סנטנה מקבלת את תפקיד המחליפה של רייצ'ל ב"מצחיקונת". טינה וארטי מתחרים ביניהם על תפקיד הנואם בטקס הסיום של מקינלי.

חברי המקהלה לומדים לעשות טוורקינג, מארלי מגלה את הקשר בין ג'ייק לברי, ורייצ'ל מנסה לשכנע את קורט לעשות יחד איתה קעקוע.

שגעת הביטלס במקינלי נמשכת, ועכשיו צריך לבחור את המלך והמלכה של הנשף. טינה זוכה למועמדות מפתיעה, אבל ההתנהגות שלה מעוררת כעס ואכזבה בקרב חבריה.

חברי "כיוונים חדשים" מארגנים מחווה ללהקת הביטלס, ושרים קלאסיקות כמו Yesterday, ‏Drive My Car ו-A Hard Day's Night.

ברנדה מקבלת חדשות מהרופא שלה. נייט מתחיל ללכת לטקסי תפילה של הקייווקרים עם מגי, למורת רוחה של ברנדה. רות הולכת לבקר את בן זוגה לשעבר, היראם.

רות שמחה לפגוש את בתו של ג'ורג', אבל לומדת פרטים חדשים על עברו. דיוויד מתמודד עם שדים בכלא. קלייר נוחלת הצלחה בתערוכה שלה, אבל חבריה נוטשים אותה. נייט מתעמת עם…

ג'ורג' נעשה יותר ויותר פרנואידי ומגלה את המקלט המשפחתי. רות רוצה להשתתף בסדנת סקס. דיוויד וקית עומדים בפני תביעה משפטית. ברנדה רוצה להביא ילד לעולם עם נייט.

נייט, ברנדה ומאיה משתתפים בטקס זיכרון לליסה באיידהו. חתונה חד-מינית נותנת השראה לדיוויד וקית. קלייר ואידי רבות במסיבה של ג'ימי. רות מתפייסת עם ג'ורג'.

רות ובטינה נוסעות למקסיקו. דיוויד ממשיך להתמודד עם לחץ פוסט טראומטי. אידי ואניטה מפגינות קרירות כלפי קלייר. קלייר חווה הנאה מינית בפעם הראשונה.

רות מגיע לנקודת משבר בנישואיה. קלייר ממשיכה להימשך לאידי, אבל מתקשה להתחבר אליה. פדריקו עובר לבית ההלוויות. נייט וברנדה לוקחים את מאיה לנסיעה ברכבת.

רות מארגנת מסיבת יום הולדת לדיוויד שמתאושש מחטיפת מכוניתו. קלייר "מתקרבת" לכמה ידידים וונסה מגלה את הקשר בין ריקו לסופיה.

הפעם מגיעה לבית הלוויות גופתו של גבר שנהרג מפגיעת ברק. הגבר הוא אביה של ארוסתו לשעבר של דיויד. קית' עדין מתקשה "לצאת מהארון" בפני חבריו לעבודה ורות מחליטה לשים קץ…

הפעם מגיעה לבית הלוויות גופה של נערה צעירה שמתה במפתיע. דיווד מבקש להאציל סמכויות נוספות על ארתור, אך רות חושדת שארתור הוא זה ששולח לג'ורג' חבילות עם צואה. נייט מפתח…

מגנום נקרא למילואים ונשלח על ידי מפקדו לבצע פעולת חטיפה בלב היערות בדרום אמריקה. כשנראה שהמשימה הופכת למלכודת מוות, החברים מתגייסים לעזרתו.

הונדו רודף אחרי ג'ה קים לבדו, והוא נחוש להוכיח בכל מחיר מי הוא באמת. קים מנסה להתנקש בחייו, והיקס מעביר את החקירה לידי מחלק שוד-רצח, אבל הם לא מצליחים למצוא…

עבריין נמלט מהמשטרה, פורץ לבית ולוקח את בני המשפחה כבני ערובה. כשאנשי הימ"מ מגיעים לזירה הוא טוען שעשה את זה כי אחותו נחטפה. הם לא מאמינים לו, ואז הוא נאלץ…

חברי הצוות משתלטים על משלוח של ציאניד ומנסים לברר למי הוא מיועד. במקביל חברי ארגון ימין קיצוני יורים בשוטרת שהיא חברה של כריס, ומתברר שיש קשר בין שני המקרים.

הונדו וחברה ותיקה ממנהל הסמים עובדים יחד בניסיון לחסל רשת מבריחי סמים.

חופשת חג המולד של הצוות נדחית כשגנבים גונבים זהב של קרטל סמים. ג'סיקה פונה לנציב המשטרה ומציעה הצעות לשיפור עבודת המשטרה.

בפרק האחרון לעונה, נון ואינדיגו מתכננים להשמיד את החיים על פני כדור הארץ, וסופרגירל נאלצת להתמודד בקרב לחיים ולמוות מול דמות אהובה כדי לעצור אותם.

נראה שרק קארה וקאט חסינות למריאד, טכניקת השליטה בתודעה שבה משתמש נון כדי להפוך את אוכלוסיית נשונל סיטי לצבא דמוי-זומבים.

קאט המתוקה נתקלת בקריפטונייט אדום והופכת למרשעת. בגדיה משתנים, וכך גם התנהגותה בקאטקו ובדי-אי-או. אלכס ולורד הופכים לבני-ברית בעל כורחם.

קארה מתחרה בעוזרת הבוגדנית החדשה בקאטקו. סופרגירל מתעמתת עם 'הסוהר הראשי'. ג'יימס מפקפק בדי-אי-או ונקלע למחלוקת עם קארה.

טפיל לוכד את תודעתה של קארה בתוך הזיה, שבה כוכב הלכת קריפטון עדיין קיים. האנק ואלכס נאלצים להילחם בנון ללא עזרתה של סופרגירל.

סופרגירל נלחמת בכפילה מרושעת המנסה להשמיד אותה. קארה ואדם, בנה הבכור של קאט, מתחילים לפתח רגשות זה לזו.

קאט משוכנעת שהעוזרת הכנועה שלה היא סופרגירל. במקביל, אסטרה ונון נחושים בדעתם להשמיד את קארה, וקארה מוצאת עצמה נלחמת בשתי חזיתות.

אלכס מבקשת מהאנק לחשוף את תוכניתו הסודית של מקסוול לורד. קאט מציעה ללוסי עבודה ומסבכת את העניינים עם ג'יימס. אביו של וין נמלט מהכלא.

טארה נקרעת כשאסטרה, הדודה שהייתה פעם כה אהובה עליה, מערערת את אמונה באמה. שערורייה סביב הודעות הדוא"ל של קאט מאיימת להביא את הקריירה שלה לסיומה.

רעידת אדמה משתקת את נשונל סיטי ומותירה את קארה וחבריה ללא כוחות-על. בדי-אי-או, בעיותיה של אלכס עם האנק מגיעות לנקודת רתיחה.

סף הלחץ של קארה מרקיע שחקים במהלך תרגיל אימונים תחת פיקודו של גנרל ליין. אלכס מבקשת מווין לחקור את מות אביה.

קארה נאלצת לשמור על בנה של קאט בדיוק ביום שבו סדרת פיצוצים הדורשת את תשומת לבה של סופרגירל מרעידה את נשונל סיטי. האקסית של ג'יימס מגיעה העירה.

כוחותיה של סופרגירל נבחנים כאשר ריהאקטון, אחד האויבים האימתניים של סופרמן מגיע לנשיונל סיטי ומסמן את סופרגירל במטרה. כמו כן, קאט רוצה לתחקר את סופרגירל.

ניסיונותיה של קארה להשתמש בכוחות-העל שלה לא תמיד עולים יפה. קאט חושדת בסופרגירל ולוחצת על ג'יימס ליצור קשר עם סופרמן על מנת שיביא לראיון את סופרגריל בשביל סיפור בלעדי.