בפרק האחרון לעונה, כדור הארץ שרוי בכאוס והצוות משתף פעולה כדי להילחם בריין. המצב החדש מעורר בסופרגירל מחשבות על הייעוד שלה. סם נחלשת ומחפשת מקור כוח.

סופרגירל, מון-אל ואלורה משתפים פעולה כדי לעצור את סלינה, שנמצאת בדרכה לכדור הארץ ובאמתחתה תוכנית זדונית. ז'ון מתכונן לפרידה חשובה.

מון-אל וסופרגירל יוצאים למשימה חשובה ונדהמים נוכח תגלית מפתיעה. במקביל, בכדור הארץ, זעמה של ריין מעמיד למבחן את הנאמנות של לינה.

קארה צריכה לקבל החלטה גורלית שעלולות להיות לה השלכות כבדות על חבריה בכדור הארץ. ג'יימס וז'ון מאתרים את מקור הנשק הקטלני.

תלמידה שנמלטה מהכת של קוביל מוסרת יומן שיכול לעזור להציל את סם. מישהו מאיים לחשוף את זהותו של גארדיאן.

ריין סופגת את הכוחות של פסטילנס ושל פיוריטי ומתחזקת. כעת היא מסוכנת מאי-פעם – והיא מחפשת את רובי.

קארה משוכנעת שבהורגת עולמות שבויה עוד נותר שמץ של טוב, אבל אלכס לא קונה את זה. וין מצטרף לז'ון ולמון-אל היוצאים למשימה חשובה.

ריין מסתובבת חופשי בנשיונל סיטי. לאחר תבוסתה של קארה, מון-אל שולח את אחד מחברי לגיון גיבורי-העל לתוך התת-מודע המיוסר שלה.

סופרגירל חוברת אל סאטורן גירל ואל שני בני ברית מפתיעים, ויוצאת איתם אל פורט רוז. שם הם צפויים למצוא אסירה שיודעת כיצד לחסל את ריין.

לינה וג'׳ימס מתחקרים ביחד את מורגן לאחר שסמלים מבשרי רע מופיעים בלילה בנשיונל סיטי. ובערב חג המולד מופיע אויב חדש.

מסע תת-ימי מקים לתחייה תקווה שנקברה מזמן. סמנת׳ה נוסעת בזמן הביתה כדי לחקור את עברה, ומגלה את האמת על סיפורה המקורי.

סמל מוכר מסב את תשומת לבה של קארה אל אדם הנתון במשימה מעוותת. סמנת׳ה משקיעה מעצמה במקום העבודה, אבל חוששת שהיא מאכזבת את בתה.

כשהרעלת עופרת פוגעת בילדי נשיונל סיטי, מורגן אדג' יוצא בהאשמה פרועה. אלכס ומגי מבינות אמת כואבת.

נבלית רבת עוצמה ובעלת יכולות על-חושיות מותירה את קארה חסרת אונים. לינה מגיעה לעבוד בקאטקו במשרה מלאה ומוסרת את האחריות על אל-קורפ לידי מנהלת חדשה.

עם תחילתה של פלישת הדאקסמי, קארה עדיין מבולבלת ממעשה ההקרבה שלה. בעל הון כריזמטי מטפח תוכניות לבנות מחדש את נשיונל סיטי.