מפקדת הסטארגייט מספקת מקלט עבור אביה המנוכר של ואלה, נוכל ערמומי בעל שם עולמי, לאחר שזה מספק מידע על מזימה של ג'אפה לתקוף את כדור-הארץ.

ס"ג-1 מבינים שהם עברו דרך השער למוזיאון של כוכב לכת אחר – אך בטעות מזוהים כמורדים קנאים שלקחו בני ערובה, כעת עליהם לשתף פעולה עם הסיפור כדי להישאר בחיים.

כאשר הברית הלוסיאנית מציבה פרס על ראשיהם של חברי ס"ג-1, קמרון מיטשל מוצא את עצמו כמטרה בעת השתתפותו בכנס מחזור בבית הספר התיכון.

ס"ג-1 מנסים להגן על כוכב לכת זר מפני האוריי באמצעות הסתרת אנשים במימד אחר, בעוד ואלה מנסה לשכנע את בעלה טומין במניעיהם האמיתיים של האוריי.

כשהיא מבוהלת עם שכחה ובמנוסה, ואלה לוקחת עבודה כמלצרית כשהיא מנסה לחבר את חלקי הפאזל בנסיון להיזכר מי היא ומה קרה לה.

קרטר מצליחה להפעיל את אחד מהמתקנים שמצאו ומוצאת את עצמם לכודה עם מיטשל בפאזה אחרת. בינתיים מגיעה קריאה בהולה לעזרה מצד הסודאן, שנפלו קורבן להתקפה של הכוהנים.

הצוות יוצא להתחקות אחר מקורו של זן תירס שממכר מאוד. מיטשל נכשל בנסיונו להתחזות לסוחר סמים ולקנות יבול של הצמח המסוכן והצוות נופל בשבי מגדלי הצמח.

אחת מחברות מועצת הג'אפה משנה פתאום את הצבעתה בהכרעה – האם אומת הג'אפה צריכה לקבל על עצמה את דת האוריי, והיא לא היחידה. מי השפיע על חברי המועצה לשנות את…

בגלל תקלה במערכת השערים, צוותי ס"ג-1 מכל היקומים המקבילים נוהרים לפיקוד. גנרל לנדרי ואנשיו צריכים למצוא פתרון לתקלה, להחזיר כל צוות ליקום שלו ולהתמודד עם צוות בעל תוכנית נסתרת.

תקלה במערכת השערים גורמת לצוות לצאת ולברר את מקור התקלה ומוצא אדם שקוע בתרדמת. כאשר מעירים אותו מתגלה שהוא צאצא גנטי של אנוביס, שמתקרב לשלב ההתעלות וכוונותיו זדוניות באותה מידה.

הצוות נתקל בסודאן – קבוצת ג'אפה שעל-פי האגדות מעולם לא היו משועבדים לגאולד ונאלץ להתעמת. מיטצ'ל נדרש להילחם בדו-קרב כדי לכפר על הרג אחד מהג'אפה, ואינו יודע שאותו ג'אפה לא…

לאחר שציר הזמן השתנה בגלל פעולותיהם של ס"ג-1 בעבר הרחוק, גירסה חלופית של ס"ג-1 חייבת להשתמש במכונת הזמן שהתגלתה לאחרונה כדי להסדיר את רצף הזמן.

ס"ג-1 נוסעים אחורה בזמן בנסיון נועז לגנוב מכשיר טכנולוגי עתיק מידיו של רע, הגאולד רב-העוצמה ששלט במצרים העתיקה.

קרטר וג'ייקוב נעזרים בבעל במלחמתם במשכפלים ואילו דניאל וקרטר המשוכפלת מנהלים מאבק מוחות עיקש, אוניל מתאם בין כל החזיתות ומרכז את הגנת הפיקוד כשברקע מרחף האיום הגדול מכולם – אנוביס.

המשכפלים מתחילים התקפה שיטתית על הגאולד, מה שמאלץ את בעל לבוא לכדור הארץ לעזרה. מחתרת הג'אפה מסכנת את כל תנועתם בניסיון לתבוע בחזרה עיר קדושה מידיו של בעל.

לכוכב הלכת שאליו הוגלה הארי מייבורן נשקפת סכנת נפילה בידי הגאולד והצוות נדרש לצאת לחלצו. בהגיעם לשם, הם מגלים שהתושבים הפרימיטיביים יחסית הפכו את מייבורן למלכם.

השער נגנב מתחת לאפם של השומרים והצוות יוצא בעקבות הגנבים. אנשי "הנאמנות" מבקשים להשתמש בשער כדי להפיץ את הרעל הקטלני לגאולד. אוניל נדרש לקבל החלטה קשה.

טיאלק הופך לחשוד הראשי בחקירת רצח אחרי שהוא עובר לדירה מחוץ לבסיס. קרטר שוקלת את עתידה עם פיט לאחר הצעת הנישואין שלו.

התקפה על אתר אלפא מערערת את היסודות. בעוד קרטר נאלצת להימלט מאחד מחיילי-העל של אנוביס ולהילחם על חייה, חקירתם של ג'ייקוב והאמונד מביאה אותם לגילויים מטרידים.

אוניל מבקש עזרה מחבר וותיק כדי להציל את דניאל וד"ר לי שנחטפו במרכז אמריקה. קרטר, טיאלק וג'ייקוב מסתננים למתקן חיילי-העל של אנוביס.

הצוות פוגש צוות של נשות ג'אפה האורבות לגברים בני מינן כדי לקחת מהם את השיתופנים. טיאלק מוצא את עצמו בעימות עם מנהיגתם כאשר הוא מנסה להראות לה כי יש דרך…

הצוות חוקר חייל אויב חדש ובלתי ניתן לעצירה שנשלח ע"י אנוביס. ד"ר ג'קסון מוביל צוות בחיפוש אחר מכשיר חוצני במרכז אמריקה, אבל מקבל יותר ממה שהוא רוצה.

כאשר קבוצת כורים ממפקדת הסטארגייט נלכדת בידי אונאס, ג'קסון פונה אל צ'אקה. על שניהם מוטלת המשימה הלא קלה של משא ומתן על חיי הכורים והמשך כריית הנאקוודה שבכוכב.

בעת חקירתה של ספינת חייזרים נטושה, חברי צוות ס"ג-1 מאבדים את ההכרה. כאשר הם מתעוררים, הם מגלים כי גופו של דניאל ג'קסון נחטף בידי תודעת חייזרים והם לא מוכנים לוותר…

בנו של טיאלק, רייאק ומורו ברייטאק נשבו בידי הג'אפה. טיאלק מחליט להצילם ונשבה אף הוא. צוות ס"ג-1 הולכים להצילו.

נער מתבגר מופיע במפקדת הסטארגייט בטענה שהוא ג'ק אוניל ושלח את הצוות למשימה לחשוף את זהותו האמיתית.

פרומתאוס נאלצת לנחות על עולם זר, שם הסטארגייט המקומי הוא הסיכוי היחיד של הקבוצה לחזור הביתה – אם כי האוכלוסייה המקומית מאמינה שהשער הוא רק מיתוס.

ס"ג-1 מנסים להציל את תושביו של כוכב עני מניסוי גנטי של נירטי, אבל מוצאים את עצמם כקורבנות הבאים שלה.

קולונל אוניל מואשם ברצח הסנטור קינסי, ושאר חברי הצוות חייבים לחשוף קונספירציה כדי לנקות את שמו.

המתחים עולים בין הטוקרה למורדים בקרב הג'אפה, כאשר הם נמצאים תחת התקפה של אויב בלתי נראה.

אנשיו של ג'ונאס מבקשים מכדור-הארץ עזרה צבאית במלחמה עתידית עם מדינות יריבות, אך מורהו לשעבר של ג'ונאס מציע פתרון חלופי: תנועת התנגדות המוכנה להפיכה מדינית.

קרטר, טיאלק וג'ונאס חוקרים את מותו של מדען בעל קשרים עם הגאולד, ומוצאים עיירה קטנה שאזרחיה מחזיקים בסוד אפל. הכל מסתבך כשהם מגלים שגם סוכנות הביון מודעת למתרחש.

ס"ג-1 עולים על סיפונה של ספינת אם נטושה של הגאולד לאחר שזו מגיעה באופן מסתורי למסלול סביב כדור-הארץ, כעת עליהם להימלט מהחללית בעודה מתרסקת לתוך האוקיינוס.

ס"ג-1 חייבים לפנות לזוג פושעים שהורשעו בעון גניבות שבוצעו בשם כדה"א ובחסות סוכנות הביון, כדי להציל את עולמם מן ההשמדה על ידי גאולד, לאחר שאלו גנבו את האמצעי היחיד שהגן…

מנהיג כריזמטי בקרב הג'אפה מציג עצמו כמורד מצבאו של אימהוטפ ומבקש לכרות ברית בין כדור-הארץ לבין חסידיו המורדים, וזוכה בנאמנותם של טיאלק וברייטאק.

ספינה זרה מתקרבת לכדור הארץ ששולחת את ס"ג-1 לחבר וותיק שבידיו כמה תשובות – שם הם מגלים כי מרטין לויד יצר תוכנית טלוויזיה על תוכנית הסטארגייט.

ס"ג-1 פוגשים בבעלי ברית חדשים, בעלי טכנולוגיה ומתקדמים ששותפים למלחמתם נגד הגאולד – אם כי הם לא מכירים את סודם האפל של אסשן ומניעיהם.

ס"ג-1 חוברים ליחידה רוסית כאשר אחד מצוותי הסטארגייט שלהם נעלם במקדש חוצני מסתורי. כשהם מגיעים לשם הם מגלים את הסיבה להיעלמות הצוות וכמו כן, את המניע של הרוסים למשימה.

קסנדרה נופלת למשכב, מה ששולח את ס"ג-1 בחזרה לכוכב הבית שלה – שם הם חושפים סוד גאולד אפל הנוגע לטקסים שעוברים בני נוער ועדויות לקשר עם הגאולד נירטי.

אוניל וסגן טיילר מאוימים על ידי כוחות גאולד ונלכדים מאחורי קווי האויב – אלא כשטיאלק, ג'קסון וקרטר חוזרים לכדה"א כדי לבקש סיוע, הם מגלים שבמפקדת הסטארגייט לא יודעים כלל מי…