נארוטו מתחיל את סדרת האימונים שלו לקראת הבחינה השלישית בליווי אביסו, אך העניינים משתלשלים בצורה בלתי צפויה.

הקרב האחרון שנותר הוא צוג'י אקימיצ'י נגד דוסו קינותה. שלב המוקדמות של הבחינה השלישית מסתיים ונארוטו מגלה שסידרו לו מאמן חדש לקראת הבחינה השלישית.

לי חושף את הקלף המנצח שלו, פתיחת השער החמישי. גארה רוצה מעוניין בקרב עקוב מדם.

רוק לי ממשיך בקרב נגד גארה האכזרי. על אף שהוא מוחלש לאחר השימוש בלוטוס הראשי, הוא רוצה לנצח בכל מחיר. לי מתחיל לפתוח את שמונת השערים הפנימיים.

רוק לי בעל הרוח הצעירה משובץ להילחם נגד גארה של המדבר. גארה לא מגלה רחמים ומשחרר את כל עוצמתי הקטלנית.

הינאטה מחליטה להוכיח את עצמה ונלחמת בנג'י בכל כוחה. הקרב ביניהם מסתיים בתוצאה מפתיעה.

הקרב של נארוטו וקיבה מגיע לשיאו. נארוטו חושף טכניקה חדשה שפיתח.

נג'י היוגה והינאטה היוגה, קרובי המשפחה, משובצים להילחם אחד נגד השניה. הם מתחילים את הקרב ונלחמים כדי להגן על הכבוד של עצמם ושל המשפחות שלהם.

בחינת הצ'ונין השלישית נמשכת ומגיע תורן של טמארי וטנטן להילחם אחת בשניה. לאחר הקרב החד צדדי של שתיהן, שיקמארו נבחר להילחם בקין, הקונואיצ'ית מהכפר הנסתר בצלילים.

הקרב מלא הרגש בין סאקורה לאינו צובר תאוצה. החברות והקשיים של השתיים מתגלים.

הקרב של מיסומי צורוגי וקאנקורו מסתיים מהר. מיד לאחריו, שתי חברות ותיקות נקראות להילחם אחת בשניה.

קאקאשי מנסה לחתום את החותם המקולל אך אדם מסוים מפריע לו. במקביל, הקרב בין זאקו אבומי לשינו אבורמה מתחיל וכוחו המשונה של שינו נחשף.

סאסקה ממשיך בקרב שלו נגד יורו אקדו על אף הכאב הרב שהחותם המקולל גורם לו. לאחר הקרב, קאקאשי מחליט לעזור לסאסקה בעניין החותם המקולל.

צוות 7 הצליח להשיג את המגילה החסרה ועובר את הבחינה השניה. ההוקאגה מסביר לכל אלו שעברו את הבחינה מה המטרה האמיתית של בחינות הצ'ונין. האחראי על הבחינה השלישית מגיע, ובשורה…

נארוטו שוקל להציץ במגילה של הצוות שלו. צוות 7 פוגש בצוות של קאבוטו, ויחד הם מנסים למצוא את דרכם למגדל שבמרכז יער המוות.

לאחר שסאקורה כמעט מאבדת את חייה בניסיון להגן על הצוות שלה ועל לי, צוות 10 יוצא מהמחבוא שלו לעזרתה. במקביל, צ'אקרה מרושעת מתפתחת אצל אחד ממחוסרי ההכרה.

סאקורה עומדת בפני סיטואציה שהיא מעולם לא עמדה בה כאשר היא נותרת לבדה להילחם נגד השלישייה מכפר הצלילים. על אף הפחד והחרדה, היא נעזרת בנחישותה הגדולה ונלחמת חזרה.

סאקורה מנסה לשמור על נארוטו וסאסקה מחוסרי ההכרה אך מוצאת את עצמה מותקפת על ידי הגנינים מהכפר הנסתר בצלילים. אחד מהגנינים של כפר העלים מגיע לעזרתה, וקרב של שלושה על…

האם רוק לי יצליח להציל את סאקורה מהסכנה הממשמשת ובאה?

נארוטו, סאסקה וסאקורה ממשיכים את הקרב שלהם נגד האויב חסר הרחמים שפגשו ביער המוות.

לאחר שעברו בהצלחה, איכשהו, את המבחן הראשון, נארוטו והחבורה צריכים להתמודד עם סכנה חדשה! הגנינים נדרשים לחפש שתי מגילות שונות כדי שיוכלו להשלים את הבחינה בהצלחה.

פרק ספיישל שמסכם את 25 הפרקים הראשונים ומכין את הקרקע לקראת בחינת הצ'ונין השניה.

הגנינים מעתיקים אחד מהשני את התשובות למבחן, כל אחד בדרכו, בזמן שהדאגות מהשאלה העשירית מתחילות לצוף.

כל הגנינים מתרכזים ומתחילים את הבחינה בכתב, הלוא בחינת הצ'ונין הראשונה. אך הבחינה בעייתית, השאלות לא מותאמות לרמת הידע של הגנינים בכלל.

רוק לי המשונה מאתגר את סאסקה לקרב, ממש לפני תחילת בחינות הצ'ונין.

תשעת הטירונים של כפר העלים נפגשים במרכז הבחינה. הם מושכים את כל תשומת הלב אליהם. אדם אחר בעל ניסיון רב בבחינות הצ'ונין שעומד להיבחן איתם מנסה לעזור להם להוריד פרופיל…

לאחר ששלושת הנינג'ות עוזבים, סאסקה מבין שיש לו יריב עוצמתי. קאקאשי מודיע לצוות 7 שהוא המליץ עליהם לבחינות הצ'ונין. נארוטו וסאסקה מרוצים, אך סאקורה מפחדת לאכזב את כולם.

לאחר שהמשימה יוצאת הדופן שלהם הסתיימה, צוות 7 חוזר לבצע משימות פשוטות. קונוהאמארו וחבריו באים לבקר את נארוטו. בדרכם, הם פוגשים את סאקורה וסאסקה. ההוקאגה השלישי מכריז על תחילת בחינות…

זאבוזה הוא כבר לא האויב של קאקאשי, ובזכות מילותיו המרגשות של נארוטו, הוא פותח חזית מול אנשיו של גאטו. השד של הכפר הנסתר בערפל סוף סוף זוכה לנקום את נקמתו.

האקו אומר לנארוטו המהוסס לגמור אותו. נארוטו מטיל ספק בדרך החיים של האקו. במקביל, הקרב בין קאקאשי לזאבוזה מגיע לשיאו.

נארוטו מתפוצץ. כעסו כלפי האקו, שהביס את סאסקה, משחרר את הכוח של תשע הזנבות. הצ'אקרה של נארוטו נעשית כל כך עזה שאפילו קאקאשי וזאבוזה מבחינים בה.

האקו ממשיך לפגוע בנארוטו ובסאסקה בתוך מערך המראות, עד שנארוטו כבר לא מסוגל לעמוד על רגליו. לפתע, סאסקה מעורר כוח חדש ופועל בצורה חסרת תקדים.

סאסקה מצליח לעלות על דרך לפגוע בהאקו. קאקאשי מבין שזמנם קצר. מתוך דאגה לנארוטו, לסאסקה, לסאקורה ולטזונה הוא מחליט להשתמש בשארינגאן פעם נוספת כדי להביס את זאבוזה אחת ולתמיד.

סאסקה מתקשה מאוד בקרב נגד האקו בתוך מערך המראות שלו, אבל נארוטו מגיע לעזור לו. סאסקה חושב על תוכנית למתקפת נגד לג'וטסו המראות של האקו, אבל נארוטו הורס לו אותה.

הזמן להילחם בזאבוזה בפעם הנוספת הגיע, והפעם יש לו בן ברית. זאבוזה ובן בריתו מתפעלים מיכולותיו של סאסקה, וגם סאסקה מבחין בכמה חזק הנינג'ה שעוטה מסכה.

אישה מסתורית מופיעה מול נארוטו במהלך אימוניו הקשים לשליטה בצ'אקרה שלו. אישה זו אומרת לנארוטו שכל עוד יש לו מישהו אהוב שהוא רוצה להגן עליו, אין גבול לכמה שהוא יוכל…

בעודו מתאושש בביתו של טזונה, קאקאשי לא מרוצה מתוצאת הקרב. זאבוזה לא מת ונינג'ת המעקב הצעיר עזר לא לברוח. קאקאשי מחליט להכניס את נארוטו, סאסקה וסאקורה לסדרת אימונים שמטרתה לדעת…

סאקורה הולכת העירה יחד עם טזונה ורואה את הקשיים של אנשי ארץ הגלים תחת שלטונו של גאטו. בעקבות כך, היא מבינה מדוע בניית הגשר כל כך חשובה. במקביל, נארוטו וסאסקה…

תודות לתוכנית המבריקה של נארוטו, קאקאשי שוחרר כלא המים, והוא מוכן להשתמש בשארינגאן שלו כדי להביס את זאבוזה.

ידו של קאקאשי בקרב נגד זאבוזה על העליונה, אבל הקלפים נטרפים מחדש כאשר הוא נתפס במלכודת של זאבוזה. קאקאשי מפציר בצוות לברוח, אבל נארוטו נזכר בשבועה שנשבע.