בפרק האחרון לעונה, ג'ימי פותח דף חלק בכל הקשור למוניטין שלו. לאלו מאתר קצוות פתוחים במבצע של גאס. מייק נאלץ לקבל החלטה קשה.

ג'ימי וקים פורקים כל עול ומעמידים את מערכת היחסים שלהם בסכנה. נאצ'ו נאלץ לעשות את הסיבוב כם לאלו. למייק יש סיבה לדאגה.

סול רוקם מזימה כדי לחלץ את יוהל מעונש מאסר, ומייק מאפשר לצוות הגרמני לשחרר קצת קיטור.

ג'ימי מרחיב את העסקים, אבל נתקל בבעיה שרק קים יכולה לפתור. גאס מתערב בטיפול הרפואי של הקטור.

בשעה שג'ימי חולם לפתוח מחדש משרד עם קים, קים חושבת על רעיון שיכול להבטיח את עתידה. מייק מנהל פרויקט עבור גוסטאבו.

ג'ימי מוצא דרך חדשה להרוויח כסף, מייק בוחן שותפים פוטנציאליים וקים מייצגת לקוחות חדשים.

ג'ימי מתחיל לעבוד בעבודה חדשה, מייק שורף גשרים ונאצ'ו מנסה לשרוד במצב החדש שנקלע אליו.

ג'ימי מוציא לפועל את תוכנית החלפת הבריתות המסוכנת. נאצ'ו מוצא את עצמו על הכוונת, וקים בוחנת את עתידה.

ג'ימי מחפש עבודה, וגוסטאבו מנסה להשתלט על הבלגן שנוצר בעקבות האשפוז של הקטור.

לאחר האירועים הדרמטיים, ג'ימי נכנס יותר ויותר לעולם הפשע, דבר שמסכן את עתידו כעורך דין ומציב את יחסיו עם קים בסכנה.

בפרק האחרון לעונה, סקאלי ומאלדר ממהרים למצוא את ויליאם שנמצא במנוסה, בעוד איש הסיגריות ממשיך קדימה עם התוכנית האולטימטיבית שלו.

מאלדר וסקאלי חוקרים רצח משולש שגורם להם לחשוד שמדובר בסחר באיברי אדם. החקירה מובילה אותם לחיפוש אחר צעירה נעדרת שהצטרפה לכת מוזרה שחבריה מאמינים בחיי נצח, וכל זה יוצר עימות…

בעיירה קטנה בקונטיקט מתגלה גופתו של בנו של שוטר. במשטרה המקומית בטוחים שטרפה אותו חיה, סקאלי בטוחה שרצח אותו פדופיל מקומי, ומאלדר בטוח שמדובר בכישוף, עד מהרה העניינים יוצאים לגמרי…

מאלדר וסקאלי נעזרים בשירותים ממוחשבים לכל דבר אפשרי ותלויים בהם כמעט באופן מוחלט, אבל לפתע מתחילות להתרחש תקלות בשירותים הממוחשבים והם מתחילים לתקוף אותם.

סקינר יורד למחתרת לאחר שהעבר שלו חוזר לרדוף אותו. כאשר מאלדר וסקאלי מנסים לאתר אותו, חוסר האמון הגובר שלהם בו מגיע לשיא חדש.

שתי נערות טוענות שתקפה אותן מפלצת. מאלדר וסקאלי מגיעים לבדוק את המקרה ומגלים כי החקירה שלהם עלולה להוביל חזרה אל הבן האבוד שלהם, ויליאם.

אדם מסתורי בשם רג'י נפגש עם מאלדר וסקאלי, וטוען שגורמים עלומים בממשל גורמים לאנשים לשכוח פרטים מסוימים מעברם וכך הם משתלטים על העתיד, וגורם לשניהם לפקפק בזכרונותיהם.