ליקוי חמה נותן מעט תקווה לנשמותיהם של אנשי אמסטריס. הוהנהיים חושף את תוכניותיו, ואדוארד נלחם בפרייד בפעם האחרונה.

אבא מממש את תוכניתו ובולע את כל הנשמות באמסטריס. כעת הוא יכול לעבור דרך שער גן העדן ולהגיע לעין האלוהים.

אדוארד, אלפונס, הוהנהיים, איזומי ומוסטאנג ממתינים שגורלם יוכרע במאורה של אבא, והעתיד נראה עגום.

לינג משתמש במלוא הכוח של גריד כדי להשמיד את האויב בשער. הקבוצה של אדוארד מוצאת את הוהנהיים ונופלת למלכודת.

אבא מתכנן את הבריחה. בראדלי תוקף את מרכז הפיקוד של סנטרל ומתמודד מול יריבים חזקים.

קרב אחד מסתיים, ואחר מתחיל. הוהנהיים ואבא נלחמים על אבן החכמים – מי ינצח?

אדוארד מבין שאנבי מנסה להסית את חברי הקבוצה זה נגד זה. הקרב בין האחים ארמסטרונג לסלות' מגיע לנקודת תפנית.

השמועה על ההפיכה מסייעת למורדים. מיי מפתה את אנבי לתוך מלכודת שמובילה לעימות חזיתי עם מוסטאנג.

אבן החכמים נמצאת בידיו של אלפונס, והוא מתעמת ללא חת עם פרייד ועם קימבלי.

הצוות של אד ניצב מול עדר של בובות רעבתניות – יצורים מתועבים שמקושרים לנשמות של בני אדם.

במתקפה על הביצורים של סנטרל, מוסטאנג מוביל כוח שמורכב מכל מיני חיילים מהצפון, כולל כמה פנים אהובות מהעבר.

אביו של אל עוזר לו לבלום את פרייד בפעולה מדהימה.

מהשריון של אל בוקע קול מרושע. אד וגריד מוצאים את עצמם תחת מתקפה.

אזהרות שקטות נשמעות מכל עבר: היום המובטח קרב ובא.

האחים אלריק, שהקשר ביניהם עמוק יותר מקשר דם, חלקו זה עם זה רגעים של שמחה וגם של כאב. עכשיו, נראה שהחיבור המיסטי בין נשמותיהם עלול להיות קטלני.

חטיפתה של וינרי בידי סקאר נחשפת, וצריך לגבש תוכנית חילוץ. סופה קשה מתקרבת – סופה שרק אלפונס אלריק יכול לה.

צמד כימרות מאיים על סקאר, והאחים אלריק נחלצים במפתיע לעזרתו. בהמשך, הניסיון של וינרי להתעמת עם סקאר מסתיים באסון.

ההומונקולוס הראשון חושף את עצמו בפני הוקאיי ההמומה. קימבלי מציע הצעה לאדוארד, אבל תחילה עליו להסכים להפוך לרוצח המונים.

רייבן מנסה לדרדר את ארמסטרונג. בינתיים, אד ואל נאלצים להמתין בתאם. לפני שנים רבות, אביהם התמודד עם שבי, וכדי להימלט מהכאב, הוא נפרד לשלום.

מפגש סודי מאפשר למוסטאנג להצית שאיפות חדשות במכר ותיק – בעל ברית שיש לו חיילים. אד ואל פוגשים את המעריץ הגדול ביותר שלהם.

אדוארד שומע את הסיפור של הוקאיי על תקופה שבה חיילים נשלחו לבצע רצח עם. בד בבד, הזוועות משדה הקרב באישבל נחשפים.

טעות אחת קטנה של האחים, ויקיריהם יראו את נחת זרועו של בראדלי. מלבד זאת, ייתכן שאין צורך באבן החכמים.

שיתוף פעולה בין הכוחות המורדים של מוסטאנג לחבורתו של לינג יאו מוביל ללכידת הומונקולוס, אבל גם מושך את תשומת ליבו של מרגל הומונקולוס.

וינרי מגלה מה היה חלקו של סקאר במות הוריה ונתקפת רגשות רצחניים, בדיוק כמוהו.

אד ואל חושבים על תוכנית מסוכנת במטרה לפתות את ההומונקולוסים לצאת מהמחבוא. השלב הראשון: להסתכן בכך שסקאר, אויבם המסוכן ביותר, יהרוג אותם.

אפילו התומכים הנאמנים ביותר של אלכימאי הלהבה מזועזעים ממעשיו הבעייתיים כלפי מי שהואשם ברצח מייס היוז.

אנבי עדיין מסתתר מתחת לאף של האלכימאים הלאומיים, והומונקולוס נוסף עומד לחדור לשורותיהם.

קינג בראדלי מתעמת עם גריד ומוכיח שהוא יכול להיות יריב אכזר. אבל מי שיצליח להרוס את המגן הסופי יהיה חזק יותר מהפיהרר בכבודו ובעצמו.

המזימה סביב אבן החכמים מגיעה גם לדרגים הגבוהים ביותר בצבא. אחד מבעלי בריתו הנאמנים ביותר של מוסטנג נרצח.

אל זועם בגלל המחשבה שכל קיומו נוצר על ידי אחיו. רק וינרי תוכל להוכיח לו עד כמה הוא טועה.

אד ואל נלחמים בשומרים המופרעים של המעבדה החמישית. בתוך כל הכאוס שנוצר, האמת מאחורי אבן החכמים נקברת בהריסות.

האחים אלריק, שגילו מהו המרכיב הסודי והמחריד באבן החכמים, ממשיכים בחיפוש אחר האמת ומגיעים למעבדה סודית.

אדוארד ואלפונס מותקפים על ידי סקאר – מתנקש מסתורי בעל כוחות מדהימים, המבוקש בגין סדרת רציחות מחרידות.

המדע והאמונה מתנגשים כשהאחים אלריק מתעמתים עם האב קורנלו, וחושדים שהוא משתמש באבן החכמים לרעה כדי לשלוט בצאן מרעיתו.

הצצה לעבר חושפת את הכאב והייאוש שהובילו את האחים אלריק לשבור את הטאבו הגדול ביותר של האלכימיה: התמרה אנושית.

האחים אלריק משתתפים במצוד אחר "אייזק המקפיא", אלכימאי לאומי לשעבר שנחוש למוטט את שלטונו של פיהרר בראדלי.