בפרק האחרון, האחים אלריק חוזרים לריסמבול, שבה מחכה להם עתיד חדש. וינרי ואדוארד מגלים זה לזה את רגשותיהם.

אדוארד, ארמסטרונג ואיזומי מוצאים דרך לעמוד בפני המתקפות האכזריות של אבא. אלפונס מקריב מעצמו כדי לעזור לאדוארד.

ליקוי חמה נותן מעט תקווה לנשמותיהם של אנשי אמסטריס. הוהנהיים חושף את תוכניותיו, ואדוארד נלחם בפרייד בפעם האחרונה.

אבא מממש את תוכניתו ובולע את כל הנשמות באמסטריס. כעת הוא יכול לעבור דרך שער גן העדן ולהגיע לעין האלוהים.

אדוארד, אלפונס, הוהנהיים, איזומי ומוסטאנג ממתינים שגורלם יוכרע במאורה של אבא, והעתיד נראה עגום.

לינג משתמש במלוא הכוח של גריד כדי להשמיד את האויב בשער. הקבוצה של אדוארד מוצאת את הוהנהיים ונופלת למלכודת.

קרב קטלני פורץ בין בראדלי לפו. הקבוצה של אדוארד פוגשת את הרופא שיצר את בראדלי ומתמודדת עם אתגר חדש לגמרי.

קרב אחד מסתיים, ואחר מתחיל. הוהנהיים ואבא נלחמים על אבן החכמים – מי ינצח?

אדוארד מבין שאנבי מנסה להסית את חברי הקבוצה זה נגד זה. הקרב בין האחים ארמסטרונג לסלות' מגיע לנקודת תפנית.

השמועה על ההפיכה מסייעת למורדים. מיי מפתה את אנבי לתוך מלכודת שמובילה לעימות חזיתי עם מוסטאנג.

אבן החכמים נמצאת בידיו של אלפונס, והוא מתעמת ללא חת עם פרייד ועם קימבלי.

הצוות של אד ניצב מול עדר של בובות רעבתניות – יצורים מתועבים שמקושרים לנשמות של בני אדם.

במתקפה על הביצורים של סנטרל, מוסטאנג מוביל כוח שמורכב מכל מיני חיילים מהצפון, כולל כמה פנים אהובות מהעבר.

אביו של אל עוזר לו לבלום את פרייד בפעולה מדהימה.

תוכניותיהם של אלה שעומדים לתבוע לעצמם את השלטון נחשפות, והכאוס מתעצם אחרי שמתנקש מכה במנהיג רב־עוצמה.

בצפון המושלג, החיילים במבצר בריגס נלחמים מול צבא פולשים, ומרקו עומד בראש מתקפה נגד אויב מפלצתי.

מיי ומרקו משיגים התקדמות במאמציהם לפענח את המחקר של אחיו של סקאר, אבל ייתכן שכבר מאוחר מכדי למנוע אסון.

האחים אלריק, שהקשר ביניהם עמוק יותר מקשר דם, חלקו זה עם זה רגעים של שמחה וגם של כאב. עכשיו, נראה שהחיבור המיסטי בין נשמותיהם עלול להיות קטלני.

חטיפתה של וינרי בידי סקאר נחשפת, וצריך לגבש תוכנית חילוץ. סופה קשה מתקרבת – סופה שרק אלפונס אלריק יכול לה.

צמד כימרות מאיים על סקאר, והאחים אלריק נחלצים במפתיע לעזרתו. בהמשך, הניסיון של וינרי להתעמת עם סקאר מסתיים באסון.

רייבן מנסה לדרדר את ארמסטרונג. בינתיים, אד ואל נאלצים להמתין בתאם. לפני שנים רבות, אביהם התמודד עם שבי, וכדי להימלט מהכאב, הוא נפרד לשלום.

קימבלי סוגר על סקאר. אזור הגבול הצפוני הופך לשדה קרב. תנאים קשים עומדים בדרכם של אד ואל אל מבצר בריגס.

מפגש סודי מאפשר למוסטאנג להצית שאיפות חדשות במכר ותיק – בעל ברית שיש לו חיילים. אד ואל פוגשים את המעריץ הגדול ביותר שלהם.

מוסטאנג מצליח למצוא בעלי ברית גם אחרי שאיבד את אנשיו, אלא שגם אויביו אינם לבדם. ההומונקולים משחררים את אחד הרוצחים המסוכנים ביותר ממלחמת אישבל.

אדוארד שומע את הסיפור של הוקאיי על תקופה שבה חיילים נשלחו לבצע רצח עם. בד בבד, הזוועות משדה הקרב באישבל נחשפים.

טעות אחת קטנה של האחים, ויקיריהם יראו את נחת זרועו של בראדלי. מלבד זאת, ייתכן שאין צורך באבן החכמים.

האחים אלריק פוגשים את "אבא" ונדהמים לראות כיצד הוא יוצר הומונקולוס חדש באמצעות אלכימיה שאמורה להיות בלתי אפשרית.

האמת המטרידה נחשפת לאחר שאל מוצא את מי שמכונה "אבא", ואד שוב מפר את הטאבו הגדול ביותר של האלכימיה.

אד ולינג מוצאים את עצמם בבטן של גלאטוני, ונתקלים באויב מרושע. בסנטרל, מוסטאנג נאלץ להתבונן מהצד כשבראדלי מפלג את הצבא שלו.

שיתוף פעולה בין הכוחות המורדים של מוסטאנג לחבורתו של לינג יאו מוביל ללכידת הומונקולוס, אבל גם מושך את תשומת ליבו של מרגל הומונקולוס.

וינרי מגלה מה היה חלקו של סקאר במות הוריה ונתקפת רגשות רצחניים, בדיוק כמוהו.

אד ואל חושבים על תוכנית מסוכנת במטרה לפתות את ההומונקולוסים לצאת מהמחבוא. השלב הראשון: להסתכן בכך שסקאר, אויבם המסוכן ביותר, יהרוג אותם.

האחים אלריק מתקוטטים עם לינג יאו ועם בני לווייתו לאן פאן ופוּ, שבאו משינג כדי לחפש את אבן החכמים.

כימרות חוטפות את אל, ניסיון החילוץ של אד נכשל, ואיזומי מוכיחה שוב שהיא בסך הכול רוצה בטובתם של האחים.

אל זועם בגלל המחשבה שכל קיומו נוצר על ידי אחיו. רק וינרי תוכל להוכיח לו עד כמה הוא טועה.

האחים אלריק, שגילו מהו המרכיב הסודי והמחריד באבן החכמים, ממשיכים בחיפוש אחר האמת ומגיעים למעבדה סודית.

אדוארד ואלפונס מותקפים על ידי סקאר – מתנקש מסתורי בעל כוחות מדהימים, המבוקש בגין סדרת רציחות מחרידות.

אד ואל פוגשים את שו טאקר, שיכול ללמד אותם דבר או שניים על אלכימיה – ועל האכזריות האיומה שלפעמים כרוכה בה.

כשהיום מתחיל, יאמפר של קלואי מביא הביתה פידוב פצוע שהוא מצא. קלואי ואחיה מחליטים להחזיר אותו לבריאות מלאה ומתחילים לאהוב אותו, מה שכן יאמפר שם לב לזה ומתחיל לא לאהוב…