העונה נפתחת מספר שבועות לאחר הקרב האכזרי של פייפר ופנסטאקי שנעל את עונת הבכורה. בפרק הפותח את העונה, אחרי תקופה בצינוק, פייפר נלקחת ליעד לא ידוע. היא מוצאת את עצמה…

מיס שו נקשרת לילדה שהיא מגינה עליה ועולים בה רגשות שהיא לא מכירה. האם הם קשורים לתאונה שהיא עברה בילדותה?

בעודו מושעה מתפקידו כיועץ למשטרת ניו-יורק, הולמס לא יכול להתאפק מלחקור את מותו של הוגה תיאוריות קונספירציה, ונתקל בתוך כך בשרשרת רציחות הקשורה לענייני ביטחון לאומי.

ילד קטן שנמצא לבדו בסנטרל פארק מוביל את אוליביה וצוות החוקרים לרשת טרוריסטים. התובע צריך הרשעה ברורה, אבל ההיסטוריה של הנאשמת כקורבן אונס מסבכת את העניינים.

טום מתעמת עם ליז לגבי הקופסה, וטוען לחפותו. רד מודיע ל-אף-בי-איי על השם הבא ברשימה – טרוריסטית מסוכנת ויפהפה בשם ג'ינה זנטקוס.