מייקל משיג מידע חדש על אנסון, בעוד סוכן אם-איי-6 מנסה למנוע את שחרורה של פיונה מהכלא, ומתנקש לוכד את סאם ואת בארי בבית חוף מבודד.

ג'ורדן חוקרת היעלמות אחותה של אישה שג'ורדן הייתה מעורבת בחקירת הרצח שלה, שמכוניתה נמצאת עם דם וקליע בתוכה, אך בלי גופה. וודי ונייג'ל חוקרים רצח של אישה נורמטיבית והם לא…

מרדוק ממשיך בתוכנית שלו להרוג את כל סוכני קרן פניקס, ומחליט לפעול דווקא ביום היחיד שג'ק לא מוכן לעבוד היות והוא מאמין שהיום הזה מביא מזל רע.

מקגייוור נאלץ להתחזות ליריב ותיק כדי לעצור ארגון טרור מסתורי מלבצע מתקפה גדולה ולומד על עצמו כמה דברים תוך כדי.

הצוות מוזעק לבית מלא בנחשים. מישל מקבלת מידע חדש לגבי אייריס. אואן מאמץ כלב חולה סרטן למורת רוחו של טי-קיי.

סעיד חוזר בדרך נס לחיים, אבל הבעיות שלו מתחילות רק עכשיו. סוייר נמלט וקייט וג'ין הולכות בעקבותיו. בלוס אנג'לס, קייט הנמלטת עוזרת לקלייר בזמן שהיא עומדת ללדת.

בן מזיז את האי וגורם לניצולים שנשארו על האי לקפוץ בזמן. בינתיים, שלוש שנים מאוחר יותר בלוס אנג'לס, בן מנסה לשכנע את שישיית אושיאניק לחזור לאי.

ג'ק, סעיד וקייט חוזרים סוף סוף אל האי, אך הם אינם לבדם, מה שמעורר חשש וחשד בקרב הניצולים. קלייר מפתחת מחלה לא ברורה, וסעיד וסוייר אינם בוטחים באשה שמציעה את…

הניצולים מנסים לחקור מה אירע לניקי ופאולו, שנראו כמתים. במקביל מתגלים פרטים מעברם של השניים, העשויים לספק הסבר לכך שבחרו לא להיחשף בפני יתר הניצולים.

חייו של בן נתונים בידי ג'ק. ג'ולייט, בצעד מפתיע, משתפת פעולה עם ג'ק, ונחשפת. במקביל, קייט וסוייר מבצעים עסקה עם בן ברית שמצאו בקרב "האחרים", בניסיונם להימלט מהאי.

שלושה מניצולי האי נופלים בשבי ה-"אחרים", המתגלים כמתוחכמים יותר מכפי שניתן להעלות על הדעת. בנוסף נחשפות בפרק זה שתי דמויות חדשות, המעניקות מימד חדש לסיפור.

בעקבות מחלתו של אהרון, קלייר נחושה לגלות מה עבר עליה בזמן ששהתה בשבי בידי "האחרים". ניסיונותיה מובילים לפלאשבקים לאירועים שחוותה. במקביל, מר אקו מגלה עניין בשבוי, ומבקש מג'ק ולוק לאפשר…

השמחה משובה של קלייר לאי נגמרת לאחר שהניצולים מבינים שהיא סובלת מאובדן זיכרון. אית'ן חוזר למחנה הניצולים ומציב דרישה לשאר הניצולים. הניצולים מחליטים להציב משמרות הגנה סביב המחנה.

לאחר שמגלים שאית'ן לא היה בין נוסעי המטוס, הניצולים בראשות ג'ק מחפשים אחר קלייר וצ'ארלי הנעדרים, מחשש לגורלם. לוק ובון מחפשים בג'ונגל ונתקלים בברזל מרובע על פני הקרקע.

קלייר חווה סיוטים בשנתה וחושדת שמישהו מנסה לפגוע בתינוקה. הארלי מכין רשימה של הניצולים ומשווה אותה לרשימת נוסעי המטוס המקורית, ומגלה שאחד הניצולים לא מופיע בה.

לאחר העינוי, סעיד יוצא לסיבוב סביב האי ונשבה בידי אישה מסתורית. הארלי בונה מסלול גולף כדי לעזור לשאר הניצולים להתמודד עם החוויה הטראומטית.

לאחר שאחד משומרי הראש המסורים של מטיף מקומי מת בעקבות עימות עם אחד המאמינים, ניק והאנק מחליטים לבחון את פעילותו של המטיף לעומק.

מדען, הנגוע בטפיל שואב אנרגיה, תוקף את ז'ון וקארה ויונק מהם את כוחותיהם. הגרדיאן נחלץ לעזרתם.

קתרין נקראת על ידי מפיק סרטים פורנוגרפיים כדי לראות צילומים גרפיים מסרט סנאף שבו אישה נטבחת באכזריות. הרמזים זעומים: הרוצח אינו נראה בבירור, חדר המלון הזול יכול להיות כמעט בכל…

ג'יין ופישר חוקרים רצח שהתרחש באתר של קידוח נפט. בינתיים, המצוד אחר חשודים בתקיפת חברי סי-בי-איי לשעבר מוביל את ריגסבי וואן פלט לאוסטין, טקסס.

ואן פלט נחטפת על-ידי רוצח הרודף אחר חברים לשעבר ב-סי-בי-איי, וג'יין מגייס את כל כישוריו כדי לנסות למצוא אותה לפני שיהיה מאוחר מדי.

גיין מגלה שרשימת חשודים מזויפת שהוא שתל נגנבה, והצוות חושש לחייהם של האנשים ששמותיהם היו ברשימה.

הצוות מנסה למצוא רוצח סדרתי, ואילו ג'יין פוגש בלוגר שהקדיש את חייו למציאת אותו רוצח.

אישה שנמצאה תלויה מתגלה ככפילה של לני, הרופאה המשפטית. כאשר נמצא קרבן נוסף הדומה מאוד לאחד מחברי הצוות, הראיות מתחילות להצביע על תיק מהעבר, טראומתי במיוחד בעבור כולם.

בעוד קית' מנסה להתאחד עם גרייס, האחות מארי מגלה שכח אפל פלש למוסד.

בפרק הפותח את העונה השנייה, הצוות מנסה לעזור למפקד בחיל הים שעובד עבור הפנטגון, אשר בתו העיוורת ואשתו נלקחו בנות ערובה על-ידי אדם הדורש כופר של 2 מיליון דולר.

לאחר ששלוש תאונות דרכים חשודות מאומתות כלא מה שהן נראות, הצוות מצטרף למצוד בשרווד, נבאדה, ללכידת הרוצח לפני שירצח מישהו שוב.

בנסון וטוטולה חוקרים מקרה רצח והתעללות של אסיר שנמצא מת זמן קצר לאחר שהגיע אל התא שלו.