בפרק האחרון לסדרה, ספיידרמן נשלח דרך כמה מימדים בנסיון לתקן את הזמן וללכוד את ספיידר-קטל. במסעו, פוגש פיטר כמה מגרסאותיו השונות וכמו כן, את חברתו גוון סטייסי ויוצר הקומיקס סטן…

פיטר ומרי ג'יין, שהמומים מכוחותיה החדשים, פונים לעצתו של ד"ר קונרס. מרי ג'יין מספרת להם על חלום חוזר שעשוי להיות הרמז להיעלמותה, אך הידרומן מוצא אותם וחוטף את מרי ג'יין…

לאחר שדחו את ירח הדבש שלהם, מרי ג'יין ופיטר מגיעים לחופשה במפלי הניאגרה. אך השמחה נקטעת במהרה לאחר שהיידרומן מגיע וחוטף את מרי ג'יין.

ספיידרמן וסילבר סייבל מאתרים את קרגוב, הזיקית והגולגולת האדומה, אך הם נתפסים בשדה כוח. מסתבר שמתקן יום הדין נועד להפוך את בנו לאל. קרגוב זוכה לכוחות מחשמלים ומכנה את עצמו…

במטרה לחשוף את תעלומת ששת הלוחמים הנשכחים, רובי רוברטסון ופיטר מחליטים להיפגש עם פרופסור זקן, חבר וותיק של רובי, שיודע כמה דברים על ששת הלוחמים.

לאחר ביקור מפתיע מ-"ידיד וותיק" של המשפחה, פיטר נוסע לרוסיה במטרה לחקור את תעלומת היעלמות הוריו ולקבל כמה תשובות, שם הוא נתקל בכמה חברים ותיקים!

היום הגדול של פיטר ומרי ג'יין מגיע, אבל הדברים לא יתנהלו כמתוכנן אם זה תלוי בהארי אוסבורן. כשאורחים קרויים וגם כאלו שלא מגיעים למאורע המשמח, זה בהחלט יהיה יום שלא…

פיטר ומרי ג'יין מאורסים, והזוג המאושר הולך לבקש מד"ר קונורס להשתתף בחתונה. אך כאשר לטאות-אדם חוטפים את ד"ר קונורס ואת ספיידרמן, מרגרט קונורס, מרי ג'יין ודברה תצטרכנה להציל את היום.

הארי רדוף הרוחות זוכה לביקור מהגובלין שמוביל אותו לנוסחת-העל ולכלי הנשק שלו. בינתיים, המעניש מבטיח לאנה ווטסון שהוא ימצא את מרי ג'יין כשבראש רשימת החשודים נמצא פיטר פארקר.

ספיידרמן לוכד חבורת גנבים ונראה כי רובי רוברטסון הוא המנהיג שלהם. פארקר וג'יימסון חייבים לשתף פעולה כדי לזכות את שמו של רובי. אבל בזמן שג'יימסון חוקר, פיטר חייב לשמור עליו…

פיטר פארקר ומרי ג'יין סוף-סוף ביחד, אבל השמחה היא קצרת מועד כאשר גובלין הירוק, חמוש במשבש הזמן וזהותו האמיתית של ספיידרמן, מבקש להרוס את ספיידי בכל אמצעי אפשרי.

לאחר שאדי מסרב לעבוד עבור דורמאמו, קטל אוסף כוח חיים עבור כניסתו של דורמאמו לכדוה"א וחוטף את ד"ר אשלי קפקא, ואדי שהתאהב בה, חייב לחבור לספיידרמן ואיירון מן כדי להציל…

ספיידרמן מגלה שסמיית הפך לקיבורג – חלקו אדם, חלקו מכונה והוא כעת קוטל העכבישים המושלם! אך כאשר עולה תקלה בתכנות שלו, סמיית רודף אחר האיש שאחראי למותו של אביו… נורמן…

ספיידרמן חובר ל-"דרדוויל" בניסיון לזכות את שמו של פארקר מהאישומים. מרדוק חושף את זהותו האמיתית של הקינגפין. ובזמן שספיידרמן נלחם בזיקית, ניטש קרב איתנים בין דרדוויל לפיסק.

פיטר מופלל בפשע שהוא לא ביצע. כעת הכל תלוי בעורך דינו העיוור, מאט מרדוק, שיוכיח את חפותו, אלא שגם למאט מורדוק יש זהות סודית – האיש ללא פחד, "דרדוויל" הנועז.

לאחר שספיידרמן מאבד את הזכרון במהלך קרב מול האוקטובוט, דוק אוק מחליט לנצל זאת ומשכנע את ספיידרמן כי הוא העוזר האישי שלו, אך טאינה מצליחה לגרום לספיידי לזכור את העצמי…

פיטר מגלה כי מרי ג'יין היא חלק מכת מסתורית שמנסה לשחרר את השד דורמאמו מהמימד בו הוא כלוא. כאשר הכת מתקרבת למטרתה, ספיידרמן חייב לחבור לדוקטור סטריינג' כדי לעצור אותם!

פיטר ולואיס מחליטים לעשות עוד ילד, וסטואי מנסה למנוע מהם לממש זאת. אחרי כמה ניסיונות הוא מחליט להתכווץ ולטוס בחללית לתוך גופו של פיטר כדי להשמיד את זרעו.

קודוס, רוצח סדרתי נמלט, הוא שחקן שייקספירי מהמאה ה-23. לאחר שחבר נרצח, קירק מבקש מלהקת תאטרון שייקספירי לחקור.

במהלך המשפט הצבאי של ספוק, הקלטות וידאו מהמפגש של קפטן פייק עם הטאלוסיים בעלי הכוחות העל-טבעיים חושפות את המניע של ספוק לחטיפת הספינה.

ספוק חוטף את הקפטן לשעבר של האנטרפרייז שנפצע וקובע מסלול אל כוכב אסור. ספוק עלול לעמוד למשפט צבאי, אבל אינו מוותר.

וירוס גורם לצוות האנטרפרייז לאבד את השליטה העצמית. סולו מאיים על הצוות בחרב, ספוק בוכה ובונז מחפש תרופת נגד.