חבר ילדות של משפחת דנוורס, שיודע את סודה של קארה, חוטף את אלכס ודורש לשחרר את אביו, פושע ידוע לשמצה, מבית הכלא.

בפרק האחרון לעונה, נון ואינדיגו מתכננים להשמיד את החיים על פני כדור הארץ, וסופרגירל נאלצת להתמודד בקרב לחיים ולמוות מול דמות אהובה כדי לעצור אותם.

אלכס וקארה מגלות איך האנק הגיע לדי-אי-או ולומדות על הקשר בינו לבין אביהן. קארה מתקשה להתמודד עם סופרגירל המרושעת ומתחילה לזלול בלי שליטה.

קארה לא יודעת איך להביס את 'נוסעת האינטרנט' אינדיגו וזוכה לעצה במבצר הבדידות של סופרמן. ג'יימס ולוסי שוקלים מחדש את הקשר ביניהם.

טארה נקרעת כשאסטרה, הדודה שהייתה פעם כה אהובה עליה, מערערת את אמונה באמה. שערורייה סביב הודעות הדוא"ל של קאט מאיימת להביא את הקריירה שלה לסיומה.

חג ההודיה של קארה מלא בדרמה כשאם האומנה שלה מגיעה לביקור בדיוק כשאחד מעובדי קאטקו הופך ל-'לייבווייר' הנבל בעקבות תאונה.

ניסיונותיה של קארה להשתמש בכוחות-העל שלה לא תמיד עולים יפה. קאט חושדת בסופרגירל ולוחצת על ג'יימס ליצור קשר עם סופרמן על מנת שיביא לראיון את סופרגריל בשביל סיפור בלעדי.

אחרי 12 שנה של שמירת סודיות כוחה על כדור הארץ, קארה זור-אל, בת דודתו של סופרמן, מחליטה סוף סוף לאמץ את היכולת העל-אנושית שלה כדי להיות הגיבורה שהיא נועדה להיות