הצוות נוסע לקזחסטן כדי למנוע את מכירתו של טיל גרעיני על ידי ארגון פשע למרבה במחיר. סילבסטר נקרע בין הרצון לתמוך באהובתו החולה לבין תפקידו בצוות, ומחליט לנסות לרקוד על…
וולטר, קייב והפי מצטרפים לצוות של צוללת גרעינית סודית ביותר, כדי לפרוץ למכשיר ציתות שהוטמן בקרקעית האוקיינוס השקט. פייג', טובי וסילבסטר מסייעים להם מהיבשה בדרכים לא קונבנציונליות.
עונה שנייה לדרמת אקשן על חייו של מומחה המחשבים וולטר אובראיין והצוות המיוחד נגד איומים היי-טקיים מורכבים מסביב לעולם. בפתח העונה, לוויין רוסי בעלת עצמה גרעינית סוטה מהמסלול והצוות מתאחד…
הצוות נוסע לקובה כדי לסייע לפליטה, מרצח העם בבוסניה, לתפוס את פושע המלחמה שהרג את משפחתה. בזמן המשימה, וולטר מנסה להבין מתי ראוי לחשוב בהיגיון ומתי עדיף להסתמך על הרגש.
הצוות מנסה לרענן את זכרונו של סוכן פצוע, התקווה האחרונה שלהם למנוע ירי טילים להשמדה המונית. פייג' לא יודעת מה לעשות כאשר דרו מציע שיעברו למיין, לטובתו של ראלף.
צוות עקרב חייב לעזור לראלף כאשר האף-בי-איי חוקר אותו לאחר שמשחק האינטרנט הכהה שלו מגלה בטעות את מיקומו של בית בטוח של הסי-איי-איי ומסתיים ברצח סוכני הסי-איי-איי.
כאשר מטוס צבאי מופל בבוסניה, צוות עקרב חייב לעזור לאחזר טכנולוגית ההתגנבות שלו לפני שהוא נופל לידיים של אויב. בינתיים, אחותו של וולטר לוקחת הפסקה מהטיפול שלה בטרשת נפוצה ומבלה…
הצוות מנסה להגן על גרושתו של קייב, אחרי שהיא מגלה ראיות המרמזות על הזמנת רצח של חבר קונגרס. דרו, אבא של ראלף, רומז לוולטר שייתכן שיעזוב שוב את משפחתו או…
וולטר והצוות מקבלים עבודה פרטית בקזינו בלאס וגאס ומחליטים לנסוע לשם, חרף התנגדותו של קייב, כי הם עוד לא מוכנים לעבוד כעצמאיים. האם הם יוכיחו לו שהוא טועה?
המושל קורא לצוות עקרב כאשר בתו נדבקת באופן מסתורי בוירוס קטלני ונותרות לה רק 24 שעות לחיות. המקרה מקבל משמעות עמוקה יותר כשוולטר מקבל מכתב בעניין אחותו.