מנהיג העבודה הפנימי של צ'יף טיירול גורם לו להתנגד לאדאמה ולהפוך לנקודת ההתלכדות עבור שביתה.

לקס שוקל שימוש במידע כוזב כדי להפליל את ג'ונתן קנט הרץ לסנאט, אך לפני כן הוא נורה ושוקע בתרדמת, שבמהלכה מופיעה אימו החושפת בפניו את עתידו.

פרוייקט סודי משתחרר וגורם לרעל קטלני להתפשט בסמולוויל. אלו שנפגעו ע"י הרעל מדמיינים את פחדיהם הגדולים ביותר מתגשמים ונופלים לתרדמת. נואש למצוא תרופה קלארק נותן קצת מדמו ללקס והוא המום…

בעוד אביו ממתין לניתוח, קלארק מתיידד עם גארט, נער שאחיו, וינס, מת ממחלת כבד, אך לפתע וינס מופיע כשהוא בחיים. המצב מסתבך כשהכבד של וינס כושל וגארט דורש את הכבד…

קלארק מציל את לאנה מסופת הטורנדו ומגלה שהסופה חשפה את החללית וגם קברה בחיים את אביו, ואת העיתונאי שגילה את סודו. לקס הרוס עקב מותו של אביו.

הנשיא החדש שנבחר מקבל סקירה נרחבת על תוכנית הסטארגייט, וסגן הנשיא קינסי עושה מהלך נוסף עבור שליטה על התוכנית.

ס"ג-1 מואשמים בגניבת מכשיר לשליטה על מזג האוויר, דבר המוביל את כוכב הלכת הפרימיטיבי לכאוס. במהלך החקירה, הצוות מגלה כי נעשה שימוש לרעה בסטארגייט השני שעל כדה"א.

מבריח המתמודד עם טראומה אישית צריך להוביל ברחבי ארה"ב הפוסט אפוקליפטית, נערה צעירה שעשויה להיות המפתח לתרופה למגפה.

בהמשך לאירועי העונה הקודמת, שון נחוש לנקום באדם שירה באביו ובכל מי שהיה מעורב במזימה, ורוקם תכנית פעולה משותפת עם גאס – כנגד רצונו.

האחים חוקרים מקרה בעיירה בה אנשים חולים במחלה שגורמת להם לפחד, פרנויה ולבסוף התקף לב. דין נדבק במחלה.

בפרק המצטלב עם "סופרגירל ו-"החץ", חייזרים בעלי אגרוף ברזל מאיימים על קיומם של כל המטה-אנשים, וברי מקבץ יחדיו את סופרגירל, צוות חץ וה-'אגדות' לקרב על כל הקופה.