פינץ' פורץ לסוכנות לביטחון לאומי כדי לשתול את הווירוס שישמיד את "השומרוני". המכונה מראה לפינץ' סימולציות של מה שהעולם היה בלעדיה.

לאחר שפינץ' מגיע אל המקום הלא נכון בזמן הלא נכון, "השומרוני" מאתרת אותו ומסרבת לעצור עד שתלכוד אותו. חברי הצוות מתכנסים כדי להגן על החבר שלהם, אבל לא כולם ישרדו.

ריס ופינץ' נשלחים לחתונה כדי להגן על צמד מבוקשים. פוסקו כועס על שהצוות מסתיר ממנו דברים, ולוקח על עצמו לחקור שרשרת של דוחות נעדרים.

שרון בורחת, אבל הצוות לא בטוח במצבה הנפשי כשהיא מתחילה להתנהג בפרנואידיות ובפזיזות. עם זאת, הם ממשיכים לחפש אחר מתג הכיבוי של ה-"שומרוני".

לאחר החזרת המכונה לפעולה, מתגלים כל מיני באגים, ביניהם שגיאה בזיהוי פנים, והמכונה מזהה את הרולד, רוט וג'ון כאיומים בגלל חלק ממעשיהם בעבר, מה שמוביל לסכנות בלתי צפויות.

פרק 22 ואחרון לעונה. פינץ' ורוט ממהרים להציל את המכונה שאותרה על ידי השומרוני, ואילו ריס נקלע לקרב אחרון בין הפושעים היריבים אליאס ודומיניק.

ריס ופוסקו נקלעים למלחמה בין שני פושעים, אליאס ודומיניק. רמז בנוגע למקום הימצאותה של שו מוביל את פינץ' ואת רוט למלכודת אפשרית, וקונטרול הופכת לנוכלת על מנת ללמוד את האמת…

ריס ופינץ' מנסים לגונן על מנכ"ל חברה שהתנהגותו הופכת לבלתי יציבה לאחר שהאקר חושף את סודותיו.

הצוות מסייע לאישה שעובדת בחברת תוכנה לאחר שהיא מגלה שמנוע החיפוש המשוכלל שלה גרם למשתמש להתאבד. בינתיים קלייר יוצרת קשר עם פינץ' ומבקשת ממנו שיעזור לה להפיל את "דסימה".

ריס ו-"רוט" מחפשים אחר שו בעיירה קטנה בצפון מדינת ניו-יורק. פוסקו חובר למבוקש מהעבר על מנת לתפוס את המספר החדש.

בקרה, שאחראי על הטיפול במספרים רלוונטיים לממשלה, מתחילה להטיל ספק בשיטות ובכוונות של תכנית השומרונית. כמו כן, מתחילים להופיע דיווחי חדשות מדאיגים על זוג אזרחים שלקחו את החוק לידיהם ומשתולל…

השומרוני משיקה מתקפת סייבר בבורסה, שמאלצת את הצוות לסכן את חייהם במשימה נואשת לעצור אסון גלובלי.

השומרוני מציגה את כוחה על ידי מחיקת פשע מהעיר ליום אחד, בניסיון לאלץ להוציא את המכונה מהמחבוא.

ריס ופינץ' נתפסים במאבק כוחות על שליטה בין כנופיות של העיר כאשר דומיניק, המנהיג השאפתן של האחים, מנסה לפגוע באליאס. בינתיים, רוט ושו לא מסכימות על איך להתמודד עם איום…

ריס מתנדב כמדריך בבית הספר לשוטרי משטרת ניו-יורק כדי לפקוח עין על קצינה צעירה ומוכשרת שמעשיה חשודים וגורמים לו לפקפק במניעיה. בינתיים, מרטין – חמוש במידע מהשומרוני – צד חבר…

עובד משרד הופך בטעות להיות מעורב במזימה מסוכנת כשהוא עושה עבודה נוספת כבלש; פינץ' מבקר הונג קונג.

פינץ' חושד כאשר המספר של סוקר פוליטי מוכשר מגיע באותו הזמן שתחזיותיו שבדרך כלל נכונות משתבשות, ומאמין ששני האירועים קשורים.

כשהוא נאלץ לקחת על עצמו זהויות חדשות שנוצרו על ידי רוט, הצוות מנסה להסתגל לחייהם החדשים. עם זאת, כמה מהם מוצאים זאת קשה להתעלם מהמספרים של המכונה, מה שמעמיד את…

פרק סיום העונה. בזמן ש-"דסימה" מתכוננים להפעיל את ה-"שומרוני", הצוות מוצא את עצמו בין הפטיש לסדן כשהארגון מנסה לחסל אותם ובמקביל "ויג'ילנס" מנסים לשים קץ לריגול הממשלתי.

כוח מסתורי מפריע למכונה לחזות אירוע קטלני במלואו, והמכונה שולחת לצוות חמישה מספרים שונים לחקור. בינתיים, צוות ההאקרים של רוט מגיע לניו-יורק.

בזמן ש-"דסימה" משתמשת במשובים של "השומרונית" כדי לצוד את שו ואת ריס, גריר מנצל את חולשתו הגדולה של הרולד כדי להוציא אותו ממקום מחבואו: אהבתו לארוסתו לשעבר, גרייס.

ריס פועל במסווה כסוכן סמוי על מנת להגן על חבר קונגרס שחייו בסכנה על-פי המכונה. החבורה מגלה שיש לו תפקיד מכריע בהפלת מערכת "השומרונית", אך לא יודעת אם הוא הקורבן…

ריס ושו צריכים להגן על מהנדסת שעבדה בעבר בשירות האו"ם בעירק, וכעת בטוחה שמנסים להפליל עובד לשעבר שלה ולגרש אותו מהארץ. היא מנסה לעקוב אחר דיפלומט צרפתי מושחת, ופינץ' ועוזריו…

המכונה שולחת את רוט לחפש אחר שרת בעל עבר מסתורי. כאשר נוכחותה מסכנת אותו, המכונה שולחת את המספר שלו לפינץ'.

סודותיו של פינץ' מהתקופה לפני שריס הצטרף אליו נחשפים, כולל גילויים הקשורים לאירועים הקורים בהווה.

תוכנה מתחרה למכונה של פינץ נחשפת. התוכנה בעלת תכונות אנושיות יותר, ואף עלולה לאיים על שלום העולם יותר מהמכונה הראשונה.

המכונה ממשיכה לקרטע תוך כדי ספירה להשבתה מוחלטת ברגע האפס. באווירה של משבר מתקבצות כל הדמויות הקשורות למכונה. רוט שוב נצמדת לפינץ' בניסיון להשתלט על המכונה לפני ההשבתה.

פינץ' וריס מפילים רשת לריגול תעשייתי, אך פינץ' חושד שמטרתם העיקרית היא לחדור ולנטרל את המכונה.

עברו של ריס ממשיך לרדוף אותו: קארה, שנחשבה למתה, חוזרת עיוורת משנאה כדי לנקום בריס, בסנו שבגד בהם ובעולם בכללו.