חבורת מורדים סיילונים מחזיקה את הנשיאה רוזלין בשבי בניסיון לפתות את החמישה האחרונים למצאת ממחבואם על ה"גלקטיקה".

בחיפוש אחר מרכז ההחייאות של האויב, צוות טייסי "וייפר"ומורדים סיילונים משתפים פעולה בחוסר נוחות ויוצרים תוכנית קרב.

חטיפתה של הנשיאה רוזלין בידי הסיילון ההיברידי גורמת למאבקי כוחות בקרב צי המתיישבים.

מנהיגותה של הנשיאה רוזלין עומדת במבחן כשה"גלקטיקה" חוברת למורדים הסיילונים במטרה להשמיד את מרכז ההחייאות של האויב.

בריתות בלתי צפויות נוצרות לאחר שהחיפוש אחר כדור הארץ מקבל תפנית מפתיעה.

חיפוש כדור הארץ יוצר מתח על סיפון ה"דמטריוס" עבור קארה ואנשי הצוות שלה.

אמונותיו של באלטר יוצרות שערורייה עבור אלו הנאמנים ל-12 האדונים של קובול, וסופו של חבר לצוות מעכיר את האווירה בקרב המתיישבים.

כשקארה טרייס מטיסה ספינת תובלה יחידה בחיפושה הנואש אחר כדור הארץ, מזימות פוליטיות וסכסוך בין זוג נשוי על סיפון ה"גלקטיקה" מתרחשים במקביל ליצירת חורים עמוקים הנפערים בשורות הסיילונים.

סכסוך ניצת בקרב הסיילונים בעוד הם מתעמתים עם התעלומה של חמשת האחרונים, וקארה טרייס נדחקת מעבר לקצה כשחבריה ואנשי הצוות שלה לשעבר מסרבים להאמין שהיא היתה בכדור הארץ.

הקו הדק שמפריד בין האנושות לבין הסיילונים המתפתחים במהירות משורטט מחדש כאשר סטארבק שבה לחיים וטוענת שהיא מצאה את כדור הארץ.

חג המולד מגיע, וג'ק נוסע לבקר את אמו לפני החג כדי לבלות את החג במקום אחר. כשהוא פוגע בה ברכבו, הוא נתקע איתה בדירתו ויוצא מדעתו. בינתיים ליז משתתפת בתוכנית…

למון מוזמנת לפגישת מחזור של התיכון שלה, אך לא מתכוננת ללכת. ג'ק דוחף אותה לנסוע ואף מציע לה טרמפ. קנת מספר בדיחות במעלית ומצחיק את כולם, וג'ורדן מרגיש שהוא גונב…

מיליונר אקצנטרי מזמין את ג'ק וליז לארוחת ערב בביתו, ואז מזמין את ליז שוב, וג'ק מעודד אותה ללכת ואף עושה עסקים עם האיש. בינתיים באולפן טרייסי חושש שילדיו רוצים לרצוח…

שותפה לשעבר של ליז וג'נה מגיעה לביקור, היא מטורפת וליז מזהירה את ג'ק לא לצאת איתה, אך הוא לא עומד בפיתוי ומשלם על זה. בינתיים טרייסי מנסה לפצות את קנת'…

כשקנת מגלה שגק זייף ענפים באולימפידה וניצחונות של אמריקה כדי להרים את המוראל, הוא מתאכזב מג'ק. ג'נה וטרייסי מנסים להוכיח בעזרת ניסוי מה קשה יותר להיות: אישה לבנה או גבר…

העונה ה-3 פותחת בניסיון חזרתו של ג'ק דונגי לניהול הרשת אחרי שהשתעמם בוושינגטון, ליז מנסה לאמץ תינוק וטרייסי מחליט לגמול לכל מי שעזר לו בפיתוח משחק המחשב.

בפרק האחרון לעונה, ג'ק מתחיל לעבוד בממשל בוושינגטון ומגלה שהדברים שונים מאוד ממה שהוא חשב. בינתיים בניו יורק ליז מגלה שהיא בהיריון מדאפי ומנסה להשיג את ג'ק כדי לדבר אתו…

פלויד מגיע לביקור בעיר ומבקש מליז לישון בדירה שלה כי הטיסה שלו מתעכבת. ליז מתלבטת איך להתמודד עם זה. לאחר ההשתלטות של בנקס על החברה ותרדמת הסוכרת של דון גייס,…

דון גייס פוגש את ג'ק ומבשר לו שהחליט לבחור בו ליורשו, אך שלא יספר לאיש עד הישיבה במועצת המנהלים. בינתיים טרייסי מגלה שבנו מתבייש בו ומחליט לעשות משהו שיהיה מורשת…

ג'ק מבקש מליז להזמין את "גיבור היום" שהציל אדם ממוות ברכבת התחתית לתוכנית, וליז מגלה לזוועת לבה שמדובר בחבר שלה לשעבר, דניס דאפי. במקביל ג'ק מנסה למצוא ידוען שיבוא לתמוך…