קפטן מדהים שואל את צ'אק אם הוא רשאי להציע לאלי נישואין, ואז מתעקש שצ'אק ישמור על הטבעת עד שהוא יתכנן את הצעת הנישואין. קייסי ושרה מגלים שהסי-איי-איי ריגל אחריהם בתקווה…
צ'אק מגלה שכמה סוחרי נשק רוסיים נפגשים בחשאי בלוס אנג'לס. אישה רוסייה מסוימת מושכת את תשומת לבו, והוא חווה הבזק בנוגע אליה ומגלה שהיא חברתו לשעבר של קייסי. האם קייסי…
צ'אק עדיין מלקק את פצעיו לאחר שהוא מבין שלשרה יש רגשות כלפי ברייס. צ'אק חייב להסתוות כבעלה של שרה במשימה לעצור זייפן ובעל יאכטה המקושר פוליטית. צ'אק, שרה וקייסי יוצאים…
ברייס חוזר בחג ההודיה לאחר שנחשב למת. ועדות פנימיות סודיות שניסו להרוס את ה"מחשב המשולב" הצילו את ברייס, בתקווה שהוא יעזור להם לאתר אותו. אבל כדי להוכיח לשרה, לקייסי וליתר…
כשצ'אק מתחיל לצאת עם לו, מכינת סנדוויצ'ים, ונראה שהכול מתנהל ממש טוב, המצב מעורר קנאה מצד שרה, "חברתו לשעבר" של צ'אק, שמגלה שיכול להיות שרגשותיה לא היו רק חלק מסיפור…
צ'אק נאבק בחיי האהבה האמיתיים שלו ובחיי האהבה בגרסת הכיסוי שלו, כשהוא פוגש בחורה יפה מאוד בשם לו, שמתעניינת בצ'אק האמיתי. מאידך, מערכת היחסים של צ'אק עם שרה מתחממת כשהם…
צ'אק מגלה שהפרופסור לשעבר שלו הוא סוכן ממשלתי שנרדף בגלל קובץ רגיש וסודי ביותר. צ'אק חוזר לאוניברסיטת סטנפורד, המוסד ממנו גורש. צ'אק מגלה כמה סודות מזעזעים בנוגע לחייו שלו ולומד…
כשצ'אק פוגש סוכן ממשלתי שמנהל חיים כפולים, מומחה לגדג'טים שמוחו הפך אותו לנכס ביטחוני לאומי ולנטל מסוכן – בדומה לצ'אק – הוא חייב להחליט אם להסגיר את הסוכן לשרה וקייסי…
צ'אק מתמודד עם הדילמה המוסרית הראשונה שלו כמרגל. כששרה וקייסי מסרבים לסייע במשימה לא מורשית של מרגל סיני בכיר המתרחשת בצ'יינה טאון, צ'אק ניצב בפני החלטה קשה -האם לצאת נגד…
צ'אק לוקח על עצמו משימה יוצאת דופן כאשר העמית הלוהט של שרה מהסי-איי-איי מבקש עזרה במשימה. צ'אק מתחיל להבין שהחיים הכפולים של שרה, שהיא טובה מאוד בניהולם, מקשים עליו להכיר…
צ'אק מגלה שלא יהיה קל לחיות שני חיים נפרדים. לאחר שהבוס שלו ב"באי מור" מאתגר אותו, צ'אק מגייס לעזרה את מורגן ואת עדר החנונים כדי להוכיח שהוא ראוי להיות עוזר…
צ'אק ממשיך להתמודד עם חייו החדשים כמרגל, והמתח גובר בין שותפיו שמונו לאחרונה, שרה וקייסי. כשרופא שנראה שיש לו פתרון לבעיה של צ'אק נהרג, קייסי ושרה מאשימים זה את זו….
כשצ'אק ברטאוסקי פותח מייל המקודד בצורה תת-הכרתית בסודות ממשלתיים, הוא מוריד בלא יודעין שרת שלם של נתונים רגישים למוחו ונזרק לקריירה חדשה כסוכן החשאי החיוני ביותר של הממשלה. כעת, גורל…
כאשר מדען מתאבד מסיבה לא ברורה, מאלדר וסקאלי חוקרים את האופציה כי כוח בלתי נראה דחף אותו לזה, וחושפים מעבדה שבה ניסויים גנטיים קיצוניים נמשכים כבר עשרות שנים.
הגאונים של צוות עקרב הופכים למטומטמים ונאלצים להסתמך על הסבריה המדעיים של פייג' כשכישוריהם נפגמים במהלך ניסיון למנוע ממאיץ חלקיקים ליצור חור שחור, בנוסף, הקשר בין פלורנס וסבסטיאן הולך ומתהדק.
חבורת מדענים ערכו ניסוי מסתורי שעירב חלקי גופות שרכשו בבית הקברות המקומי, ולאחר מכן החלו להירצח בזה אחר זה. כעת על האנק ועל וו לגלות במה המדענים עסקו ומה מוביל…
הצוות חוקר שרידים של שתי גופות שנמצאו באותה חלקת קבר, אחת של חולת סרטן השד והשנייה של מי שהדריכה אותה בתהליך האבל עם המחלה. בהשפעת המקרה, בות' וברנן דנים בבחירות…
ג'יין מגלה רמז חשוב לדרכי הפעולה של רד ג'ון, כאשר הוא פוגש ארבעה מהחשודים. בינתיים, החקירה המרכזית מתמודדת עם רצח מהנדס תוכנה על-ידי מתקפת מטוסים זעירים.