צ'אק מגלה שהפרופסור לשעבר שלו הוא סוכן ממשלתי שנרדף בגלל קובץ רגיש וסודי ביותר. צ'אק חוזר לאוניברסיטת סטנפורד, המוסד ממנו גורש. צ'אק מגלה כמה סודות מזעזעים בנוגע לחייו שלו ולומד…
גיבס ואנשיו נקראים לסייע בחקירת מותה של סוהרת שנחטפה במהלך בריחה מהכלא. החקירה מעלה קשר לביון הבריטי, למבצע ישן של אן-סי-איי-אס ולפושע המחפש נקמה בסוכנים שהשתתפו באותו מבצע.