זוג צעירים נרצחים ולצוות אין שום רמזים, עד שפונה אליהם בחור בשם גייבריאל שטוען שהוא מדיום, ושיש לו מידע לגבי הרצח. ג'יין לא מוכן לחזור לעבודה, אז מוצא נגדו צו…
פיטרסון מוצא במקסיקו את הקליע שאבוט ירה באיש הקרטל, ומתכוון לגרום לביטול המינוי של לינה. ג'יין ושאר חברי הצוות עושים ככל יכולתם כדי לסכל את תכניותיו, אבל מתברר שהוא ממש…
ג'ימי, אחיה הקטן של תרזה, מבוקש כעד לרצח של בנה של שופטת, אבל הוא נמלט ומוצא נגדו צו מעצר. תרזה וג'יין טסים לשיקגו כדי לחפש אותו, ומגלים שהוא שיחק פוקר…
סוכן די-אי-איי שפיקד על פשיטת סמים כושלת במסעדה נרצח, ואבוט מתבקש לחקור את הרצח. ג'יין מבין שיש בצוות בוגד שעובד עבור קרטל סמים, ומנהל חקירה סמויה כדי למצוא את הרוצח…
הצוות עורך תרגיל עם הצבא, וליסבון פוגשת שם אל"מ שהיא מכירה, שמשהו לגביו לא מוצא חן בעיני ג'יין. תרזה מספרת לג'יין שאשתו של האל"מ נרצחה לפני 8 חודשים, והוא מחליט…
הסי-איי-איי מבקש מג'יין להתחזות לבלדר של סוחר נשק בשם יאן נמק, הקשור לארגון טרור שמתכנן פיגוע בארה"ב. מתברר שאריקה פלין היא חברה שלו, והיא מוכנה לעזור לג'יין ללכוד אותו.
במהלך שוד יהלומים, נרצחים שני מאבטחים, והצוות מגיע לתערוכת יהלומים שבה נמכרו היהלומים הגנובים. ג'יין החולה אינו יכול להמשיך בחקירה. לינה מתקבלת לתפקיד בממשל, אבל היא צריכה לעבור הליך אישור.
מארי, חברה של גנב מכוניות, נעצרת, והסי-איי-איי מבקש את עזרת הצוות, משום שמתברר שיש לו קשרים לטרוריסטים בינלאומיים. ליסבון נשלחת לכלא כדי להתחזות לשותפתה לתא של מארי ולנסות לברר היכן…
לאחר שהתוודו על רגשותיהם, ג'יין וליסבון מנסים לשמור בסוד את מערכת היחסים שלהם. פישר עוזבת לסיאטל, ואת מקומה בצוות תופסת חוקרת חדשה ושאפתנית בשם מישל וגה.
חבר מושבעים בוחן את הרצח של רד ג'ון כדי להגיע להחלטה האם יש להעמיד לדין את ג'יין. ליסבון תוהה כיצד ג'יין יגיב אם היא תעשה רה-לוקיישן עם הסוכן פייק. צ'ו…
מפגש מקרי עם אדם חשוד מוביל את ג'יין וליסבון לחשוף רשת הברחות אנושית עצומה. בינתיים, ליסבון נשארת מפותה על ידי הצעתו של פייק לעבור לוושינגטון הבירה איתו.
ג'יין מצטרף לקהילה בדלנית על מנת לחקור את מותה של התובעת הכללית של ארה"ב שגופתה נמצאה במכסיקו, למרות שאין כל עדות לכך שהיא עברה את הגבול. בינתיים, ואן פלט וריגסבי…
ג'יין מגלה רמז חשוב לדרכי הפעולה של רד ג'ון, כאשר הוא פוגש ארבעה מהחשודים. בינתיים, החקירה המרכזית מתמודדת עם רצח מהנדס תוכנה על-ידי מתקפת מטוסים זעירים.
עונה שישית לדרמת המתח הממשיכה מנקודת הסיום הדרמטית של העונה הקודמת. לאחר הודעתו של רד ג'ון, כי הוא יודע על שבעת החשודים ברשימתו של ג'יין, ליסבון דוחקת בג'יין להמשיך בחקירה…