הגולשים מגיעים לעולם שבו מוח מוערך יותר מכוח, וקווין וארתורו מקבלים יחס של סלבריטאים! קווין מגלה שהכפיל שלו הוא אתלט בקולג' וחייב להשתתף במשחק אליפות, בזמן שהכפיל של ארתורו נשוי…

נורה ונייתן מגלים רמזים חשובים לחשיפת פריונד, אך החיפוש מהווה אתגר למערכת היחסים שלהם.

נייתן ונורה מאתרים את הרופא שהמציא את ההורדה בשעה שאלישה עולה בהיררכיה של הורייזן. אינגריד והגיבוי של נייתן מתקרבים זה לזה.

החבורה חוגגת את "יום הנחות סייבר" בשעה שנורה מגלה משהו שיכול לשנות את כללי המשחק: נייתן הועתק בלייקוויו.

נייתן ונורה מתקשים להביא להצלחת היחסים ביניהם, ואינגריד מנסה לנצל את ההזדמנות השנייה שלה לאהבה כמיטב יכולתה.

נורה ונייתן, שהורד לא מזמן, ממהרים לעצור את פריונד לפני שראשו של נייתן יתפוצץ.

נורה ואלישה רודפות אחר התעלומה אל העיר ניו יורק עם נייתן ולוק במסכים. אינגריד מקבלת אורחים בלתי צפויים.

נייתן ונורה ממהרים כדי לעצור התקדמות טכנולוגית שעלולה להיות מסוכנת. לוק עושה חרם על שינה כשהוא מגלה ש-"הורייזן" מרוויחה מחלומותיו, בזמן שאלישה ממשיכה לעלות בסולם ההיררכיה של "הוריזן". אינגריד מתפתה…

כשהם מתוסכלים מאי-הצדק ב-"לייקוויו", נייתן ולוק מחליטים לחלק מחדש חלק מההון בעזרתה הלא מכוונת של אינגריד. נורה נוטלת על עצמה משימה חשאית.

בסעודה שעסוקה בצורה כפייתית במעמדות, נייתן מתמודד עם רוחות מעברו. נורה מאמנת את מיומנויות התכנות שלה בעודה נכנסת אל אקטיביזם.

בפרק האחרון לעונה, זיכרונותיו המשוחזרים של נייתן ושינוי בתחושת הנאמנות, מציבים את נורה בסכנה פיזית.

אנשי ההעלאה מחכים לשיפורים במערכת ההפעלה החדשה של לייקוויו. נייתן ונורה נשארים ערים עד מאוחר כדי לשחזר את הזיכרונות החסרים של נייתן.

נייתן לוקח את אביה של נורה לסיור כדי להחליט אם עליו לבחור בהעלאה או למות, אבל העניינים משתבשים כשמתנגדי טכנולוגיה מחבלים בלייקוויו. נורה מבצעת עבודת בילוש במחשב של לוסי בזמן…

מצב מחלת הריאות של אביה של נורה מחמיר בעוד נייתן, חברו לוק ודילן, נער העלאה שגופו לא מתפתח בהתאם לגילו, מבקרים בשוק האקרים במרחב הווירטואלי.

נורה סבורה שאולי העריכה את נייתן לא כהלכה. נייתן והחברה שלו אינגריד מתראיינים על האתגרים של מערכת יחסים בין אדם חי לאיש העלאה.

נורה מנסה להעלות את הדירוג שלה כדי שהבוסית שלה תאשר הלוואה להעלאה של אבא שלה. נייתן מסתגל לעולם החדש בעזרת הפסיכולוג בלייקוויו.

בפרק האחרון לעונה, סקאלי ומאלדר ממהרים למצוא את ויליאם שנמצא במנוסה, בעוד איש הסיגריות ממשיך קדימה עם התוכנית האולטימטיבית שלו.

שתי נערות טוענות שתקפה אותן מפלצת. מאלדר וסקאלי מגיעים לבדוק את המקרה ומגלים כי החקירה שלהם עלולה להוביל חזרה אל הבן האבוד שלהם, ויליאם.

דיוויד דוכובני וג'יליאן אנדרסון חוזרים לתפקידם האייקוני כסוכני האף-בי-איי פוקס מאלדר ודיינה סקאלי ויוצאים לחפש אחר ויליאם, בנם המיוחד שנמסר לאימוץ. אך נדמה כי הם אינם היחידים.

אנשים ברחבי המדינה נופלים למשכב ופאניקה נרחבת מאיצה בסקאלי לנסות למצוא תרופה. בינתיים, מאלדר מתעמת עם האיש שהוא מאמין עומד מאחורי כל זה, אבל עוד דמות מעברם של מאלדר וסקאלי…

סקאלי ומאלדר מתחילים לחקור לאחר שגלריה לאמנות, המציגה יצירות אמנות פוגעניות מופצצת. הם מנסים למצוא דרך לתקשר עם העבריין הנמצא בתרדמת, בכדי לנסות למנוע מתקפה נוספת.

מיני סדרה הממשיכה אחרי 13 שנים את סדרת הקאלט "תיקים באפילה" ומאחדת מחדש את סוכני האף-בי-איי האייקונים מאלדר וסקאלי, החוקרים תעלומות מסתוריות בעולם הזה ובעולם "שמעבר"…