר עולה תקלה בתכנות שלו, סמיית רודף אחר האיש שאחראי למותו של אביו… נורמן…

וולברין תוקף את ספיידרמן במחשבה שהוא האחראי להיעלמותו של חיה. בהמשך, השניים מצליחים לעלות על עקבותיו של חיה ונתקלים במזימה להשמיד את הגזע המוטאנטי ומנסים לשבש אותה.

המוטציה הנויוגנית המתקדמת של ספיידרמן מחריפה והוא פונה לעזרתו של צ'ארלס אקסבייר, אך הוא מאוכזב לגלות כי אקסבייר לא 'מרפא' מוטאנטים, אלא רק מסייע להם לשלוט ביכולותיהם.

צוללת סובייטית מתחילה לצלול ללא שליטת הקפטן, בגלל שאדם מהצוות שיחרר לוחם חייזרי שקפוא בקרח, בדיוק כשהטארדיס מתממשת. הלוחם המיתולוגי מהסדרה המקורית – לוחם קרח – חוזר לסדרה המחודשת.