פרק הסיום של העונה השנייה מסתיים בהלם ובסקנדל כצפוי. לאחר שזהות החפרפרת התגלתה, מדהים לגלות מי באמת מנהל את העניינים מאחורי הקלעים.

כולם מפעילים את מיטב כישוריהם. סיירוס מנסה לעצור את סערת התקשורת בעקבות הודעת מלי שבעלה בוגד בה, פיץ ואוליביה מבלים במיטה וכולם שוברים את הראש ומנסים לפענח מי החפרפרת.

פרק של עימותים. ג'ייק נגד סיירוס, סיירוס נגד מלי, מלי נגד פיץ ואילו פיץ ואוליביה בעימות אפי מכריע.

קטע ארוך של פלאשבק חושף את הדרך שבה האק ואוליביה נפגשו. ובחזרה לאירועי היום, אוליביה רבה עם הנשיא בבית החולים ומלי מחליטה שזה הספיק לה ועוזבת את הבית.

המשחק נעשה מסוכן מרגע לרגע. לא רק מולי בסכנה אלא גם האק ובמיוחד אוליביה שלא יודעת למה היא נכנסת כשהיא משחררת ומורידה לבסוף את המגננות מפני ג'ייק.

פרק של תהפוכות. כפי שאומר סיירוס: ההיסטוריה מחליטה מי הגיבור ומי הנבל. ובאמת אוליביה עובדת פתאום למען הוליס דויל, ומתקרבת בצעד נוסף לג'ייק והנשיא מקבל קריאת השכמה מאשתו.

בני הערובה האמריקנים מחולצים ללא מעורבותם של מלי ושל סיירוס, אלא כתוצאה של מעשיה של אוליביה מאחורי הקלעים.

נראה שאוליביה מתחילה להתאושש לאטה אך היא מתקרבת דווקא לאדם שפיץ משלם לו כדי לעקוב אחריה. בפרק זה היא גם מחלצת פוליטיקאי שנמצא גם הוא בתסבוכת אישית.

פיץ מאבד את העשתונות ולא יודע במי אפשר לבטוח. הוא מרחיק וממדר את סיירוס ומאפשר לאליזבת לתמרן אותו. גם אוליביה מורחקת.

גיי-די מגלה שקים יוצאת עם שון, האקס של אליוט. טורק רוצה להתמנות לתפקיד המנתח הראשי. ד"ר קלסו מתאשפז בביה"ח עם וירוס בקיבה.

פרק אחרון לעונה: ביום החתונה שלו, טורק נתקע בביה"ח עקב סיבוך במצבו של אחד המטופלים. לאחר שאמר לאליוט שהוא לא אוהב אותה, ג'יי-די מנסה לפצותה בכך שיחזיר את שון לזרועותיה.

ג'יי-די מחליט לספר לאליוט על רגשותיו כלפיה, לאחר שהיא מציעה לשון לעבור לגור איתה. ד"ר קלסו וד"ר קוקס מתעמתים על השירותים שביה"ח צריך להציע. יום החתונה המתקרב מלחיץ את טורק…

ג'יי-די ואליוט חווים לילה של תשוקה, אולם אז שון מגיע לביקור פתע. ד"ר קוקס מגלה שהוא בעצם מאוהב בד"ר מילר. ד"ר קלסו והשרת מבררים מה מותר ומה אסור לעשות בביה"ח.

טורק מתחיל להילחץ כשהוא צריך לשלוח הזמנות לחתונה. ג'יי-די מנסה לעזור לאליוט, אולם אז שון מגיע לביקור פתע. ד"ר קוקס וד"ר אליוט נלחמים על תשומת לבה של רופאה חדשה.

מטופל של ג'יי-די מסרב לעבור ניתוח בבלוטת הערמונית, כדי לא לפגוע בחיי המין שלו. ד"ר קוקס לא מצליח למצוא זמן כדי לקיים יחסי מין עם ג'ורדן. קרלה מסרבת לשכב עם…

יחסיהם של שון ואליוט מגיעים לנקודת פיצוץ. ג'יי-די מגלה שעדיין יש לו רגשות כלפי אליוט ומנסה להחליט מה לעשות עימם. ד"ר קוקס מציג את מועמדותו לתפקיד בכיר בביה"ח.

טורק, קרלה וג'יי-די מקבלים מתמחים משלהם, וכשג'יי.די. מבקש את עזרתה של אליוט בהנחיית המתמחים, היא מפנה אותו לבן זוגה, העובד עם חיות. ד"ר קוקס וג'ורדן מחפשים רופא ילדים לבנם.

טורק וקרלה קובעים תאריך לחתונתם. ג'יי-די, המרגיש שתקופה בידידותו עם טורק עומדת להסתיים, מנסה לחגוג את המעבר לתקופה החדשה, אך לשווא. קרלה נאלצת לבחור בין קריירה למערכת יחסים.

ג'יי-די מבקש את עזרתם של טורק וקרלה כדי לאבחן את אחד החולים, לאחר שד"ר קוקס מסרב לעזור לו בכך. אליוט מבינה ששום דבר טוב לא קרה לה ב-3 השנים האחרונות…

ג'יי-די חושש שהוא זוהם בצהבת, אחרי שהוא נדקר בטעות ממחט בזרוע. בינתיים, אליוט מתקשה לשלב את מערכת היחסים שלה עם התקדמות בלימודיה. טורק באובססיה להיכנס לכושר, אחרי שקרלה מספרת עליו…

התחרותיות של טורק מתחילה לעצבן את ג'יי-די, ד"ר קוקס טועם קפה טוב, אך הודות לסכסוך עם ד"ר קלסו, האחות היחידה שיכלה להכין אותו מפוטרת. אליוט פוגשת מטופל נאה, אך מתקשה…

שחקן בייסבול שובר את זרועו ומגיע כדי לראות את האוס. הביקור חשף מקרה רציני של בריחת עצמות והיסטוריה של צריכת סמים, ולמרות שבהתחילה הוא מכחיש, בסוף מתגלה שהוא צורך סטרואידים….

בנסון וסטייבלר נקראים לזירה שבה אלכוהוליסט התעורר ומצא גופת אישה לידו.

תאונת דרכים קשה שולחת משפחה שלמה לחדר המיון וכלל הצוות נזעק לסייע בהגשת עזרה, בעוד הבת הבכורה של המשפחה נדרשת לקבל החלטה גורלית. לקסי מוצאת עצמה עובדת לצד חברתו החדשה…

טדי נאלצת להפקיד את חיי בעלה בידי עמיתיה כאשר הוא נזקק לניתוח דחוף, בעוד היא מתבקשת למלא משימה דחופה במקום אחר.

כשאימו של ג'ורג' אומאלי מגיעה לקבל טיפול רפואי בעקבות ניתוח כושל שעברה, צוות הרופאים מוצא עצמו מתרפק על זיכרונות העבר. כריסטינה מוצאת השראה לחלומותיה במקום יוצא דופן.

אלכס נלחם כדי להשפיע על הליך האימוץ של זולא. לקסי מנסה להסתיר את תחושות הקנאה לאחר שהיא רואה את מארק עם אישה אחרת. טדי מעניקה לכריסטינה הזדמנות להגשים את חלומותיה…

המתמחים יוצאים מגדרם כדי להרשים את קת'רין אייברי (אימו של ג'קסון), מנתחת בכירה שהגיעה לסיאטל גרייס כדי לבצע ניתוח השתלה חסר תקדים. דרק ומרדית' מתמודדים עם משבר נוסף בהליך האימוץ…

סודה של מרדית' מתגלה ומערכת היחסים שלה עם שפרד עולה על שרטון בדיוק כשהיא מוצאת את עצמה מול החלטה גורלית. גילוי של כריסטינה ממוטט את עולמה, ובעוד כולם נערכים לאירוע…

כולם מגבירים הילוך לקראת הבחירה בתפקיד המתמחה הראשי. טדי מספרת להנרי שהחבר שלה הציע לה לטוס איתו לעבודה בגרמניה, והמטופלת החדשה של אלכס היא בת 17 בהריון מתקדם.

עובדת סוציאלית ממשיכה לבחון את אימוצה של זולא ע"י מרדית' ודרק. אלכס מבין אט אט כי חבריו מנדים אותו משום שהלשין על מרדית'. וובר מחליט להכניס את הנרי לניתוח דחוף,…

כולם מתגייסים לעזור לקאלי והתינוקת בהחלמתן. כשאלכס נאלץ לטפל בחולה עשירה ורגזנית הוא מקבל רעיון לניסוי שיכול להפוך אותו למתמחה ראשי. מרדית עוזרת לאדל ובר להיכנס לניסוי.

פרק המחזמר המדובר בו הדמויות מבצעות את 40 הלהיטים הגדולים ביותר. קאלי מובהלת לבית החולים במצב אנוש לאחר תאונת דרכים, והצוות נלחם על הצלת חייה והצלת חיי העובר. המצב גורם…

לחרדת אריזונה, קאלי רוצה לערוך מסיבה לקראת הלידה. אדל נבחנת לניסוי של שפרד. בעלה של ד"ר אלטמן שוב נזקק לניתוח והוא מתוודה על אהבתו אליה.

מרדית' המחפשת להוכיח שהיא קורצה מהחומר להיות מתמחה ראשית, לומדת שכול דבר יכול להתרחש במהלך שעה אחת, כאשר היא מתנדבת לנהל את חדר המיון למהלך משמרת לילה.

אריזונה מבקשת את עצתו של מארק בניסיון להתפייס עם קלי. טדי חייבת לקבל החלטה גורלית עבור הנרי במהלך הניתוח שלו. לקלי יש סוד שעליה לחשוף בפני אריזונה…

דיווחים אודות אקדוחן מטורף שפתח באש במכללה מקומית מגיעים לבית החולים. פצועים רבים מהתקרית זורמים לכיוון חדר המיון והצוות נאלץ להתמודד עם הדברים בעוד הוא מתמודד עם "פצעים פתוחים" משלו.

למרות התנגדותה של מרדית', דרק המודאג לוקח את כריסטינה למסע דייג על מנת להתרחק מכולם. בינתיים, טדי מרגישה חסרת כיוון ללא כריסטינה.