מוצאו של אהרון ושביתות מורים רחבות היקף גורמות לקיטוב. וולס מגלה דפוס מעורר חשד בהתפרצויות של שפעת.

מתקפה פוליטית נגד קירקמן מפנה את הזרקור לנושא פרטיותם וזכויותיהם של טרנסג'נדרים. אהרון צריך לקבל החלטה חשובה. וולס ואלי עולים על עקבותיו של טרוריסט ביולוגי.

דיון בנוגע לנישואי קטינות מסעיר את הסגל של קירקמן. בעיית ההתמכרות למשככי כאבים לא פוסחת על ביתו של מארס. ביו-האקר עם אג'נדה מצמררת מושך את תשומת ליבה של וולס.

הקמפיין של קירקמן, שמתמודד בפעם הראשונה בבחירות לנשיאות, מתחיל ברגל שמאל. וולס מוצבת בתפקיד חדש וקריטי.

הצוות חוקר את רציחתו של מתדלק בצוות מכוניות מירוץ, ולומד דברים חדשים על התנהלות עולם מירוצי המכוניות.

בפרק סיום העונה, הצוות מנסה לבלום התקפת טרור נגד חיל הים, בזמן שגיבס, שעדיין מתאושש מפציעתו, סובל מאובדן זיכרון.

סוחר סמים מובא לתחקור ביחידה, אך נופל ומת במעלית. אחיו של האדם, עדיין לא עודכן בדבר מותו של האח, מתקשר ומודיע שהוא חטף את שפרד ושיהרוג אותה אם לא יחזירו…

גיבס נפגע בפעולת טרור וטוני לוקח את הפיקוד, למורת רוחם של כמה מחברי הצוות. גיבס חווה פלאשבקים מעברו שמציפים אותו ברגשות שהודחקו.

הצוות חוקר סביב בית הארחה של משפחות של חיילים, לאחר שנמצא חדר מטונף בדם וברקמות אדם. דאקי מגלה שהממצאים נלקחו משלוש גופות שונות שנותחו באופן מקצועי.

גופתו של חייל מארינס נמצאת באגם קפוא. גילוי גופות נוספות בסביבה גורם לצוות לחשוד בכנופיית רחוב.

רכב רפואי המוביל את גופתו של חייל מארינס שמת בתאונת דרכים מתפוצץ, והצוות מגלה שהפיצוץ לא היה מקרי. המסתורין מסתבך עוד יותר עם גילויה של ראייה חדשה.

הצוות מבצע פשיטה על מוסך תיקונים בניהולם של אנשי חיל הים, ומגלה ראש אדם קפוא בתא המטען של אחת המכוניות.

הצוות מחפש אחר הרוצח המקצועי שרצח שתי נשים קוריאניות הנשואות לחיילי מארינס. החשש הוא שלרוצח יש מניע גזעני, ושאישה נוספת נתונה בסכנה.

קצינת חיל הים נחטפת, והמקרה הופך לבהול כאשר הצוות מגלה שהיא בין האנשים היחידים שידעו את מסלולה של רכבת המובילה נשק גרעיני.

הצוות חוקר את מה שנראה כהתאבדות של דוגמנית-על שהשתתפה בתכנית ריאליטי אשר צולמה בבסיס של המארינס.

צוות הזיהוי הפלילי אוסף ראיות מזירת רצח, המצביעות על כך שטוני הוא החשוד המרכזי. היחידה מזדרזת לגלות מי הפליל אותו.

הצוות מגן על מקגי לאחר שירה באדם שלפי טענתו כיוון אליו נשק, ואשר מתגלה כשוטר סמוי.

טוני וזיווה מתחזים לבעל ואישה רוצחים שכירים על מנת ליצור קשר עם תא טרור המתכנן לפעול בנשף של בכירי צבא.

הצוות מחפש אחר מפקד בחיל הים, שנעלם באותו היום בו חלה פריצה באבטחה של תוכנה שהיה לו קוד אליה. במהלך החקירה, גיבס שומר על בנו הקטן של הנעדר, שמזכיר לו…

הצוות מחפש אחר אשתו הנעדרת של חייל הממוקם בעיראק. מסתבר שהיא ניהלה אתר פורנוגרפיה מביתה, ויכול להיות שנרצחה מול מצלמת הווב-קאם. טוני מגלה שדעותיה של זיוה לגבי מיניות דומות לדעותיו…

סוכנת המוסד זיוה מצטרפת לצוות של גיבס, והתיק הראשון שלה הוא מקרה מסתורי של שרידי גופה מהתקופה האחרונה שנמצאו בארון קבורה מימי מלחמת האזרחים.

לוציפר ואלה נוסעים לעיר החטאים כדי לחקור את העילמותה של מכרה ותיקה. בינתיים, קלואי ולינדה חוגגות ומתפרעות בבית.