כשהצוות מנסה לפענח רצח של חייל נחתים, החקירה מובילה אותם לחשוף רשת של מצלמות נסתרות במלונית בווירג'יניה. בינתיים גיבס מבקש מאנשים בצוות בקשות מוזרות, וטורס מגלה מידע חדש על החברה…

אסיר משוחרר מוצא את מותו זמן קצר לאחר השחרור. הצוות יוצא לחקור את הרצח, ומגלה שאחד החשודים ברצח קשור לאחד מחברי הצוות.

הצוות חוקר רצח מסתורי לאחר שרב"טית בחיל הנחתים מתעוררת מהשינה ומוצאת אקדח מגואל בדם במקרר שלה.

הצוות מקשר זירת פשע מוזרה בבית העלמין הלאומי ארלינגטון לשורה של התקפות על יוצאי צבא חסרי בית. וואנס פוקד על מקגי, בישופ וטורס, ובמקביל נאלץ להשלים את השעות בסידור מרתף…

לאחר שגופה מתגלה כשהיא דחוסה מתחת למשאית הובלות, הצוות יוצא לחקור תושבים של פארק קרוואנים.

תפנית בחקירת האיום על גיבס וזיווה לאחר פיגועים בוושינגטון. זיווה לא חושפת את כל מהלכיה ומעוררת חשדות בקרב הצוות.

זיווה חוזרת ומזהירה את גיבס שחייו בסכנה, והם נאלצים לצאת במצוד אחר מי שרוצה במותם. במקביל, הידיעה שזיווה בחיים משפיעה על צוות החקירה וגורמת לחילוקי דעות.

פרק סיום העונה. בתו של פורנל מאושפזת בגלל מנת יתר והוא דורש מגיבס לעשות הכול לתפיסת סוחר הסמים. החקירה גורמת לגיבס להתמודד עם השדים שלו.

הצוות חוקר רצח של גיבור מלחמה. גיבס עובר משבר אישי בעקבות חשיפת הסוד הגדול שלו.

הצוות מגלה שחשבון הבנק סודי של מזכיר ההגנה מממן חיסולים של רוצחים שחמקו מעונש, ומנסה לגלות מי משתמש בחשבון.

קייסי מפענחת תיק רצח בן 30 שנה, אבל פרט טכני משבש הכול. מקגי מבקר בחברת הייטק גדולה שמציעה לו משרה בשכר גבוה מאוד.

הצוות חוקר רצח של קצינה שנהרגה לכאורה בהתקפת הטרור של ה-11 בספטמבר בפנטגון לאחר ששרידיה מתגלים באתר בנייה.

הצוות מנהל מצוד אחרי יורה אלמוני שביצע ירי המוני בבית חולים של חיל הים.

טורס מתעורר בסירת דיג נטושה ואינו זוכר דבר והצוות עוזר לו לשחזר את אירועי הלילה הקודם.

גיבס ובישופ חוקרים מקרה מוות בצוללת בדיוק בזמן שהיא מקבלת פקודה לצאת למשימה מסוכנת ולנתק קשר עם העולם החיצון.

ג'ימי נקרע בין נאמנות לעבודה לנאמנות למשפחה כאשר חותנו מבקש ממנו לחבל בראיות.

כשהמשחתת יואינג חוצה את קו המשווה אחד המלחים מתגלה מת בים ליד המשחתת. האם הוא נרצח בנשק מימי הביניים? הסוכן טורס נאלץ לחנוך שלושה בני נוער ומתקשה לשלוט בהם.

מקגי נאלץ לחזור לתיכון שלו לאחר שמתגלה שסיסמת המחשב שלו מנעוריו קשורה לרצח של עובד במחלקת ההגנה.

חבר ותיק של המשפחה מפציר בגיבס להצטרף אליו לטיול לחפש את צמיד הזיהוי הצבאי החסר.

לאחר שילדה קטנה המתחבאת במחסן מתגלה, הצוות פותח מחדש תיק נעדרת ישן, שלסוכנת המיוחדת זיווה דויד היה עניין אישי בו.

הצוות מגלה גופת גבר אלמוני בכנס רפואי, ונתיחה שלאחר המוות מעלה את המסקנה שהוא מת עקב שאיפת גז כלור, נשק כימי מסוכן.

הצוות משהה את תוכניותיו לחג המולד לאחר שבחקירת רצח של יוצא חיל הים מתגלה תינוק ללא אמצעי זיהוי.

הצוות חוזר לשוד שבוצע שלוש שנים קודם, לאחר שאחת ממבצעות הפשע משתחררת מבית הכלא והצוות מנסה לגלות מי היה השותף שלה.

הצוות חוקר מקרה רצח של גבר שמתגלה בביצה, ומתברר שהיה בקשר עם נחתת ששירתה באפגניסטן והתעלומה מסתבכת.

ציור קיר של אמן רחוב שנגנב מבנק של הצי מוביל את הצוות לחקור רצח וקנוניה אפשרית.

הצוות חוקר מקרה רצח כפול ומסתורי בליל כל הקדושים, ומהר מאוד מתגלה שאחד מהנרצחים הוא מכר של טורס מתקופת ההכשרה בבולשת.

החופשה של גיבס ביער נקטעת אחרי שפורנל וברוקס מחליטים לבוא לבקר והצוות מיידע אותו על חשוד שמסתובב בקרבת מקום.

הצוות חוקר מקרה רצח שאירע במלחמת וייטנאם לאחר שמתגלות ראיות חדשות המצביעות על כך שמדובר דווקא בהתאבדות ולא ברצח.

הצוות חוקר פיצוץ שאירע ליד ביתו של סמל ראשון מחיל הים ואשתו, כוכבת ריאליטי מפורסמת. המנהל ואנס מתקשה לחזור לעבודה.

שכניו המוזרים של סגן מחיל הים שנרצח הם החשודים העיקריים בחקירת הירצחו. טורס ופאלמר יוצאים לבלות ומסתבכים.

הצוות חוזר לעונה 16, כשואנס עדיין נעדר וגיבס ממונה לתפקיד המנהל בפועל בזמן שהצוות מחפש אחר ואנס.

סלואן תוקפת אדם במסעדה ללא סיבה נראית לעין וטוענת בפני ואנס שמדובר במנהיג הלוחמים שעינו אותה ואת חבריה כשנפלה בשבי באפגניסטן.

חבר קרוב של גיבס, סרן בחיל הים, נחשב מת בתאונת הפלגה. כשגיבס מגלה שחברו בעצם חי ושהתאונה הייתה ניסיון התנקשות, חברי הצוות פותחים בחקירה ומנסים לברר מי ניסה להרוג את…

חברי הצוות מנסים להתמודד עם אובדן ריבס ועם החשש לחייה של אבי. הם משקיעים את מירב מאמציהם בניסיון לאתר את היורה ולהבין את המניעים לירי.

שריף מחוזי שמשנע אסיר מחיל הים רודף אחרי נהג שיכור ומפיל את הניידת לאגם בקרבת הכביש. האסיר נעלם, והעדה המרכזית והמהימנה ביותר עיוורת.

חיילת ותיקה דורשת מחוקרי אן-סי-איי-אס להחליף את המשטרה המדינית בחקירת רצח אמה, חיילת ותיקה אף היא, שנרצחה בביתה כשנה קודם לכן, אך רוצחה לא נמצא מעולם.

שני חברי כנופיה מאמריקה הדרומית נמצאים מתים, וברשות אחד מהם תעודת זהות צבאית מזויפת. החקירה מובילה את הצוות אל פליטה יתומה מאל סלוודור, שסומנה על ידי הכנופיה כיעד לחיסול.

טכנאי מזגנים שעבד על גג מטה אן-סי-איי-אס מת בפיצוץ מסתורי. הסוכנים מתחילים לחקור את מותו, אך תוך זמן קצר מוצאים את עצמם במצור בתוך המבנה בנסיבות מסתוריות.

דאקי רואה בתוכנית עתיקות חפץ שנראה לו כמו כלי רצח מחקירה מלפני 16 שנים, שמעולם לא נמצא. החקירה נפתחת מחדש, והסוכנים מנסים לאתר את החפץ העתיק ואת הרוצח שהשתמש בו.

חייל שמוצב בחו"ל מורעל באמצעות עוגיות שקיבל בחבילת סיוע, שנשלחה אליו מחייל ותיק הסובל מהפרעת דחק. הראיות מורות על החייל, אך סלואן וצוות החקירה אינם משוכנעים שהוא הרוצח.